GenBank-Updates@genbank.bio.net (09/08/90)
LOCUS NEUMTCYTAB 4472 bp ds-DNA ORG 08-SEP-1990
DEFINITION N.crassa mitochondrial apocytochrome b (cob) gene, complete cds.
ACCESSION M37324
KEYWORDS apocytochrome b.
SOURCE N.crassa (strain SL74A) mitochondrial DNA.
ORGANISM Mitochondrion Neurospora crassa
Eukaryota; Plantae; Thallobionta; Eumycota; Ascomycotina;
Pyrenomycetes; Sordariales; Sordariaceae; Neurospora crassa.
REFERENCE 1 (bases 1 to 4472)
AUTHORS Citterich,M.H., Morelli,G. and Macino,G.
TITLE Nucleotide sequence and intron structure of the apocytochrome b
gene of Neurospora crassa mitochondria
JOURNAL EMBO J. 2, 1235-1242 (1983)
STANDARD simple staff_entry
COMMENT The boundaries of the second and third exon in the apocytochrome b
gene are uncertain. About 40 base pairs in the open reading frame
(ORF) were not determined.
FEATURES from to/span description
pept 593 985 apocytochrome b, exon 1
2247 2343 apocytochrome b, exon 2 (3' end unsure)
3602 4269 apocytochrome b, exon 3 (5' end unsure)
pept 593 985 ORF, exon 1
2247 3209 ORF, exon 2
IVS 986 2246 cob intron A (no splice consensus)
IVS 2344 3601 cob intron B (no splice consensus)
BASE COUNT 1537 a 563 c 682 g 1641 t 49 others
ORIGIN
1 ctgcagtcat tcgtctgcta ttagtaaata atgaagaaag aattttgaat gtttttattt
61 gcttcattaa taactcctat tataagagta tttattatat gtattgaaat gagtattgaa
121 ttacgcagta gactgcgtag gttaagtaga atccccgaga tgaattccgt aacggcttta
181 gttatttaga tactgttcga ggccggggga cccgggtgtg aaatcccccc gaaaggagga
241 tttcttaaat caattcgaca aacctcctga cctctaacac attcgaacgg aaatgaataa
301 aaaaggattg cattgtagta caatagtttt tgtttttatt tgcttattat taatcccatt
361 ttgggaaatc gagtacttaa atatcctata ttcaaggact cctgcctcct gcctcctgcc
421 ttcggcagga gtcctagtct agtctataaa attactaata ttaaatatat taatatatta
481 taaagagttt taataataat aataataagg tgtagaagaa gtttggttaa tgatctttat
541 tctttatatt ttttttttat ttctttcatt ttttttatta atttatttac ctatgagatt
601 attaaaaagt catcctttat taaaattagt taactcatat cttattgacg cttcacaacc
661 tagtaacata agttatttat gaaacttcgg ttctttatta gcatgttgtt taattataca
721 aattgtaact ggtgtaacat tggcaatgca ctatagtcct aacgtattag aagcttttaa
781 ctctatagaa catattatgc gtgatgtgaa taatggatga ttagtacgtt acttacacag
841 taacacagct tcagctttct tcttcttagt ttatttacat ataggaagag gaatgtatta
901 tggatcttat agagctccta gaacattagt ttgagctatc ggaacagtaa tccttatact
961 tatgatggcc actgccttct tgggttatca acataatccc aaaatggttt gatataagta
1021 ataaaggtag tataagtaat aaaggtaata tcacaaattc cttgcccccc ctcctccaga
1081 ggtggggggg aagaataaac agagattgtt taacaaaaat ctagtaaaaa gaggttattg
1141 tacaagtagt tctttaaata gtcctgaaat gtctgaaaga ttacaaacga ttattaatga
1201 attaggtata aaccctgtat atgtttatga agatttaaat caaccttcca gttgaaaaca
1261 aatattacat gatacaagag atttaagcgg tgtatatatg ataattaata aaataataaa
1321 agattattat aggttctgca tccaataata gattttatac tagattctgt aatcatgtta
1381 ttcattttac aggtagcaaa atagtttaaa ttagcaatta aaagatatga attgaaaaat
1441 tttgcttttg ttatattaga atttatatcc taatgttgtt accaaagaaa taacaaggaa
1501 ttattggatt tagaagataa atatttaaaa actattagtg cctaattata atattttaac
1561 cgaagcaggt tctagttttg gttacaaaca tactgaaata gatcgtcaaa aagatgaaag
1621 atctttatag tgacgctaga cgagaaaaga taggtagtct aaataggggt aaaaagtttt
1681 ctcctgaaac aatagaaaaa ataagagaaa aggctttaac tagacctcct atgtcagaag
1741 aaactaaaat aaaatatatt actaatacaa gacctgttgt gttatataac ttgaatagaa
1801 ctatttacgg taagnnnnnn nnnnatataa aaaaaattag ttaaaagata gtgaatagta
1861 gaagattttt ctgataaata ggttttattc cttattatac tttattcttt attatacttt
1921 attggtgtat aagctatagt cctatgagta taaatctttt tgtaattttt atagaaaaaa
1981 aaagattaaa gtggtatatc ccgatagggc gaaaatagtt ttagtactat ttggcgatgt
2041 tagtgaaaac ggttaaaatc cctctactta tgctgggata agaccgttgg ttatataaat
2101 aatcgctgca gactgggtca ctaatgggtg gctgaaatgc tgcttaatgt acagtcggaa
2161 cttttaatta aacaaaggta tttaattaat ggaatgcgcg aattaaaagt tattccagct
2221 tattattgat ataataagta agtacatatg ttttacctta tggacagatg agtttatgag
2281 gtgctactgt tattaccaat ttaataagtg caattccatg aattggacaa gatattgttg
2341 agtcaaaaat tattacttta attattaatt tatcttttac tgctatttta ttttcaattg
2401 tagttgtgta ttattatatc ttactacatg ttaatttttc atctaacctt cctatgatag
2461 gtgttattca tcaaaacgct ttaaagaaat caaataaggc tttaagatta gataaacaag
2521 aatatatatc cattccttca tcatttttag cttttttagc tggattggtt gatggtgatg
2581 ggtatattca agtaactaaa acatctaaag gtttcatagc aattaagtta gttatatctc
2641 ttcatttaga agatctttct attttagaat atattcattc tattttagaa tatattcatt
2701 ctgttttaaa aataggtaag ataaatattt ataaggattt aagaagtcca acttgtaaat
2761 tagtaattaa taaaactnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnnnnn nnnnnnaact
2821 tagctatata tatattcaaa aataatatta agatatataa tcaaattccc gataacgcgc
2881 ctactatttt tgagatacct aaaaatccta ttgattacgc attattacct ttttttaaaa
2941 attgaatagt cggatttaca tattctaagg gttcattttt tattaaaagt aataataata
3001 gttattttca attaaaacag agaatacata ctaatttatt tgaagccttt aaactaatat
3061 ttaatactaa tagaaaaata gatacaacaa ataattttaa tcaatttagt attagttcta
3121 aatctaatat acaaaaagtt ataaatttct tttcattttc aggtttacat cctttagtag
3181 ggttaaaata tattcaatat ataaaatagt taaataattt acgagaaagt ttacgttata
3241 gtaccttaaa ttatcctgat gtaaaataat gcaagataga ttgcaaaaga tataaattaa
3301 taaatgtaat ggggctcctt aaaataggta gggtttaatc ttattatatt ttagaggcaa
3361 ttggggaaaa ttacaaggac atttaataaa ttacctccgt tttattagat tatttgtagc
3421 gaaacttaat tcggtatata aaaaatggat taagaacgtt caacgactaa tgagtgagtt
3481 ataccaacaa taagctcaac acgatacccc caaaatccac tctatgagtg ggtttaagat
3541 atagtctaaa tataccctta agggtgtaaa gtataagtta aatattatac gtaatatatt
3601 gtgcatttag gaggttttag tgtaaacaat gctactttaa atagattctt tgctttatat
3661 tttgttttat tatttatttt agtagtatta gtattaatgt atctgattgt actttatgat
3721 atagtagggt taagtaaccc tttaggcgct ttaggtaatt acgatagaat aatatttgct
3781 ccttattatt tatttaaaga tttaataact atttttatct ttatatatgt tttaagttca
3841 tttgttttct ttatgcccaa tgttttaggt gatagtgaaa attatataat ggccaaccct
3901 atgcaaactc cacctgctat tgtgccagaa tgatatttat tacctttcga cgctatatta
3961 agatctatac ctaataaatt attaggagtt attgctatgt ttagtgcaat attagctata
4021 atgttattac ctataacaga tttaggtaga tcaaaaggtt tacaatttag acctttaagt
4081 aaattcgctt tctgagcttt tgtagtaaat ttcttaattt taatgaaatt aggtgcttgt
4141 catgtagaat caccttttat tgaattaggt caatttagta caatctttta tttgagttac
4201 tttatattta tagtacctgt gcttagttta attgagaata ctcttgtaga tctcaactac
4261 ttgaaataag atttttttag caaagctaaa aaaaattttt tttagctttg ctaatttggt
4321 tttttttgag gtgagctttc ctaccttcct cccttccact tctcgaggcg agcttctcga
4381 ggcgagcttc gcttaatttt ttttttagcc gtccccccgc cctacagtac tgcagggggg
4441 gggtggaggg aaacggagga ggccgtaaat aa
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