GenBank-Updates@genbank.bio.net (09/21/90)
LOCUS EGRCPRIBPR 4814 bp ds-DNA ORG 21-SEP-1990
DEFINITION E.gracilis chloroplast ribosomal protein genes rpl23, rpl2, rps19,
rpl22, and rps3, complete cds.
ACCESSION M37463
KEYWORDS ribosomal protein.
SOURCE Euglena gracilis chloroplast DNA.
ORGANISM Chloroplast Euglena gracilis
Eukaryota; Plantae; Thallobionta; Euglenophycota; Euglenophyceae;
Euglenales; Euglena gracilis.
REFERENCE 1 (bases 1 to 4814)
AUTHORS Christopher,D.A., Cushman,J.C., Price,C.A. and Hallick,R.B.
TITLE Organization of ribosomal protein genes rpl23, prl2, rps19, rpl22
and rps3 on the Euglena gracilis chloroplast genome
JOURNAL Curr. Genet. 14, 275-286 (1988)
STANDARD simple staff_entry
FEATURES from to/span description
pept < 1 104 psbJ gene product
pept 253 299 ribosomal protein rpl23, exon 1
406 475 ribosomal protein rpl23, exon 2
575 721 ribosomal protein rpl23, exon 3
825 863 ribosomal protein rpl23, exon 4
pept 1018 1851 ribosomal protein rpl2
pept 1911 1988 ribosomal protein rps19, exon 1
2092 2220 ribosomal protein rps19, exon 2
2318 2395 ribosomal protein rps19, exon 3
pept 2506 2847 ribosomal protein rpl22
pept 3478 3523 ribosomal protein rps3, exon 1
3933 4493 ribosomal protein rps3, exon 2
4596 4645 ribosomal protein rps3, exon 3
IVS 301 405 rpl23 intron A (no splice consensus)
IVS 476 574 rpl23 intron B (no splice consensus)
IVS 722 824 rpl23 intron C (no splice consensus)
IVS 1989 2091 rps19 intron A (no splice consensus)
IVS 2221 2317 rps19 intron B (no splice consensus)
IVS 3523 3932 rps3 intron A (no splice consensus)
IVS 4493 4595 rps3 intron B (no splice consensus)
BASE COUNT 1523 a 466 c 696 g 2129 t
ORIGIN
1 gaattccact ttggttagtt cttacaataa tcggtttagc agcgattgca cttcttgctc
61 ttttttttta tggctcttat tcgggtttag gttcttcttt ataagttttt tataatactt
121 ttatattctt aatatatatt ttagtttatt cggtaattaa tatattatcg aataaatttt
181 tctaaatttt tataatttaa aaaaggttat tatttccttg tttttttttt gttagtattt
241 tgtttacttt atatgtttta ttttatttct agaaaatttt atgatcagtt taagtatggg
301 tgtgttctta tatttttttt ttataatata tttatttatt ttttttttta atgttaattt
361 ttttttgaat atttataaat acttttgatt tttttttaaa tctcaaattt tgaccgataa
421 gactaataaa cttttaaaaa ataatgttta tacttttgat gttgatatac aaatgttttg
481 aatgtttata gtagctgtat ttttagtttg tagttttata ttataaaaat tttaattaat
541 tacttttatt tttttagtat tttataactt cataagtaaa aggcaattta aagatcttat
601 tgaaactgct tttagtgtta aaattacttc agttaatagc tatgtaaaat ctagtaaata
661 ttatcgttca aataattttg agggtatgaa aaaatattat aaaagaatgt ttattaaatt
721 agtgagatta tattattata ttatattggg aaataaatat aacttttgtt ttcaattaat
781 tcttttttgt ttaatttctt ttaaggattt taatcaattt atataatgac ttagaaacaa
841 ttcctttttt ttcttgtctc tagttaattt ttattgtttt agtagtggca tttataggtg
901 agttttactt tatttgttta aaaataattt agttttttat ttttaaccta aaatttttta
961 attctaattt tttcgatgta tttagtatat actttaatag tttactaatt ttttaatatg
1021 attattcgtt attacaaacc atatacatca gggactcgta aacgttctgt tagtaatttt
1081 tcagaaatta caaaatctaa tcctgaaaaa tatttaacat tttttgttca taggtcaaaa
1141 ggacggaatt cccgtggtgt gattacttgc cgaactttag gtggtggtca caaacgcttg
1201 tatcgcagaa tagagtttaa acgtaataag ctaggtattt taggaaaagt tatttctatt
1261 gaatacgatc ctaataggaa tgctcgaatt gctttaattt attataaaaa tggtgataag
1321 tcttatatta ttcatccttt tgatttgtgc gttggtaata atattatttc tgattttttt
1381 tctcctatta aaataggaaa ttctttaccc ataagcaaaa taccattagg tactattatt
1441 cataacgtag agtttgagcc tggaaaaggt ggtcaaattg caagggctgc tggaactttt
1501 gtacaaatat tggccaatga aggaaaattt gttactataa caatgccttc gggagaagtt
1561 cgtttattac gacgttattg ttgggctact attggtcaag ttggaaatct tgatcattct
1621 aatgtcgttt taggaaaagc tggaagaaat cgctggttag gaaacaaacc aacagttcgt
1681 ggtgtagcta tgaatccttg cgatcaccct catggaggag gcgaaggcag aagtcctata
1741 ggtagaccaa agcctgttac gccttggggt aaaccagcat taggtaaaaa gacaagatca
1801 cctaaacgat ttagtaataa atatataatt cgctctagaa aaatggttta atatctacta
1861 ttttccttgt tattattttg tttatttttt attttgttta ttttttattt atgtctcgtt
1921 ctttaaaaaa aggtcctttt gttttttatt cattaataaa aaaagttgac caaatgaatt
1981 cgaatcgttt ttgagatttg accttatgtt tttaattaat ttttatttta gaatcatata
2041 taatactaat ttatttattt ttttgttttt aaatgaaaac tttagatctt ttttaaatct
2101 gtaatattaa cttggtcccg ttcctgtact attattccaa ttatgattgg aaatacaata
2161 ggcgtttata atggaaagga gcatataccc gttttagttt ccgatcaaat gataggtcac
2221 ttttgatttt ataatttttg taataaaaaa tttaaagttt attttcttat attattgtgg
2281 gttttttatt aataaaatgg atttattaaa ccttataaaa ttaggtgaat ttgtgcaaac
2341 tagaaattat cgtggtcata aaaagcatga taaaaaaact aagactaaga gatagtagaa
2401 ttattttata tgttatgtaa tttttgcatg tattaagaac tttttaaata ttagtatgga
2461 tactttttat acagttttta tataatttta tgttattttt tactgatgga acaaaaaaaa
2521 cctttagaat cttcagcttc aataaagtac gttagaattt ctccttttaa agttaggaga
2581 attttaaatc aaattaaagg tcgttctgca aaagaggctt taatgatttt aaaatttatg
2641 ccttataaac ctagtactct tatttttaag cttcttaaaa gcgccgtttc taattcaata
2701 aaaaattacg atgaagatgc aaatgttttg cgtgttctcg aagctagagc agatgctgga
2761 cctatcttga aacgtttatg tccacatgca caaggtaggg gttttcctat taaaaaacga
2821 acatgtcata taactattat tgtctgaatt tgaattattt cgtagttttc ttttgcaact
2881 ctaattgttg ttttagtgag tttgtttttc taaataaaag ataaataact ttttattttt
2941 gatgaatttt aagtttattt gtttttatta tttgttgaat ttggtttatg gtttaaaaat
3001 tttaatttat ttttcatttc aaaacagatt tattttattc atttttttgt ttaaaaagcg
3061 attggaaata ctatcaaaaa tttttatagt tttataggta ttttaaatgt atatttgtat
3121 taatgaagct gtatgttgta aacgcttgta cagattttag aaggattata atttctattc
3181 aattaaaatt atccatttta taaaaatttt tgttaactta ttgcattttg tttttgtaat
3241 ttattttatt aagtgttgga acctcattaa tcagaaaaaa cttatttttt acattaactg
3301 gtcattttgt tttgaaaaaa tttgaaagat taaatttata gaaaaaagat taaatctcta
3361 ttaataaata atcaaaacaa taatcgtttt taaatttacc tggtatttat ttgttgttcg
3421 tagtttattt ttatattatt ttcaattaag attttagcat tagttgtttt tttttttatg
3481 ggtcaaaaag ttcacccttt agggtttagg ctaggtatta ctattgagat acaaaatatt
3541 atttatttcg taataaatat tttattctat tattaacttg tgttttatct aaaatattta
3601 tagtgcgata ctaaagttct aaagttaatt tttataattt tttggtctta tttactttaa
3661 aatttataag atagcttcaa ttcgttaaat attattttga ggtcgatttt ttatattttt
3721 ctattaagtg ttgtttttaa tgtttatttt tccttattta ttttttttgt agaaaaagtt
3781 tttattctta ttttgaggat aatttgattt atattttatt agaattagag attttatacc
3841 cgagttttta ttttagctat atgcttttaa taagcttgtt ttgttttgaa agtattttat
3901 ttttaacttt aaaaagagtt ttctattttc ttagtcgcat agttcatttt ggtatgtgga
3961 aaggaggcat tacgctagtt ttgtaaaaga agacatcgtt atccgtaatt ttatgaataa
4021 agagctttta gagactttaa tttcgttgat aaagatagaa agaatatatg aatttagtga
4081 acaaagaaat aacacaatag tctatattca tgttgccaga ccagaacgtg taataggaag
4141 agatggccag ggattatctc gtattaggga tatattgatt gataggatga attatctgtt
4201 gggtaagact cctcgtatta ttacttgtaa ggttgtagga gtgacctctc ctaatttaga
4261 tgccagactt cttgccgact cagttcgtcg agaattagaa aaacgaacac cttttataag
4321 ggctatgaaa actgtaatgt tgcaagcaat gaaggcagga gcagagggta taaaggttca
4381 agtttctgga cgtttaaatg gtatagaaat tgctaggacg gaatggttta gggaaggaag
4441 agttcctctt catactttga gggcagatat agattatttt aatgatatag ctcataagat
4501 atttctttta tttttataaa atttagtata attttataaa tttttcttta tttttatttt
4561 ttgttttatt ttaaataaat tttattaatt ttataatacg atttatggag ttttagggat
4621 aaaggtttgg gtatataaag tttagcgtct tttaattttt ttttttattg atatttatat
4681 tatttttatt tttcgctata ttgtaaaaca ttttgttttc ttttttttat agatttaatt
4741 ggaactttat taaatggaat tttttgcgtc attaattttg tattatttta aaatattttt
4801 tatgaaaaat tcct
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