GenBank-Updates@genbank.bio.net (08/30/90)
LOCUS MHV2BTIB 3299 bp ss-RNA VRL 30-AUG-1990
DEFINITION Murine hepatitis virus autoproteolytic cleavage domain.
ACCESSION M28352
KEYWORDS autoproteolytic cleavage.
SOURCE Murine hepatitis virus (strain JHM) cDNA to viral RNA.
ORGANISM Murine hepatitis virus
Viridae; ss-RNA enveloped viruses; Positive strand RNA virus;
Coronaviridae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 3299)
AUTHORS Baker,S.C., Shieh,C.-K., Soe,L.H., Chang,M.-F., Vannier,D.M. and
Lai,M.M.C.
TITLE identification of a domain required for autoproteolytic cleavage of
murine coronavirus gene a polyprotein
JOURNAL J. Virol. 63, 3693-3699 (1989)
STANDARD full staff_entry
COMMENT Draft entry and computer-readable copy of sequence [1] kindly
provided by M.C.Lai.
FEATURES from to/span description
pept < 1 > 3299 long open reading frame (AA at 3)
BASE COUNT 810 a 570 c 870 g 1049 t
ORIGIN
1 cattgatggt taactttagc cgagaggtag ttgacatgtg tatggacatg gctttattgt
61 tcatgcatga tgttaaagtg gccactaagt atgttaagaa ggttactggc aaagtagcag
121 tgcgctttaa agcgttaggc attgctgttg tcagaaaaat tactgaatgg tttgacttag
181 ccgtggacac tgctgctagt gccgctggat ggctttgcta ccagctggta aatggcttat
241 ttgcagtagc caatggtgtt ataaccttta tacaggaggt gcctaactat caagaattta
301 ttaacaatca gcatttcaat tcacacctgc atccgcctga gcttgtcaag aattttgttg
361 acaagttcaa gacatttttc aaggtcttga tcgactctat gtcggtctct atcttgtctg
421 gacttactgt tgtcaagact gcctcaaata gggtatgtct tgctggcagt aaggtttatg
481 aagttgtgca gaaatctctg cctgcatata ttatgcctgt gggttgcagc gaagccactt
541 gtttggtggg tgagattgaa cctgcagtct ttgaagatga tgttgttgat gtggttaaag
601 ccccgttaac atatcaaggc tgttgtaagc caccctcttc tttcgagaag atttgtattg
661 tggataaatt atatatggcc aagtgtggtg atcaattcta ccctgtggtg gttgataacg
721 acactgttgg cgtgttagat cagtgctgga ggttcccctg cgcgggcaag aaagtcgtgt
781 ttaacgacaa gcctaaagtt aaggaggtac cctccacgcg gaagattaag attatcttcg
841 ctctggatgc gacctttgat agtgttctct cgaaggcatg ttcagagttt gaagttgata
901 aagatgttac attggatgag ctgcttgatg ttgtgcttga cgcagttgag agtacgctca
961 gcccttgtaa ggagcatggt gtgataggca caaaagtttg tgctctactt aaaggttggt
1021 ggacgattat gtctatcttt ttgatgaagg aggcgaagaa gttattgccc tcccgtatgt
1081 atgtcctctc tgctcctgat gaagactgcg ttgcaacaga tgttgtatat gcagatgaaa
1141 accaagatga tgatgctgac gatcctgtag tccttgtcgc cgatacccaa gaagaggacg
1201 gcgttgccag ggagcaggtt gattcggctg attcggaaat ttgtgttgcg cacactggtg
1261 gtcaagaaat gactgagcct gatgtcgtcg gatctcaaac tcccatcgcc tctgctgagg
1321 aaaccgaagt cggtgaggca tgcgacaggg aagggattgc tgaggtcaag gcaactgtgt
1381 gtgctgatgc tttagatgcc tgccccgatc aagtggaggc atttgatatt gaaaaggttg
1441 aagactctat cttaagtgag cttcaaaccg aacttaatgc gcccgcggac aagacctatg
1501 aggatgtctt ggcattcgat gccatatact cagagacgtt gtctgcattc tatgctgtgc
1561 cgagtgatga gacgcacttt aaagtgtgtg gattctattc gccagctata gagcgtacta
1621 attgttggct gcgttctact ttgatagtaa tgcagagttt acctttggaa tttaaagact
1681 tggggatgca aaagctctgg ttgtcttaca aggctggcta tgatcaatgc tttgtggaca
1741 aactagttaa gagcgcgccc aagtctatta ttcttccaca aggtggctat gtggcagatt
1801 ttgcctattt tttcctaagc cagtgtagct tcaaagttca tgctaactgg cgttgtctaa
1861 agtgtggcat ggagttaaag cttcaaggct tggacgccgt gtttttctat ggagacgttg
1921 tgtctcatat gtgtaagtgt ggtaatagca tgaccttgtt gtctgcagat ataccttaca
1981 cattcgattt tggagtgcga gatgacaaat tttgtgcttt ttacacgccg agaaaagtct
2041 ttagggctgc ttgtgcggtt gatgttaatg attgccactc tatggctgtt gtggatggca
2101 agcaaattga tggtaaagtt gttaccaaat ttaatggtga caaatttgat tttatggtgg
2161 gtcatggtat gacatttagt atgtctccct ttgagatcgc ccagttatat ggttcatgta
2221 taacaccaaa tgtttgtttt gttaaaggag atgttataaa ggttttgcgc agagttggtg
2281 ctgaagtcat cgtcaaccct gctaatgggc gcatggctca tggtgcgggt gttgcaggtg
2341 ctatagctaa agcagcgggc aaagctttta ttaatgagac tgccgatatg gtgaaggctc
2401 agggcgtttg ccaggttggt ggatgctatg agtctaccgg tggtaaatta tgtaagaaag
2461 tgcttaacat tgtaggacca gatgcgcgag ggcatggcaa cgaatgctat tcacttttag
2521 agcgtgctta tcagcatatt aataagtgtg acaatgttgt caccacttta atttcggctg
2581 gtatatttag tgtgcctact gatgtttcct taacttatct acttggtgta gtgacgaaga
2641 atgtcattct tgtcagtaat aaccaggatg attttgatgt gatagagaag tgtcaggtga
2701 cctccgttgc tggtaccaaa gcgctatcat ttcaattggc caaaaatttg tgccgtgatg
2761 taaagtttgt gacgaatgca tgtagttcgc tctttagtga atcaagcttt gtctcaagct
2821 atgatgtgtt gcaggaagtt gaagcgctgg acatgatata caattggatg atgatgctcg
2881 tgtctttgtg caggctaata tggactgtct gcccacagac tggcgtcttg tcaataaatt
2941 tgatagtgtt gatggtgtta agaaccatta agtattttga atgtccgggc gaggtttttg
3001 tatctagcca gggcaaaaag tttggttatg ttcagaatgg ttcatttaag gaggcgagtg
3061 ttagccaaat aagggctttg cttgctaata aggttgatgt cttgtgtact gttgatggtg
3121 ttaacttccg ctcctgctgt gttgcagagg gtgaagtttt tggcaagaca ttaggttcag
3181 ttttttgtga tggtataaat gtaaccaaag ttaggtgtag tgccattcac aagggtaagg
3241 ttttctttca gtatagtggt ctgtctgcgg cagatctcgc tgctgttaaa gatgccttt
//