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LOCUS TOMPGAAA 7456 bp ds-DNA PLN 12-SEP-1990
DEFINITION Tomato polygalacturonase (PG) gene, exons 1-9.
ACCESSION M37304
KEYWORDS polygalacturonase.
SOURCE Tomato (strain Mill cv Ailsa Craig) DNA, clone pTOM6.
ORGANISM Lycopersicon esculentum
Eukaryota; Plantae; Embryobionta; Magnoliophyta; Magnoliopsida;
Asteridae; Solanales; Solanaceae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 7456)
AUTHORS Bird,C.R., Smith,C.J.S., Ray,J.A., Moureau,P., Bevan,M.W.,
Bird,A.S., Hughes,S., Morris,P.C., Grierson,D. and Schuch,W.
TITLE The tomato polygalacturonase gene and ripening-specific expression
in transgenic plants
JOURNAL Plant Mol. Biol. 11, 651-662 (1988)
STANDARD simple staff_entry
FEATURES from to/span description
pept 1479 1757 polygalacturonase, exon 1
2416 2547 polygalacturonase, exon 2
3327 3491 polygalacturonase, exon 3
3696 3716 polygalacturonase, exon 4
4260 4467 polygalacturonase, exon 5
4567 4648 polygalacturonase, exon 6
5602 5710 polygalacturonase, exon 7
6139 6255 polygalacturonase, exon 8
6788 7048 polygalacturonase, exon 9
pre-msg 1411 > 7456 polygalacturonase mRNA and introns
IVS 1758 2415 polygalacturonase intron A
IVS 2548 3326 polygalacturonase intron B
IVS 3492 3695 polygalacturonase intron C
IVS 3717 4259 polygalacturonase intron D
IVS 4468 4566 polygalacturonase intron E
IVS 4649 5601 polygalacturonase intron F (no splice
consensus)
IVS 5711 6138 polygalacturonase intron G
IVS 6256 6787 polygalacturonase intron H
BASE COUNT 2784 a 953 c 1038 g 2681 t
ORIGIN
1 aagcttctta aaaaggcaaa ttgattaatt tgaagtcaaa ataattaatt ataacaatgg
61 taaagcacct taagaaacca tagtttgaaa ggttaccaat gcgctatata ttaatcaact
121 tgataatata aaaaaaattt caattcgaaa agggcctaaa atattctcaa agtattcgaa
181 atggtacaaa actaccatcc gtccacctat tgactccaaa ataaaattat tatccacctt
241 tgagtttaaa attgactact tatataacaa ttctaaattt aaactatttt aatactttta
301 aaaatacatg gcgttcaaat atttaatata atttaattta tgaatatcat ttataaacca
361 accaactacc aactcattaa tcattaaatc ccacccaaat tctactatca aaattgtcct
421 aaacactact aaaacaagac gaaattgttc gagtccgaat cgaagcacca atctaattta
481 ggttgagccg catatttagg aggacacttt caatagtatt tttttcaagc atgaatttga
541 aatttaagat taatggtaaa gaagtagtac acccgaatta attcatgcct tttttaaata
601 taattatata aatatttatg atttgtttta aatattaaaa cttgaatata ttatttttaa
661 aaaaattatc tattaagtac catcacataa ttgagacgag gaataattaa gatgaacata
721 gtgtttaatt agtaatggat gggtagtaaa tttatttata aattatatca ataagttaaa
781 ttataacaaa tatttgagcg ccatgtattt taaaaaatat taaataagtt tgaatttaaa
841 accgttagat aaatggtcaa ttttgaaccc aaaagtggat gagaagggta ttttagagcc
901 aataggggga tgagaaggat attttgaagc caatatgtga tggatggagg ataattttgt
961 atcatttcta atactttaaa gatattttag gtcattttcc cttctttagt ttatagacta
1021 tagtgttagt tcatcgaata tcatctatta tttccgtctt aaattatttt ttattttata
1081 aatttttaaa aaataaatta ttttttccat ttaactttga ttgtaattaa tttttaaaaa
1141 ttaccaacat ataaataaaa ttaatattta acaaagaatt gtaacataat atttttttaa
1201 ttattcaaaa taaatatttt taaacatcat ataaaagaaa tacgacaaaa aaattgagac
1261 gggagaagac aagccagaca aaaatgtcca agaaactctt tcgtctaaat atctctcatc
1321 caaactaata taatacccat tacaattaac catattgacc aactcaaacc ccttaaaatc
1381 tataaataga caaacccttc ccatacctct tatcataaaa aaaataataa tctttttcaa
1441 tagacaagtt taaaaaccat accatataac aatatatcat ggttatccaa aggaatagta
1501 ttctccttct cattattatt tttgcttcat caatttcaac ttgtagaagc aatgttattg
1561 atgacaattt attcaaacaa gtttatgata atattcttga acaagaattt gctcatgatt
1621 ttcaagctta tctttcttat ttgagcaaaa atattgaaag caacaataat attgacaagg
1681 ttgataaaaa tgggattaaa gtgattaatg tacttagctt tggagctaag ggtgatggaa
1741 aaacatatga taatattgta agtatttaaa tattggaata tatttgtggg gatgaaaatg
1801 atagagaata taagaattat ttggaaggat gaaaagttat attttataaa gtagaaaatt
1861 attttctcgt ttttagtatt aaggtgaaaa tgagtttctc gttaagcgag gaaaagctat
1921 tttccatggt aactgtattt tttttttact tttaataacg tcatagtatt tgctatactc
1981 aagaataaga cacttattat tgatgattta gtgctcgaaa agaaattgat agtaattttg
2041 cttaatataa ctatcaattt cttatatgta tatttttcaa ccaaaataac aaagcgtaat
2101 ccaataagtg ggcctctaga ataaagagta agttctattc aattcttaac cttatttaat
2161 tttagtggaa acctcgacaa aaacgaacaa acgtattcaa acttttatat tcggaattcg
2221 agaccaacca tatgaacaac ctcacacatg catatagtcc taatatatat aatttttcta
2281 aaaaatatct tcaatctacc atattgaaat attgaaaaat gacttttatc ctatcgaaca
2341 cataatcaag agtttctttt aagaatttac cactacattt ggtatgtttc ttatcgtgtt
2401 aaaattatct ttcaggcatt tgagcaagca tggaatgaag catgttcatc tagaacacct
2461 gttcaatttg tggttcctaa aaacaagaat tatcttctca agcaaatcac cttttcaggt
2521 ccatgcagat cttctatttc agtaaaggtt agcatattga ttatttatat cctctttgtt
2581 agcaatatat tatctggttt atgacaaaat ttaagaaagt aatcaaagat agataaacaa
2641 tgaattttcg tcactaattt agcggattag tgaggaatta tcaaaatgtt atgttagcta
2701 tgagcaactt agctatgaat tagctagtga agaagtttga tgctaattct attttttttt
2761 tgtagagtaa agatatttga aacacatgta ttaattatta attatgtctt aattaatatg
2821 tcaatggata gttcaaacta aagaactgtc aaaagaaaat aagaaagaaa tatttatttt
2881 taaaataaat taaaaagaaa aatatgagaa ataaattcaa agcgagaagg tattacataa
2941 tctatgggga taaaaggata ttatatatgt aagaaaacag cactacacat atctaataaa
3001 gtctcataaa tggatataaa aaatagtgtg taagcaacag ttatccctac aaaaactttt
3061 gtggggtaga tcgatccaga ggttgtttcc agactcttgc ttaaaaaaaa tgttttttct
3121 aaataagttt gaaagaaatg ttatatgatg aaaatatgaa gaaaaacata tcaatattaa
3181 aaataataaa gtaatcaaag taaacgaaat aacaatagga ataatactca taaatgaaaa
3241 tttagtggct tttcgttaac ataatcttag tttattcatt gtttctttaa tttcccttct
3301 tatttttttt gaaattacta atgcagattt ttggatcctt agaagcatct agtaaaattt
3361 cagactacaa agatagaagg ctttggattg cttttgatag tgttcaaaat ttagttgttg
3421 gaggaggagg aactatcaat ggcaatggac aagtatggtg gccaagttct tgcaaaataa
3481 ataaatcact ggtaatttta taaccttgct tataagtttt acgctatgtt gctcgaattc
3541 tttaaacttg ttctaaagat attatatatt tgaaggaggt gtcacaaatg catcacattt
3601 ttagagattc cgaccaatat tagttttatg taatctaatt ttcagagcat ctttgccttg
3661 tactgatcat tgttaccctt tttttcttca tgcagccatg cagggatgca ccaacggtac
3721 gttaattgca tttgatttga taaaaaaaaa aagcctaaaa tatatttgaa ttttaattga
3781 aaggttataa taattcttaa ctttgggcag gacctattac cccttgcact atttaatagt
3841 gtattttaaa gatataaaag tgtttagttg aaacaaaaat ttagatattc aaaaactatt
3901 tgaaaattac tataaattgc aatttttttg catatcaata tgattaaaaa atattagtta
3961 aagttcttat gatttgattc taaaaataaa aatcatgaca aacaatagta gacggagaaa
4021 gtatataaca atacctcttc aagtagaatc gatttgtaca cacacctcaa aacctacgtt
4081 ttcttcgatt tatatttcct atttctttta atagtaatca aaggctatta gttctgtcaa
4141 aatctataca ttggaaactc tatctttgac gcctcgtaca ttcgagatcg ttgaacaatg
4201 gatgaatgat tatttaactt tgtatttaaa tattaaaact aatattgttt aattttcagg
4261 ccttaacctt ctggaattgc aaaaatttga aagtgaataa tctaaagagt aaaaatgcac
4321 aacaaattca tatcaaattt gagtcatgca ctaatgttgt agcttcaaat ttgatgatca
4381 atgcttcagc aaagagccca aatactgatg gagtccatgt atcaaatact caatatattc
4441 aaatatctga tactattatt ggaacaggtt tatttattta atttttattt atccaattta
4501 attagaaaaa aaaaggagta tttttatttg ataactaaat tattaatttt taattttttt
4561 ttataggtga tgattgtatt tcaattgttt ctggatctca aaatgtgcag gccacaaata
4621 ttacttgtgg tccaggtcat ggtataaggt actctatttt acaaatatac ttgtttccat
4681 tttctctatt tcataaaagg tagtatgata taataattac tttaaatcct ttaattaatt
4741 tattggcaaa ttttttctct tgtctttatg gttaatgact tagcacaata attagggccg
4801 tttggatggg cgaataaaag cagctttaaa aaagtacttt taaaagtgtt gaaacttatt
4861 tttaaaataa gcagttatcg gtttggataa aagtgctgaa gttgttatgt caaacgtgaa
4921 aagggaaaaa tggaagaaag aaatgttagg gttatatggg ttatttgtat aaaaatatta
4981 agcacaaaaa gataaaaatg tggtcaactt aaaacaactt ataagctacc ctaccctacc
5041 ccagctttta acttttggct taaaataagt tttttttttt aaaacttaaa ataagttgtt
5101 ttgagtattg ccaaagagct aaataatgca aaaaccagct tttaagtcag tttgaccagc
5161 ttttaagctg agccaaacag gctcttaaaa tgtctgctta gatgtgctat atatatttga
5221 gctttttttg aagtagtata ttatccttaa gttcaacata aaatacatgc tttaacatag
5281 cacatatagt taatcaaaag acgaaatgat gaataatttt gcgaatttga ttattcacaa
5341 gaaaagggat agttcaaagt gtacatttca atgaattgaa gatatcataa agactaaaat
5401 tagaagaatc aataattgag ggatcaaaaa tgttattacc ttattaaaat actattccat
5461 tttcatatta aattaactaa ttaagagtgt tttataatct aataaaacat gcaataatta
5521 ttgacgaaat gtggttttgg tacctataat ctttctgaat atttgctcta ttttttctct
5581 ttttattttt ccatggatta ctattggaag cttaggatct ggaaattcag aagcttatgt
5641 gtctaatgtt actgtaaatg aagccaaaat tatcggtgcc gaaaatggag ttaggatcaa
5701 gacttggcag gtaccctccc cccccccccc ccccccacag gcccattttt ttaatttttt
5761 ttaaattttt attcgaatat caatattaaa gattaatttg atttcatgtt tgaaatttat
5821 atttggataa agtatgtatt ttactagctt tctatgttat atagaaaaaa aaatgttcag
5881 aacttcagat tattgtactc gtactaagtg taaatgtgtt gctttgttta gaagtttggt
5941 ttatccagtt ttgggtcatg attaaaccaa acttataatg aaaaggggct gcaacggccg
6001 gcccactagt gctagtatca ataggaagat ctcacgtctg tttattcaga tggacgttct
6061 tggttgaatg ttaataatta taaatttaat taacatgtaa ttaagcatta tataaattaa
6121 tgtggtttaa taatgtaggg aggatctgga caagctagca acatcaaatt tctgaatgtg
6181 gaaatgcaag acgttaagta tcccataatt atagaccaaa actattgtga tcgagttgaa
6241 ccatgtatac aacaggtaat tttttattaa cgaacaattt attatatttt attacttctt
6301 aaatcacctt acatcattaa aactttgaga ttcttttcac tagttagtaa ctttttgaat
6361 agatttttag taaatgatat tcattattcc ttttattttt cttctaattt atggatcttt
6421 tggactatgg tctaaaaatc ttgttaaagt aaactgaata tcataagaaa aaatgttaga
6481 ttataatcta aattttttat aaattattag acgttatcta atattttgta tgtaagattg
6541 agaaacatat acataaaaca ttagattcaa atttaataat atctaaaata ttgattcaaa
6601 tcaatcatga ctacacaaac gaatacatgc agattctcaa acatatagat gaagtcattt
6661 caaaacgaat caaatatagt agagtatatc cttaaaagag agcatttggg taaataagta
6721 aaaatcatta agttataaaa aaaattctaa ctcgatctct cacgattatt taatcacttt
6781 gttccagttt tcagcagttc aagtgaaaaa tgtggtgtat gagaatatca agggcacaag
6841 tgcaacaaag gtggccataa aatttgattg cagcacaaac tttccatgtg aaggaattat
6901 aatggagaat ataaatttag taggggaaag tggaaaacca tcagaggcta cgtgcaaaaa
6961 tgtccatttt aacaatgctg aacatgttac accacactgc acttcactag aaatttcaga
7021 ggatgaagct cttttgtata attattaatt tatactatag atcttcaata tatagcagat
7081 atgatatatc acaataaaca aatctatatc tatgtattga ataattatta ttaatatgta
7141 cggattgaag ttttaataag actactatgt atttctattt tctagtcaaa agtttgacga
7201 ttgtactttt taatgtacaa aaataataaa atggttattt atatgatgta tatatccctt
7261 tggtatttct tgttgaacta taatgtcatt atttaataac tattatctgt gcaatgattg
7321 tatttgttaa tgatacataa tatatctttc atcattgata ataagaataa aatattttac
7381 gtctattact ttgtgaatta tatgtagatt ttagtttttg ttttattttt aattaaaccg
7441 agtgaaatat aaagag
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