GenBank-Updates@genbank.bio.net (11/07/90)
LOCUS RIRSPAP 5131 bp ds-DNA BCT 07-NOV-1990
DEFINITION Rickettsia prowazekii surface protein antigen (spaP) gene, complete
cds.
ACCESSION M37647
KEYWORDS S-layer protein; surface antigen.
SOURCE Rickettsia prowazekii (strain Brein 1) DNA.
ORGANISM Rickettsia prowazekii
Prokaryota; Bacteria; Gracilicutes; Scotobacteria;
Rickettsias and Chlamydias; Rickettsiales; Rickettsiaceae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 5131)
AUTHORS Carl,M., Dobson,M.E., Ching,W.-M. and Dasch,G.A.
TITLE Chracterization of the gene encoding the protective S-layer
JOURNAL Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. (1900) In press
STANDARD full staff_review
COMMENT Draft entry and computer-readable sequence kindly submitted by
M.Carl, 09-AUG-1990.
FEATURES from to/span description
pept 203 5041 surface antigen
BASE COUNT 1734 a 740 c 963 g 1692 t 2 others
ORIGIN
1 aaatattagg ttatttcctt atcaagtgtg ggatatcttg acctcgtatt tgattaattt
61 gttttaatac tagatactaa attttaactt aaatatagga aaaaattatg gctcaaaaac
121 cnnattttct aaaaaaataa tttccgcagg attggtaact gcttccacgg ctactatagt
181 agctggtttc tctggtgtag caatgggtgc tgctatgcaa tataatagga caacaaatgc
241 agcagctaca acctttgatg gtataggctt tgatcaagct gctggtgcta atattcctgt
301 cgctccaaat tcagttatta ctgctaatgc taataatcct attactttta atactccaaa
361 cggtcattta aatagtttat ttttggatac ggcaaatgat ttagcagtaa caattaatga
421 ggatactacc ttaggattta taacaaatat tgctcagcag gctaagttct ttaattttac
481 tgttgctgct ggtaaaattc ttaacataac agggcagggt attactgttc aagaagcttc
541 taatacaata aatgctcaaa atgctcttac aaaagtgcat ggtggcgctg ctattaacgc
601 taatgatctt agcgggctag gatcaataac ctttgctgtg tgtccttctg tattagaatt
661 taatttaata aatcctatca actcaagaag ctcctcttat cacttggtgt ctaattctaa
721 aatagttaat ggtggtaatg ggatattaaa tattactaat ggatttattc aggtttcaga
781 taacactttt gctggtatta agaccattaa tatcgatgat tgtcaaggtt taatgtttaa
841 ttctactcct gatgccgcta atactttaaa tttacaagca ggtggtaata ctattaattt
901 taatggaata gacggtactg gtaaattagt attagtcagt aagaatggtg ctgctaccga
961 atttaatgtt acaggaactt taggtggtaa tctaaaaggt attattgaat tgaacactgc
1021 agcagtagct ggtaaactta tctctcttgg aggtgctgct aatgcagtaa taggtacaga
1081 taatggagca ggtagagctg caggatttat tgttagtgtt gataatggta atgcagcaac
1141 aatttctgga caagtttatg ctaaaaacat ggtgatacaa agtgctaatg caggtggaca
1201 agtcactttt gaacacatag ttgatgttgg tttaggcggt accaccaact ttaaaactgc
1261 agattctaaa gttataataa cagaaaactc aaactttggt tctactaatt ttggtaatct
1321 tgacacacag attgtagtcc ctgatactaa gattcttaaa ggtaacttca taggtgatgt
1381 aaaaaataac ggtaatactg caggtgtgat tacttttaat gctaatggtg ctttagtaag
1441 tgctagtact gatccaaata ttgcagtaac aaatattaat gcaattgaag cagaaggggc
1501 cggggttgta gaattatcag gaatacatat tgcagaatta cgtttaggga atggtggctc
1561 tatctttaaa cttgctgatg gcacagtaat taatggtcca gttaaccaaa atgctcttat
1621 gaataataat gctcttgcag ctggttctat tcagttagat gggagtgcta taattaccgg
1681 tgatataggt aacggtggtg ttaatgctgc gttacaacac attactttag ctaacgatgc
1741 ttcaaaaata ttagcactcg atggcgcaaa tattatcggg gctaatgttg gtggtgcaat
1801 tcattttcaa gctaacggtg gtactattaa attaacaaat actcaaaata atattgtagt
1861 taattttgat ttagatataa ctactgataa aacaggtgtt gttgatgcaa gtagtttaac
1921 aaataatcaa actttaacta ttaatggtag tatcggtact gttgtagcta atactaaaac
1981 acttgcacaa ttaaacatcg ggtcaagtaa aacaatatta aatgctggcg atgtcgctat
2041 taacgagtta gttatagaaa ataatggttc agtacaactt aatcacaata cttacttaat
2101 aacaaaaact atcaatgctg caaaccaagg tcaaataatc gttgccgctg atcctcttaa
2161 tactaatact actcttgctg atggtacaaa tttaggtagt gcagaaaatc cactttctac
2221 tattcatttt gccactaaag ctgctaatgc tgactctata ttaaatgtag gtaaaggagt
2281 aaatttatat gctaataata ttactactaa cgatgctaat gtaggttctt tacactttag
2341 gtctggtggt acaagtatag taagtggtac agttggtgga cagcaaggtc ataagcttaa
2401 taatttaata ttagataatg gtactactgt taagttttta ggtgatacaa catttaatgg
2461 tggtactaaa attgaaggta aatccatctt gcaaattagc aataattata ctactgatca
2521 tgttgaatct gctgataata ctggtacatt agaatttgtt aacactgatc ctataaccgt
2581 aacattaaat aaacaaggtg cttattttgg tgttttaaaa caagtaatta tttctggtcc
2641 aggtaacata gtatttaatg agataggtaa tgtaggaatt gtacatggta tagcagctaa
2701 ttcaatttct tttgaaaatg caagtttagg tacatcttta ttcttaccta gtggtactcc
2761 attagatgtt ttaacaatta aaagtaccgt aggtaatggt acagtagata attttaatgc
2821 tcctattgta gttgtatcag gtattgatag tatgatcaat aacggtcaaa tcatcggtga
2881 taaaaagaat attatagctc tatcgcttgg aagtgataac agtattactg ttaatgctaa
2941 tacattatat tcaggtatca gaactacaaa aaataatcaa ggtactgtga cacttagtgg
3001 tggtatgcct aataatcctg gtacaattta tggtttaggt ttagagaatg gtagtccaaa
3061 gttaaaacaa gtgacattta ctacagatta taacaactta ggtagtatta ttgcaaataa
3121 tgtaacaatt aatgatgatg taactcttac tacaggaggt atagcaggga cagattttga
3181 cgctaaaatt actcttggaa gtgttaacgg taacgctaac gtaaggtttg ttgatagtac
3241 attttctgat cctagaagta tgattgttgc tactcaagct aataagggta ctgtaactta
3301 tttaggtaat gcattagtta gtaatatcgg tagtttagat actcctgtag cttctgttag
3361 atttacaggt aatgatagtg gggcaggatt acaaggcaat atttattcac aaaatataga
3421 ttttggtact tataatttaa ctattctaaa ttctaatgtc attttaggtg gtggtactac
3481 tgctattaat ggtgaaatcg atcttctgac aaataattta atatttgcaa atggtacttc
3541 aacatggggt gataatactt ctattagtac aacgttaaat gtatcaagcg gtaatatagg
3601 tcaagtagtc attgccgaag atgctcaagt taacgcaaca actacaggaa ctacaaccat
3661 taaaatacaa gataatgcta atgcaaattt cagtggcaca caagcttata ctttaattca
3721 aggtggtgct agatttaatg gtactttagg agctcctaac tttgctgtaa caggaagtaa
3781 tattttcgta aaatatgaac taatacgtga ttctaaccag gattatgtat taacacgtac
3841 taacgatgta ttaaacgtag ttacaacagc tgttggaaat agtgcaattg caaatgcacc
3901 tggtgtaagt cagaacattt ctagatgctt agaatcaaca aatacagcag cttataataa
3961 tatgctttta gctaaagatc cttctgatgt tgcaacattt gtaggagcta ttgctacaga
4021 tacaagtgcg gctgtaacta cagtaaactt aaatgataca caaaaaactc aagatctact
4081 tagtaatagg ctaggtacac ttagatatct aagtaatgct gaaacttctg atgttgctgg
4141 atctgcaaca ggtgcagtgt cttcaggtga tgaagcggaa gtatcttatg gtgtatgggc
4201 taaacctttc tataacattg cagaacaaga caaaaaaggt ggtatagctg gttataaagc
4261 aaaaactact ggggttgtag ttggtttaga tactctcgct agcgataacc taatgattgg
4321 ggcagctatt gggatcacta aaactgatat aaaacaccaa gattataaga aaggtgataa
4381 aactgatatt aatggtttat cattctctct atatggttcc caacagcttg ttaagaattt
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4501 cttcttcgag tctaatggta agatgagcaa gcaaattgct gctggtaatt acgataacat
4561 gacatttggt ggtaatttaa tatttggtta tgattataat gcaatgccaa atgtattagt
4621 aactccaatg gcaggactta gctacttaaa atcttctaat gaaaattata aagaaaccgg
4681 tacaacagtt gcaaataagc gcattaatag caaatttagt gatagagtcg atttaatagt
4741 aggggctaaa gtagctggta gtactgtgaa tataactgat attgtgatat atccggaaat
4801 tcattctttt gtggtgcaca aagtaaatgg taaattatct aactctcagt ctatgttaga
4861 tggacaaact gctccattta tcagtcaacc tgatagaact gctaaaacgt cttataatat
4921 aggcttaagt gcaaacataa aatctgatgc taagatggag tatggtatcg gttatgattt
4981 taattctgca agtaaatata ctgcacatca aggtacttta aaagtacgtg taaacttcta
5041 ataattattt gtgattttag taagtttata acttgattaa gaaaaaaagc ccactttgaa
5101 aaaatgggct ttttttctag ttatgtaata a
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