GenBank-Updates@genbank.bio.net (04/05/91)
LOCUS PPHDNA 7808 bp ds-DNA VRL 05-APR-1991 DEFINITION Human papilloma virus type - 51 genomic DNA, partial sequence. ACCESSION M62877 KEYWORDS . SOURCE Human papilloma virus, DNA. ORGANISM Human papillomavirus Viridae; ds-DNA nonenveloped viruses; Papovaviridae; Papillomavirus. REFERENCE 1 (sites) AUTHORS Lungu,O., Crum,C.P. and Silverstein,S.J. TITLE Nucleotide sequence analysis and biologic properties of human papillomavirus type - 51 JOURNAL Unpublished (1991) STANDARD full staff_review BASE COUNT 2404 a 1430 c 1621 g 2353 t ORIGIN 1 aacaattatc ttgtaaaaac tagggtgtaa ccgaaaaggg ttatgaccga aaacggtgca 61 tataaaagtg cagtggtaaa agtatagaag aacaccatgt tcgaagacaa gagggaaaga 121 ccacgaacgc tgcatgaatt atgtgaagct ttgaacgttt ctatgcacaa tatacaggta 181 gtgtgtgtgt attgtaaaaa ggaattatgt agagcagatg tatataatgt agcatttact 241 gaaattaaga ttgtatatag ggataataat ccatatgcag tatgcaaaca atgtttactg 301 ttttattcaa aaattagaga gtatagacgt tatagcaggt ctgtgtatgg tactacatta 361 gaggcaatta ctaaaaaaag cttatatgat ttatcgataa ggtgtcatag atgtcaaaga 421 ccacttgggc ctgaagaaaa gcaaaaattg gtggacgaaa aaaaaaggtt ccatgaaata 481 gcgggacgtt ggacggggca atgcgctaat tgctggcaac gtacacgaca acgtaacgaa 541 acccaagtgt aataaagcca tgcgtggtaa tgtaccacaa ttaaaagatg tagtattgca 601 tttaacacca cagactgaaa ttgacttgca atgctacgag caatttgaca gctcagagga 661 ggaggatgaa gtagataata tgcgtgacca gctaccagaa agacgggctg gacaggctac 721 gtgttacaga attgaagctc cgtgttgcag gtgttcaagt gtagtacaac tggcagtgga 781 aagcagtgga gacacccttc gcgttgtaca gcagatgtta atgggcgaac taagcctggt 841 ttgcccgtgt tgtgcgaaca actagcaacg gcgatggact gtgaaggtac agaggatgag 901 ggggcggggt gtaatgggtg gttttttgtt gaagcaatag tagaaaaaaa aacaggagat 961 aatgtttcgg atgatgagga tgaaaatgca gatgatacag gatctgattt aataaacttt 1021 atagatagtg aaactagtat ttgcagtcag gcggaacagg agacagcacg ggcgttgttt 1081 caggcccaag aattacaggc aaacaaagag gctgtgcatc agttaaaacg aaagtttcta 1141 gtcagcccgc gaagcagccc attaggagac attacaaatc aaaacaacac acacagccat 1201 agtcaggcaa acgagtcaca agttaaaagg agattactgg acagttatcc ggacagcgga 1261 tatggcaata cacaagtgga aactgtggaa gcaacgttgc aggtagatgg gcaacatggc 1321 ggttcacaga acagtgtgtg tagtagcggg gggggcagtg ttatggatgt ggaaacaaca 1381 gaaagctgtg caaatgtaga actaaacagt atatgtgaag tattaaaaag cagtaatgca 1441 aaagcaacgt taatggcaaa atttaaagag ttgtatggta ttagttataa tgagttggta 1501 cgggtgttta aaagtgataa aacatgttgt atagattggg tttgtgcatt gtttggcgtt 1561 tccccaatgg tagcagaaaa tttaaaaaca ctaattaagc cattttgcat gtactaccat 1621 atacaatgtt tatcatgtga ttggggcacc attgtattaa tgctaattag gttttcatgt 1681 gcaaaaaaca gaacaacaat tgctaagtgt ttaagtacat tagtaaatat cccacaatca 1741 caaatgttta tagaaccacc aaaattacgt agtacacctg tggcattata tttttataga 1801 acaggcatat caaacattag caatacatat ggagagacac ctgaatggat tacacgacaa 1861 acgcaactac aacatagttt tgaggatagt acctttgaat tatcacaaat ggtgcaatgg 1921 gcatttgacc atgaagtatt agatgatagt gaaatagcat ttcattatgc acaattagca 1981 gatatagata gtaatgctgc agcgttttta aagagtaatt gccaagcaaa atatgtaaaa 2041 gattgtggga ccatggcacg gcattacaaa cgagcacaaa gaaaatcatt atctatgtca 2101 gcctggataa ggtatagatg tgatagagca aaggatggag gcaactggag agaaattgct 2161 aaatttttaa gatatcaagg tgtaaacttt atgtccttta ttcaaatgtt taaacagttt 2221 ttaaaaggaa caccaaaaca caattgcata gtcatatatg gcccaccaaa cacaggcaag 2281 tcattatttg caatgagcct aatgaagttt atgcaagggt ccattatttc atatgtaaac 2341 tctggtagtc atttttggtt acagccacta gaggatgcta aaatagcatt gttagatgat 2401 gctacgtatg ggtgttggac atatattgat cagtatttaa gaaacttttt agatggtaat 2461 ccatgtagta tagatagaaa acataggagt ttaatacaat tagtatgtcc accattacta 2521 ataacgtcaa acataaatcc acaagaggat gcaaacctaa tgtatttaca tacaagggta 2581 acagtattaa agtttttaaa tacatttcca tttgataaca atgggaatgc tgtgtataca 2641 ttgaatgatg aaaattggaa aaattttttt tccaccacat ggtccagatt agatttggag 2701 gaggaagagg acaaagaaaa tggagaccct atgccaccgt ttaaatgtgt gccaggagaa 2761 aatactagac tgttatgaac tggacagtga taaattagta gatcaaatta actattggac 2821 attgttacga tatgaagctg ctatgtttta tgcagcacgg gaaagaaact tacgaacaat 2881 caatcaccag gtagtaccag caacaacagt atcaaaacaa aaggcctgtc aagcaattga 2941 aatgcacatg gccttacaat cgcttaacaa atcagactat aacatggaac catggacaat 3001 gcgggagaca tgttatgaac tatggtgtgt ggctcccaag caatgtttca aaaagggggg 3061 cataactgta acagttatat ttgatggaaa taaggacaat gcaatggact atacaagctg 3121 gaaatttata tatatatatg ataatgataa gtgggtaaag acaaatggaa atgtggacta 3181 tacgggtata tattacactg taaattcaaa aaaagaatat tatgtacagt ttaaagatga 3241 agccaaaata tatggggcac aacagtggga ggtctatatg tatggtactg taataacatg 3301 tcctgaatat gtatctagta cctgcagcga cgcgttatcc actactacaa ctgttgaaca 3361 actatcaaac accccaacga ccaatcccct taccacctgc gtgggcgcca aagaagccca 3421 gacacaacag cgaaaacgac agcgacttac tgagcccgac tcctccacaa tctccccact 3481 gtccgtggac aatacaaaca accaaataca ctgtggaagt ggaagcacta acactggagg 3541 gcaccaaagt gcaactcaga ctgcgtttat agtgcattta aaaggtgata caaattgttt 3601 aaaatgtttt agatacagat ttacaaaaca caaagggtta tataaaaacg tatcctcaac 3661 ctggcattgg accagtaata ctaaaacagg cattgttacc attgtgtttg acagtgcaca 3721 tcaacgggaa acatttataa aaaccattaa agtaccccca agtgtaacac tgtcattggg 3781 aattatgaca ctgtaactag tgtaatatat gtattgtaca tatatactgt cacaagccaa 3841 tatgtgctgc taattgtata gacatattgt aaccattgca gtgtttatta ttttgctatt 3901 tgtgctttgc ttgtgtgtgt gtcttgtgtt gtgttgtttg ttgccgctac tgctgtccca 3961 atacgtgttt gcagctgcct tattattaat tttatgtttt tggtttgttg ttgcaacatc 4021 ccaattaact acattttttg tatatttgat ttttttttac ttaccttgtt tacttttaca 4081 tctatataca tttttacttt tgcaataaac ttgttatatt tttgtgatta aatatggtgg 4141 ctacacgtgc acggcgtcgg aagcgagcat ctgtaacaca attatattct acatgcaaag 4201 ctgctggtac atgtcctcct gatgttgtga ataaggttga aggtactaca ttggccgata 4261 aaatattaca gtggagtggg ttgggtatat ttttgggtgg cctaggtatt ggtactgggt 4321 ctggatctgg ggggcgtact ggatatatcc ctttaggtgg tgggggtcgc ccaggcgtgg 4381 tggatattgc tcctgcaagg ccacctatta taattgacct atggcaccat actgaacctt 4441 ctatagtaaa tttggttgag gactctagta ttattcagtc tgggtctcct atacctacct 4501 ttactggtac cgatggcttt gaaattactt catcttccac aacaacccct gctgtgttgg 4561 acatcacccc atctgctggt actgtacatg tttctagtac taacattgaa aatcctttat 4621 atattgaacc tccatccatt gaggctccac aatctggaga agtgtcagat atatatttac 4681 tagtacacta ctctggtact catgggtatg aagaaatacc tatggaagtg tttgcatcca 4741 atgtcagtac tggtactgaa cctattagca gcacacctac tccaggggtt agtcgcatag 4801 ctgctccccg cttgtatagt aagtcctaca cacaggttaa agttacaaat cctgatttta 4861 ttagtaagcc atccacattt gttacattta ataatcctgc ttttgagcct attgacacat 4921 ccataacttt tgaggaacct gatgctgttg cacctgatcc tgattttctg gatattatta 4981 cactgcaccg ccctgccctt acatctcgta gaggcacagt acgctttagt aggttaggtc 5041 aaaaggccac catgcgcact cgtagtggca aacaaattgg tgctcgtgta cattattatc 5101 atgatattag tagaattgca ccagctgatg aacttgaaat gcagccttta ctttcacctt 5161 ctaataatta tagttatgac atttatgctg atttagatga agctgaaaca ggttttatac 5221 agcccacaca caccacacct atgtcacact cctctttgtc taggcagttg ccctccttat 5281 cttcatctat gtcttcatct tatgcaaatg ttactattcc attttcaact acatattctg 5341 ttcctattca tacagggcct gatgtggtat tgcccacatc tcctacagta tggccttatg 5401 ttccccacac ttccattgac accaagcatt ctattgttat actaggtggg gattactatt 5461 tgtggcccta tacacattta ctacgcaaac gccgtaaacg tataccctat ttttttacag 5521 atggcattgt ggcgcactaa tgacagcaag gtgtatttgc cacctgcacc tgtgtctcga 5581 attgtgaata cagaagaata tatcacacgc accggcatat attactatgc aggcagttcc 5641 agactaataa cattaggaca tccctatttt ccaataccta aaacctcaac gcgtgctgct 5701 attcctaaag tatctgcatt tcaatacagg gtatttaggg tacagttacc agatcctaac 5761 aagtttggac tcccggatcc aaatttatat aatccagaca cagataggtt ggtgtggggt 5821 tgtgtgggcg ttgaggtggg cagaggacag ccccttggtg ttggccttag tggtcatccc 5881 ttatttaata aatatgatga cacagaaaat tcacgcatag caaatggcaa tgcacaacaa 5941 gatgttagag ataacacatc tgttgacaac aaacagactc agttatgtat aataggctgt 6001 gctccaccta ttggggaaca ctggggtatt ggcactacat gcaaaaacac acctgtacct 6061 ccaggagact gcccccccct ggaacttgta tcctctgtca ttcaggatgg cgatatgatt 6121 gatacagggt ttggagctat ggatttcgct gccctacagg ccaccaaatc agacgtccct 6181 ttggatattt cacagtctgt ttgtaaatat cctgattatt taaaaatgtc tgcagacaca 6241 tatggtaatt ccatgttttt tcatttacgc agggagcaaa tctttgctag gcactattat 6301 aataaacttg taggtgttgg ggaagacatt cctaacgatt attatattaa gggtagtggt 6361 aatggccgtg accctataga aagttatata tactctgcta ctcccagtgg gtctatgata 6421 acatctgatt ctcaaatttt taataagcct tattggctcc accgtgcgca gggtcacaat 6481 aatggcattt gctggaacaa tcagcttttt attacctgtg ttgatactac cagaagtaca 6541 aatttaacta ttagcactgc cactgctgcg gtttccccaa catttactcc aagtaacttt 6601 aagcaatata ttaggcatgg ggaagagtat gaattgcaat ttatttttca attatgtaaa 6661 attactttaa ctacagaggt aatggcttat ttacacacaa tggatcctac cattcttgaa 6721 cagtggaatt ttggattaac attacctccg tctgctagtt tggaggatgc atataggttt 6781 gttagaaatg cagctactag ctgtcaaaag gacacccctc cacaggctaa gccagatcct 6841 ttggccaaat ataaattttg ggatgttgat ttaaaggaac gattttcttt agatttagac 6901 caatttgcat tgggtcgcaa gtttttgttg caggttggcg tacaacgcaa gcccagacca 6961 ggccttaaac gcccggcctc atcggcatcc tcttcctctt cctcttcagc caaacgtaaa 7021 cgtgttaaaa agtaatgtat gttagttttt gtatgcttgt gcacactgtt gtatgcctgt 7081 atgtatatgt ttgtgtatgt actgtatgtg tttttgtgtg tgtgtgtgtt gttgttcctg 7141 tatgtatgag ttatgtatgt ttattattaa taaactatgt ggtgtgtgtg tgtgtgtttt 7201 tgcatgactg catttgtatg acatgtacgg gtgtatgtgg gtattacatt atccccgtag 7261 gtcaagggtg gtgtttcggt ggcgtcccta ttgccctacc cattttttgc agcacaacag 7321 tttatatttg tgctatttag ttatactttg tagcttccat tttgttacag ctgcagccat 7381 tttgagtgca accgatttcg gttcgtgtac ttttagtata tttgccaagt tttaaaccac 7441 aactgccagt tgtttttggc ataaaccatc atttttttat gacatagtgc atacatccgc 7501 ccgcccacgc cttgtacttg gcgcgcctta ccggcgctag tcatacaacc tattagtcat 7561 ttgtacttta acaattgttg gcacactgtt ttccgcccta taataattta actgcttata 7621 ggcatgtatt ttttggcata ttttatctta ctaattgcat agttggcagg tcaaatacta 7681 tgtttttagt gccaagtttc tatcctactt ataaaccatc ttactcatat gcaggtgtgc 7741 tacacaaatg tgttacctaa ccgatttgtg ttctgcctat gcttgcaaca ttttttctta 7801 taacattt //