GenBank-Updates@genbank.bio.net (08/30/90)
LOCUS MHV2BTIB 3299 bp ss-RNA VRL 30-AUG-1990 DEFINITION Murine hepatitis virus autoproteolytic cleavage domain. ACCESSION M28352 KEYWORDS autoproteolytic cleavage. SOURCE Murine hepatitis virus (strain JHM) cDNA to viral RNA. ORGANISM Murine hepatitis virus Viridae; ss-RNA enveloped viruses; Positive strand RNA virus; Coronaviridae. REFERENCE 1 (bases 1 to 3299) AUTHORS Baker,S.C., Shieh,C.-K., Soe,L.H., Chang,M.-F., Vannier,D.M. and Lai,M.M.C. TITLE identification of a domain required for autoproteolytic cleavage of murine coronavirus gene a polyprotein JOURNAL J. Virol. 63, 3693-3699 (1989) STANDARD full staff_entry COMMENT Draft entry and computer-readable copy of sequence [1] kindly provided by M.C.Lai. FEATURES from to/span description pept < 1 > 3299 long open reading frame (AA at 3) BASE COUNT 810 a 570 c 870 g 1049 t ORIGIN 1 cattgatggt taactttagc cgagaggtag ttgacatgtg tatggacatg gctttattgt 61 tcatgcatga tgttaaagtg gccactaagt atgttaagaa ggttactggc aaagtagcag 121 tgcgctttaa agcgttaggc attgctgttg tcagaaaaat tactgaatgg tttgacttag 181 ccgtggacac tgctgctagt gccgctggat ggctttgcta ccagctggta aatggcttat 241 ttgcagtagc caatggtgtt ataaccttta tacaggaggt gcctaactat caagaattta 301 ttaacaatca gcatttcaat tcacacctgc atccgcctga gcttgtcaag aattttgttg 361 acaagttcaa gacatttttc aaggtcttga tcgactctat gtcggtctct atcttgtctg 421 gacttactgt tgtcaagact gcctcaaata gggtatgtct tgctggcagt aaggtttatg 481 aagttgtgca gaaatctctg cctgcatata ttatgcctgt gggttgcagc gaagccactt 541 gtttggtggg tgagattgaa cctgcagtct ttgaagatga tgttgttgat gtggttaaag 601 ccccgttaac atatcaaggc tgttgtaagc caccctcttc tttcgagaag atttgtattg 661 tggataaatt atatatggcc aagtgtggtg atcaattcta ccctgtggtg gttgataacg 721 acactgttgg cgtgttagat cagtgctgga ggttcccctg cgcgggcaag aaagtcgtgt 781 ttaacgacaa gcctaaagtt aaggaggtac cctccacgcg gaagattaag attatcttcg 841 ctctggatgc gacctttgat agtgttctct cgaaggcatg ttcagagttt gaagttgata 901 aagatgttac attggatgag ctgcttgatg ttgtgcttga cgcagttgag agtacgctca 961 gcccttgtaa ggagcatggt gtgataggca caaaagtttg tgctctactt aaaggttggt 1021 ggacgattat gtctatcttt ttgatgaagg aggcgaagaa gttattgccc tcccgtatgt 1081 atgtcctctc tgctcctgat gaagactgcg ttgcaacaga tgttgtatat gcagatgaaa 1141 accaagatga tgatgctgac gatcctgtag tccttgtcgc cgatacccaa gaagaggacg 1201 gcgttgccag ggagcaggtt gattcggctg attcggaaat ttgtgttgcg cacactggtg 1261 gtcaagaaat gactgagcct gatgtcgtcg gatctcaaac tcccatcgcc tctgctgagg 1321 aaaccgaagt cggtgaggca tgcgacaggg aagggattgc tgaggtcaag gcaactgtgt 1381 gtgctgatgc tttagatgcc tgccccgatc aagtggaggc atttgatatt gaaaaggttg 1441 aagactctat cttaagtgag cttcaaaccg aacttaatgc gcccgcggac aagacctatg 1501 aggatgtctt ggcattcgat gccatatact cagagacgtt gtctgcattc tatgctgtgc 1561 cgagtgatga gacgcacttt aaagtgtgtg gattctattc gccagctata gagcgtacta 1621 attgttggct gcgttctact ttgatagtaa tgcagagttt acctttggaa tttaaagact 1681 tggggatgca aaagctctgg ttgtcttaca aggctggcta tgatcaatgc tttgtggaca 1741 aactagttaa gagcgcgccc aagtctatta ttcttccaca aggtggctat gtggcagatt 1801 ttgcctattt tttcctaagc cagtgtagct tcaaagttca tgctaactgg cgttgtctaa 1861 agtgtggcat ggagttaaag cttcaaggct tggacgccgt gtttttctat ggagacgttg 1921 tgtctcatat gtgtaagtgt ggtaatagca tgaccttgtt gtctgcagat ataccttaca 1981 cattcgattt tggagtgcga gatgacaaat tttgtgcttt ttacacgccg agaaaagtct 2041 ttagggctgc ttgtgcggtt gatgttaatg attgccactc tatggctgtt gtggatggca 2101 agcaaattga tggtaaagtt gttaccaaat ttaatggtga caaatttgat tttatggtgg 2161 gtcatggtat gacatttagt atgtctccct ttgagatcgc ccagttatat ggttcatgta 2221 taacaccaaa tgtttgtttt gttaaaggag atgttataaa ggttttgcgc agagttggtg 2281 ctgaagtcat cgtcaaccct gctaatgggc gcatggctca tggtgcgggt gttgcaggtg 2341 ctatagctaa agcagcgggc aaagctttta ttaatgagac tgccgatatg gtgaaggctc 2401 agggcgtttg ccaggttggt ggatgctatg agtctaccgg tggtaaatta tgtaagaaag 2461 tgcttaacat tgtaggacca gatgcgcgag ggcatggcaa cgaatgctat tcacttttag 2521 agcgtgctta tcagcatatt aataagtgtg acaatgttgt caccacttta atttcggctg 2581 gtatatttag tgtgcctact gatgtttcct taacttatct acttggtgta gtgacgaaga 2641 atgtcattct tgtcagtaat aaccaggatg attttgatgt gatagagaag tgtcaggtga 2701 cctccgttgc tggtaccaaa gcgctatcat ttcaattggc caaaaatttg tgccgtgatg 2761 taaagtttgt gacgaatgca tgtagttcgc tctttagtga atcaagcttt gtctcaagct 2821 atgatgtgtt gcaggaagtt gaagcgctgg acatgatata caattggatg atgatgctcg 2881 tgtctttgtg caggctaata tggactgtct gcccacagac tggcgtcttg tcaataaatt 2941 tgatagtgtt gatggtgtta agaaccatta agtattttga atgtccgggc gaggtttttg 3001 tatctagcca gggcaaaaag tttggttatg ttcagaatgg ttcatttaag gaggcgagtg 3061 ttagccaaat aagggctttg cttgctaata aggttgatgt cttgtgtact gttgatggtg 3121 ttaacttccg ctcctgctgt gttgcagagg gtgaagtttt tggcaagaca ttaggttcag 3181 ttttttgtga tggtataaat gtaaccaaag ttaggtgtag tgccattcac aagggtaagg 3241 ttttctttca gtatagtggt ctgtctgcgg cagatctcgc tgctgttaaa gatgccttt //