GenBank-Updates@genbank.bio.net (01/24/91)
LOCUS TEYMTRGA 2883 bp ds-DNA INV 24-JAN-1991
DEFINITION T.pyriformis mitochondrial ribosomal RNA large subunit, Leu- and
Tyr-tRNA genes.
ACCESSION M58010
KEYWORDS ribosomal RNA large subunit; transfer RNA-Leu; transfer RNA-Tyr.
SOURCE T.pyriformis (strain ST) mitochondrial DNA, clone HindIII/Sau3A.
ORGANISM Tetrahymena pyriformis
Eukaryota; Animalia; Metazoa; Ciliophora; Oligohymenophora;
Hymenostomata; Hymenostomatida; Tetrahymenina; Tetrahymenidae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 2883)
AUTHORS Heinonen,T.Y., Schnare,M.N. and Gray,M.W.
TITLE Sequence heterogeneity in the duplicate large subunit ribosomal RNA
genes of Tetrahymena pyriformis mitochondrial DNA
JOURNAL J. Biol. Chem. 265, 22336-22341 (1990)
STANDARD full staff_entry
FEATURES Location/Qualifiers
rRNA 109..2423
/gene="LSU-beta"
/product="ribosomal RNA large subunit"
tRNA 2426..2506
/gene="Leu-tRNA"
/product="Leu-tRNA"
rRNA 2517..2796
/gene="LSU-alpha"
/product="ribosomal RNA large subunit"
tRNA 2811..2883
/gene="Tyr-tRNA"
/partial
/product="Tyr-tRNA"
BASE COUNT 1083 a 318 c 470 g 1012 t
ORIGIN
1 aagcttttaa atttctattt cttataatgc atgaatttat tttatttatt ttacatgctt
61 atagatttat aatttattaa cattaaaatt aattcaaata attttattta gtaaatttca
121 ataagttttt gaaattgaaa attagaaatc tacttctaaa acttaaaaaa tttaaattct
181 atagtaaaaa gtaccgcgag ggaaaggtga aaagattttt aatatcttaa aagaacctaa
241 aatttaatgc taaatacagt taaggcttta tgttttaacg taccttttgc ataatgggct
301 agcgagttta tataattagc gagtaattta taataaaata atattacgaa tcgatagaaa
361 attagttaat tatataagac ccgaagctaa gtgatctaat tatggttaga ttaagggtat
421 ttatacctaa ggatcgaact cttaaatgtt gcaaaatttt gggataaact gtaattaggg
481 gtgaaaggct tatcaaactt agttatagct ggttttccac gaaacctatt taagtagggt
541 gatattttat tataaaatta ggtttaaata actatatcta taattaatat gttaattata
601 aaattagtat ataataatta gttttattta gatattaatc agactattag cgctaaggtt
661 tatagtcaag agagaaacag ctcagattaa acaataaggt ctacaaaagt aaataatttt
721 ggagattgtt tttattatta tcaataagat gtaggcttgg aagcagccat cattttaaaa
781 aagcgtaaaa gcttaatatt gagtgtatta ttgttttaaa ataataaata taaaaataat
841 cataaatgaa aatagattaa tttttactta ccgaattgat aaatcgaaag atggtagtgg
901 aacattttgt ataaataaat aaaattgtga aattttatat cttatcaata tagataatgc
961 tagcatgagt agtagacata atgtgagaat cattatcgcc tgatgtacaa gggttgctaa
1021 atttgataat cttatttagt gtaaatcggt ttctaaaatt taaatgtata tttttattga
1081 tgaatacgaa atataaaatt cttaataatc tattaaatat attacataaa attttttgta
1141 atatatttat ttaatggatt agttgctgga aatgtttata ttttttttac cgtactaact
1201 ctaacacaag tgtacaagta gaatatataa tggcgaagga gtaaaaagta ttgaaggaac
1261 taggcaaatt gactctgtaa cttcgggaga aagagggctt taagcaacta aaaagagaga
1321 gtagcgactg tttaataaaa acataagatt ttgctaaatt taaatacgaa gtataaaatc
1381 tgacacctgc ccggtgctgc aaggtgaaca aattttggta aacgctaaaa ttttaaaccc
1441 cagtaaacgg cggccgtaac cctgacggtc ctaaggtagc aaaattcctt ggcgggtaag
1501 ttccgtcctg catgaatggt gtaacgactg ctctgctgtc tccaatacta gctctacgaa
1561 attgaatttt ccgtgaagat gcgacaatat tacaactaga cgggaagacc ctatgcacct
1621 ttactgttat ctgtaaataa ttttttttta taattaacta gacaagtagg aaatttatat
1681 taaaaatgga aaactactta attatattta aaaattaaaa ataaattaat catattatca
1741 attaattatt ttgttataga aagacagttt gactggggcg gtctcctcct aaaaagtaac
1801 ggaggagtat aaaaactcgg ggtatcttat tttaattaag atcaatatta aaatgaattt
1861 tactgagttt gattagagta cttacaagta ttctaaggat acatgtctat catattgacc
1921 cgatataatt ttgtagaaaa tatatcgatc aacgaataaa aggtacgcta gggataacag
1981 gcttatgagt tttgagagtt cttattaata aactcgtttg gcacctcgat gtcggctcat
2041 cacatcctga tggtggacaa tctatcaagg gtccggctgt tcgccggtta aagtggtacg
2101 tgagctgggt ttaaaacgtc gtgagacagt ttggtcccta tctgttgtaa ttataagaaa
2161 ataaataaga attaacttta gtacgagagg actaggaaaa tttaatcact ggtttgaaaa
2221 ttattttaat aaataaaagt atggttttta agctacatta aacaaaataa ttgctgaata
2281 ttatataagc aagaatttaa cttatattat tttctaataa attttttaaa gactatatta
2341 tttaagtttt tatataagtg tagttataac taacgaatat ataaaaaact tataatttaa
2401 tatttactac agtttagttt atataactta tgtggcggaa caggtagacg cgtgggactt
2461 aaaatctcat tccataggag tgccggttcg attccggtca taagtaaatt tttaaagtag
2521 taaaaataat aaagcattaa atggatgcct agaatttaaa ttttttcgta aacaaattta
2581 cgatatctat ttagtaaata atatattgat atttttattt atttgcaatt aatagattaa
2641 aaattaattt aacgaagtga aacatcacag tagttatttt taaaaactca attgagagta
2701 gtatagtggt gagcttatac tataagtttt atttttatat aaaattgaaa attttagaat
2761 aaattaccaa agtaggtgaa agtccagtaa atttttataa atataagtta gagatggtgg
2821 ctgagtggtt aaagcggtag actgtaaatc tattgggtat ccgtcgtcgg ttcgagtccg
2881 atc
//GenBank-Updates@genbank.bio.net (01/24/91)
LOCUS TEYMTRGTG 3439 bp ds-DNA INV 24-JAN-1991
DEFINITION T.pyriformis mitochondrial ribosomal RNA large subunit, Leu- and
Met-tRNA genes.
ACCESSION M58011
KEYWORDS ribosomal RNA large subunit; transfer RNA-Leu; transfer RNA-Met.
SOURCE T.pyriformis (strain ST) mitochondrial DNA, clone HindIII/Sau3A.
ORGANISM Tetrahymena pyriformis
Eukaryota; Animalia; Metazoa; Ciliophora; Oligohymenophora;
Hymenostomata; Hymenostomatida; Tetrahymenina; Tetrahymenidae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 3439)
AUTHORS Heinonen,T.Y., Schnare,M.N. and Gray,M.W.
TITLE Sequence heterogeneity in the duplicate large subunit ribosomal RNA
genes of Tetrahymena pyriformis mitochondrial DNA
JOURNAL J. Biol. Chem. 265, 22336-22341 (1990)
STANDARD full staff_entry
FEATURES Location/Qualifiers
rRNA 670..2984
/gene="LSU-beta"
/product="ribosomal RNA large subunit"
tRNA 2987..3067
/gene="Leu-tRNA"
/product="Leu-tRNA"
rRNA 3078..3357
/gene="LSU-alpha"
/product="ribosomal RNA large subunit"
tRNA 3373..3439
/gene="Met-tRNA"
/partial
/product="Met-tRNA"
BASE COUNT 1337 a 367 c 493 g 1242 t
ORIGIN
1 aagcttgatt taatgctgtt tttggtatgc ctaaaaaaaa tacaaaatat ttacctatgg
61 atttaacatt taaagaatct tatattattt tatattgtta ttttttttta tttatatttt
121 catatttttc atttgtattc ttctaaaatt aatttaaaat aataaataaa aaattaaatc
181 tttttttaat tgaaaataaa aaaataatta ataacagcgt tttaaacaaa aataataata
241 aaaataattt taatattata aaatatttta atttaaaaaa ttacaaagaa atcaaagccc
301 tattaaatct ttttaaatgt ataagtttac taaataaatt gaacaaatct atattcatat
361 ataatgacaa ttttatcact ataataaata aaaataactt ttataaaaat ttattaacgt
421 ataaatacgt taacattgag ttgatgtcta tgttaaaaat atatatatat atgaatacat
481 ctatttttat aaacgcctca tcaagtttta taaaatttaa atcagaatat gaaacttatt
541 cagatatatt ttttgattgc tatcaccacc catttaaaag aaaaaaagct aattcattag
601 tatataaaat gtattttcta gtattatatt ttttaatata ataataataa attcaaatat
661 aatttttttt agtaaatttc aataagtttt tgaaattgaa aattagaaat ctacttctaa
721 aacttaaaaa atttaaattc tatagtaaaa agtaccgcga gggaaaggtg aaaagatttt
781 taatatctta aaagaaccta aaatttaatg ctaaatacag ttaaggcttt atgttttaac
841 gtaccttttg cataatgggc tagcgagttt atataattag cgagtaattt ataataaaat
901 aatattacga atcgatagaa aattagttaa ttatataaga cccgaagcta agtgatctaa
961 ttatggttag attaagggta tttataccta aggatcgaac tcttaaatgt tgcaaaattt
1021 tgggataaac tgtaattagg ggtgaaaggc ttatcaaact tagttatagc tggttttcca
1081 cgaaacctat ttaagtaggg tgatatttta ttataaaatt aggtttaaat aactatatct
1141 ataattaata tgttaattat aaaattagta tataataatt agttttattt aaatattaat
1201 cagactatta gcgctaaggt ttatagtcaa gagagaaaca gctcagatta aacaataagg
1261 tctacaaaag taaataattt tggagattgt ttttattatt atcaataaga tgtaggcttg
1321 gaagcagcca tcattttaaa aaagcgtaaa agcttaatat tgagtgtatt attgttttaa
1381 aataataaat ataaaaataa tcataaatga aaatagatta atttttactt accgaattga
1441 taaatcgaaa gatggtagtg gaacattttg tataaataaa taaaattgtg aaattttata
1501 tcttatcaat atagataatg ctagcatgag tagtagacat aatgtgagaa tcattatcgc
1561 ctgatgtaca agggttgcta aatttgataa tcttatttag tgtaaatcgg tttctaaaat
1621 ttaaatgtat atttttattg atgaatacga aatataaaat tcttaataat ctattaaata
1681 tattacataa aattttttgt aatatattta tttaatggat tagttgctgg aaatgtttat
1741 atttttttta ccgtactaac tctaacacaa gtgtacaagt agaatatata atggcgaagg
1801 agtaaaaagt attgaaggaa ctaggcaaat tgactctgta acttcgggag aaagagggct
1861 ttaagcaact aaaaagagag agtagcgact gtttaataaa aacataagat tttgctaaat
1921 ttaaatacga agtataaaat ctgacacctg cccggtgctg caaggtgaac aaattttggt
1981 aaacgctaaa attttaaacc ccagtaaacg gcggccgtaa ccctgacggt cctaaggtag
2041 caaaattcct tggcgggtaa gttccgtcct gcatgaatgg tgtaacgact gctctgctgt
2101 ctccaatact agctctacga aattgaattt tccgtgaaga tgcgacaata ttacaactag
2161 acgggaagac cctatgcacc tttactgtta tctgtaaata attttttttt ataattaact
2221 agacaagtag gaaatttata ttaaaaatgg aaaactactt aattatattt aaaaattaaa
2281 aataaattaa tcataatatt aattaattat tttgttatag aaagacagtt tgactggggc
2341 ggtctcctcc taaaaagtaa cggaggagta taaaaactcg gggtatctta ttttaattaa
2401 gatcaatatt aaaatgaatt ttactgagtt tgattagagt acttacaagt attctaagga
2461 tatatgtcta tcatattgac ccgatataat tttgtagaaa atatatcgat caacgaataa
2521 aaggtacgct agggataaca ggcttatgag ttttgagagt tcttattaat aaactcgttt
2581 ggcacctcga tgtcggctca tcacatcctg atggtggaca atctatcaag ggtccggctg
2641 ttcgccggtt aaagtggtac gtgagctggg tttaaaacgt cgtgagacag tttggtccct
2701 atctgttgta attataagaa aataaataag aattaacttt agtacgagag gactaggaaa
2761 atttaatcac tggtttgaaa attattttaa taaataaaag tatggttttt aagctacatt
2821 aaacaaaata attgctgaat attatataag caagaattta acttatatta ttttctaata
2881 aattttttaa agactatatt atttaagttt ttatataagt gtagttataa ctaacgaata
2941 tataaaaaac ttataattta atatttacta cagtttagtt tatataactt atgtggcgga
3001 acaggtagac gcgtgggact taaaatctca ttccatagga gtgccggttc gattccggtc
3061 ataagtaaat ttttaaagta gtaaaaataa taaagcatta aatggatgcc tagaatttaa
3121 attttttcgt aaacaaattt acgatatcta tttagtaaat aatatattga tatttttatt
3181 tatttgcaat taatagatta aaaattaatt taacgaagtg aaacatcaca gtagttattt
3241 ttaaaaactc aattgagaat agtatagtgg tgagcttata ctataagttt tatttttata
3301 taaaattgaa aattttagaa taaattacca aagtaggtga aagtccagta aattttttat
3361 tatatacatt tagctgcttg aatggtttca gtgtgggctc atttcccatt actataaagt
3421 tcgattcttt aaagcggcc
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