GenBank-Updates@genbank.bio.net (02/01/91)
LOCUS HSS488A 6652 bp ds-DNA VRL 01-FEB-1991
DEFINITION Herpesvirus saimiri dihydrofolate reductase (DHFR) and snRNA (HSUR)
genes, complete cds.
ACCESSION M55264 M37900
KEYWORDS U RNA; dihydrofolate reductase; snRNA gene.
SOURCE Herpesvirus saimiri (strain 488) DNA.
ORGANISM Herpesvirus saimiri
Viridae; ds-DNA enveloped viruses; Herpesviridae;
Gammaherpesviridae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 6652)
AUTHORS Biesinger,B., Trimble,J.J., Desrosiers,R.C. and Fleckenstein,B.
TITLE The divergence between two oncogenic Herpesvirus saimiri strains in
a genomic region related to the transforming phenotype
JOURNAL Virology 176, 505-514 (1990)
STANDARD simple staff_entry
FEATURES Location/Qualifiers
CDS complement(454..1224)
/label=ORF1
/codon_start=454
CDS complement(1542..1850)
/label=ORF2
/codon_start=1542
CDS 1603..1914
/label=ORF3
/codon_start=1603
snRNA 2840..2982
/label=HSUR1
CDS 3069..3326
/label=ORF4
/codon_start=3069
snRNA 3311..3425
/label=HSUR2
snRNA 4030..4140
/label=HSUR5
CDS complement(4462..5103)
/gene="DHFR"
/codon_start=4462
/product="dihydrofolate reductase"
snRNA 5196..5298
/label=HSUR4
snRNA 5942..6026
/label=HSUR3
BASE COUNT 1961 a 1214 c 1062 g 2415 t
ORIGIN
1 ctgcagagca gtctggccta gggggcttca gccagggcta gctccaaaac cctcaggtcc
61 ccagacttca aacttggtgg gcacgtagag gacccttccc gctaactctc cactctgcct
121 cagaatttta gcacctggcg ctgcggagcc gggagcgtgc aagcccccag agctctgggg
181 actagctcca agcacagggg cacagcgccc ccgagcctgc ggtggcctgg ggacagcgcc
241 tagccaatgc tatgaagact agccaaggct agcttcaaac ccctcaggtc cccagacttc
301 aaacttcgta ggcacgtaca aaacccttcc cgctccctgt ccgcaccgcc tcagaatttt
361 tgtacttggc gctgctgccc caaagtctca ggcatctttc tttgcatttc ttttaatcac
421 catgcacaca catttgttaa cagttttgtt acattaactt ttcattccta tatgcagtat
481 acttagcaca gttactaata gtagtacagc taatataaca actactaaac aaataattac
541 attaattttg ttctcaagtc ttttcaaatc ttttactata tttctttcat tagctttacg
601 ctctctaggt tgtttacaat ttgattcttt tacgtgcagt cttacagtac ttgcctggcg
661 ttcacctagg ttcgctggcc taggaggcaa aggtggtgtc ggcatgcctg gatcccatgt
721 tgctgacaag tcacgtttag gttttctaaa atctggtggg tatttttcca aaaaactttg
781 taaatcctcc gacttgtgtc gcaccattcc ttttccttgt gcccttgcgt cttcaaaagt
841 tgtgtacaag ctgttcaagt ttgttagcac gttctgaggc ctgtatgtgc tagtttcatt
901 gtcaccattt tcttctataa aaacagatgc ctgcttactg ctataactgc ttgacggggc
961 tgtagtctct tcagagcagg atgacaattt cccttgaaat cctgtcagtt ctatttcttt
1021 gctgttttgt aattcatctt ctgttctgct gctgttttgt attattacat ttacttctat
1081 aggaacaggc acatgatcac tgccactact gcttgacgtg tttgtagtct cttcagagca
1141 tgatgacaat ttctcttcat cttttctttc cttctcagtc tctggaaatt ctgtcagttc
1201 tatttcttct ccttcatttg ccattgcaaa gtttgtgctg ttttgtgatt caccttctgt
1261 tctgctgctg ttttgtatta ttgcaatttg gtgcagcctt tatatagcta ttaagtaact
1321 agtttttatg actattctta cttacatatt ccttattccg gcacagaaaa aaattcctta
1381 cttactaatt tagagatatg aagaggcagc taaaaaaggt cactactttc tataccattt
1441 tattcacact tataaattta ctaataaaaa gttccacaca actaactact agatgagatt
1501 aagctacata attaatatat tctataatgc ttgctttgct cttagtttac tactaattta
1561 gacacgagta agagcgcgac tataattaat aagagtaaaa ctatgattcc aagcaataaa
1621 tttgttacaa acaatcctgg cagtcctgga ggtcctggtg gtcctggtgg tcctggtggt
1681 cctggtggtc ctggtggtcc tggaggtcct ggtggtcctg gaggtccttg tggtcctgga
1741 ggtccttgtg gtcctggagg tccttgtggt cctggaggtc ctggaggtcc tggtggtcct
1801 cgatctcctg tttcttcaat tggatatctt aggttcggtt cgcttgccat ttttttcaag
1861 actgtttgtg ttgctcttgt tagctgtttc ttgtgttact ctattttctt ctgatactta
1921 tatgttagct tagtacattt tggaaactcc tgtgaccctt catctggtgt tttacaactt
1981 accacattta tagataattt caaattcaaa ttttactatt cagattttga cttttagaaa
2041 ccagaggtta agtctgctat cccacattgc ccacttcttg tctgacacat ttctctaccc
2101 actcttacct cataacacct tgctaaactc tcaaaatata ttttctctag catgttttta
2161 gaacatatca tagtatacaa ggtactgctt gaagactttt gagattttct agcattcctc
2221 attcgcattc taatctaaat gtctagtttg taaactcttc tttctacaat aatatacctt
2281 ttgtgatatt tttctgttat ctgtacgaca tagataaagc attaacagta ttcttaaaat
2341 acaattaaat tctaaaagag ttcagctgtt tataaaagaa acagtattgc taatatttgc
2401 attaatggga tactttttag ataggactag ctttgagctt ccttatagct aagaccacgt
2461 tttatttctc tccgacttca gatattccac aaagcttagc acagggaaag aatcagcttt
2521 agttcatgtt acttaggcga ataattaaag agagagaaga aagaaacatg caaaaaaaga
2581 agctaattaa ttgttcattt aaacctggct agtgctgaaa gcaaagccat aaagatattt
2641 gtcacattgt tcttgcctct cttttccctt agtgctaatt cgagatcttc tgtctagtca
2701 atgcagcaac atcaaagcat gaggggtgag agcagtgaca tgctaggtag tagcacacac
2761 ttgtgcattt gcgtgtttac tacatagtgt ggattactta tagaagttgc aaataaagtt
2821 tacttttaac tactttaagt ggtgctggtt actttatatt tacacccagc acctacaaaa
2881 attagctttt ggatggtaca gcaagtaagg ttagttacat gttaagttat agtaaacata
2941 gtaaataaat atgtagtgta ctagaaaaga agtatttgct gttttttggt aaaaacaact
3001 aatattttag tcatggttag tttttttaac gtttattgtt gtgtacaatt tatgcaatac
3061 atgactacat gttaaagtgg agcactctgt gctttcgttt tgtacgtgca atgcagcaag
3121 cattatttct aacaattttt tttcatatgc aaattttttg tatcgctttt acttacaact
3181 caacttttaa atgtagtttg atcactactt ctagtttaac ttgttataaa gtgctctcaa
3241 cactatatac tcaaaacagc agcaaagttt acagtactga gagcacacta tatctttttt
3301 taaacttaag tagcactggt ttttagctat atacacccag tgctttcaaa aattagtaga
3361 agcaaatcct tgtgtgtgag gtttaaagca gcattaataa ataaaataca ataaatatgt
3421 agtgtgcagc tttgtacact ttgctactct tagctaaatc taaccccttc taaagtcagg
3481 actagaaatt tagacttgac atttttaact tttaatttca aaagaaccgc ctacgcgaaa
3541 ggttatgaca ttttgttctt taaaaatttt agttacgcta gatatgactg ttttttaagc
3601 ccttattagt ctgagtaata ttcaaattat tgtcccagtt tcacttttag catgcttcct
3661 gtactttttc atgctttcaa ttctagaata caccattagc ggtgtagcta tctactacca
3721 actgagctaa ttgtaagcaa ctaaaaatct aaaacactta ttatttgtag caatctagct
3781 aacattttag ttatatgctt aagttaagat tctaaggaaa aaaatatgta gacgagaagc
3841 actgatgctg ctgccatctt tgtatctttt aacaagacag tctcttaaaa tgaaagcttt
3901 tattaacttg gaattactta tcaaaagttt aaaatctcaa ttatatatag tattactctc
3961 actgctgtag tttctcgcta aagtttgaag cagtaatagc atacttgctt gtttttttac
4021 ttacgtaaaa gtagctgtta ttgagcaaca cttactgctt ctaaaaactt aggaagtaat
4081 taaaagataa tgtatgcttt tcagttacag cacagcgagc acatataaag atgtagcact
4141 ctacttttac gacatcattc taattaagtc tctttgaaga aaaatgatgt ttgattttag
4201 tttttacaat tggtctactt agtacactaa gtgacacaaa acaaaggtta aaacttttta
4261 ttgaaacaaa atattcaaaa acgtaacatg acaccagcag ttaattatta aaacttataa
4321 caataaatgt atgtataatg tttatattgc tattttaaaa acgttttgtg tatagtaaac
4381 actgttaacg ttgcatgact tttttaattt tcttaaattt taatgttttg acacaacttt
4441 aagcaagttt aaagctttta tctaggagag ctcaaaatca taactagctt ctttaggctt
4501 cactgagcaa gtgagtcctg catgactttt aaatagaaaa gtattaacaa ttttttcata
4561 tacttcaaat ttgtacttaa ttcctttttc ttcttgtgtg ttagaaggaa ctcctgggta
4621 ttctattaaa agtttataat tctttaaatc aatttctggg aaaaaagtgt ctgtttcaaa
4681 gctttgcata attcttgtta caaacagttt aagatggctt gaataattca tagcgtcttt
4741 ataaacagaa ctgcctccaa ttatccatac tctgtctact ttatttacta attctggttg
4801 ttcaataagt tttaaggcat catttaaact tctagctaga aagtgagctc catgtggaat
4861 ctctttaagt tttttactga gaactaaatt aattctgtct tttagaggtc gatttttttc
4921 aggaattgag aaccacgtat tcttacccat aattactaaa ttctgtttat tttttacaga
4981 ggaagtagtc attctctgaa aatacttaaa gtcatttata agcagtggcc aaggcaagtg
5041 gccttttttg cctataccca tattctggtc tacagcaaca atacagttta gcaaaagaac
5101 cattagttat tgtaaatact cagtttttat aactttgtaa aaacaacttt tcacttttaa
5161 acaaaagcag tgtctttttt tttcacttgc aaagttggcc ctggtttggg ctaccccaga
5221 gcctccaaaa attaactgaa tttgaaactg ttagccactc ttgctgagag gttatttgtt
5281 aagtttaaga aaaaataatc ttattgatag ttatggtaat ttcataagtt agttattttg
5341 tttgtaaaac agtttactgt tacaaaaata aaacaacagt ttgtattaat ttatcttacc
5401 accattttat ttaaataagc agagtaagta tttttagtag gagtttaagt aatattcaaa
5461 tcactttaga actttcattt taagagaaac tttcttttcc tgttcattta aagctggtag
5521 aattgtaaga cattgcaagg tatatcttgt aatgtttact tagcatgtga ataacttctt
5581 tacgttataa gctattgttt ataagtttca ggtataattg ctcaactatg gctcgaaaaa
5641 gtttttacat tcactttgtt aagcttagta catcaatata atagtacaac ttttgctttc
5701 aaacgaatgg gcagtagcat aatttaaaag atgttaaaaa ataaaatatt ttctacaagt
5761 tgcagcacaa aaaaataaac tgattataac atactatttg aattaaacag ctattttact
5821 agtttaaaaa gctatgctta gattactgaa ctttcatttt gaatcaagct ctttcccagt
5881 taaataattc tgttaactca gaaaccttcc atatatgcaa ttctgttttt aacttaacca
5941 gtggcactag tttccctaaa tttgcctaag tacctagtgc ctccaaaaat taatcggaat
6001 tatcaaagca ttttgtggat ataaagctaa tttatactga gtttagctat agcgatgctg
6061 acttcttata agttatggtg ttgtacttta atttttaaat aaaaacattc tgctttactt
6121 tttttattta aaattattga tgcaaacctt tgtgctacta tttcaagaaa acaatatatt
6181 ttttttacaa caagtttaag aaatattcaa attactttat aactttcatt ttaagaagca
6241 cgttttttcc ggtggtgttt taatcagata caaattgctt cttgttgtag ctgtatttaa
6301 aaactattgt ttaattatta aagtcaattg ctgaacaaga cttttgtggc agaaacatgc
6361 ttgtcttaca ctttgactct tatgaaactc aaattcttcc acaggaaaga ttagcgactt
6421 cagttttttt agagaatggc ccactacaag ttacgtctca caacccaacc acgactaccg
6481 gatatgtggt ttacgtaaat tcccctaata cgtcatttct tgagcctgtt cttagtaaac
6541 tgtttctcag tgtttcacag aagctacctt tttctagggt ttctgaacaa actttgtcat
6601 tttcatatgg tcctcatctt caaggttcac agacaacatt ttcaaaagat ct
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