GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/18/91)
LOCUS PFACRPOBC 3483 bp ds-DNA INV 18-MAY-1991
DEFINITION Plasmodium falciparum circular DNA rpoB and rpoC genes for beta and
beta-prime subunits of RNA polymerase (EC 2.7.7.6)
ACCESSION X52177
KEYWORDS RNA polymerase; RNA polymerase beta subunit;
RNA polymerase beta-prime subunit; rpoB gene; rpoC gene.
SOURCE Plasmodium falciparum DNA.
ORGANISM Plasmodium falciparum
Eukaryota; Animalia; Protozoa; Microspora; Microsporea;
Microsporida; Haemosporina; Plasmodiidae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 3483)
AUTHORS Gardner,M.J.
JOURNAL Unpublished (1990)
STANDARD full automatic
REFERENCE 2 (bases 1 to 3483)
AUTHORS Gardner,M.J., Williamson,D.H. and Wilson,R.J.
TITLE A circular DNA in malaria parasites encodes an RNA polymerase like
that of prokaryotes and chloroplasts
JOURNAL Mol. Biochem. Parasitol. 44, 115-124 (1991)
STANDARD full automatic
COMMENT *source: developmental stage=erythrocytic; clone=pfS35;
From EMBL 26 entry PFCRPOBC; dated 15-JAN-1991.
FEATURES Location/Qualifiers
CDS <1..2091
/note="RNA polymerase beta subunit (697 AA)"
/codon_start=1
CDS 2097..>3483
/note="RNA polymerase beta-prime subunit (AA 1- 462) (3483
is 1st base in codon)"
/codon_start=2097
BASE COUNT 1571 a 197 c 282 g 1433 t
ORIGIN
1 gatcaagtaa ataatttatc tgaaataaat caaaaattta aaataaatat gataactaca
61 ggattaaatt ctaaatttat tttaaataat gatttaagag aattacctag aaatatatta
121 gggtatatca gtttaataaa tactaatgaa ggattaactt gtggtttagt taattattta
181 actacaaata tatttttaaa tttaaaatat ttattcgtaa tatattataa acatatattt
241 tataatagat ataattttaa gttattatta aatatattta ataaaaattt ttataatatt
301 agttttaata atatttattt aaaaaaaaat attaatttta ataaaacaac tattttaaca
361 ataaataaaa atacatttaa aatatgtaat ataacacaaa atattattta catacctttt
421 aattatttat tatcttttat tgaaaattta ataccattta tacattataa tgattctatt
481 agaaatttaa tgagtataaa aatgcatact caaattgttc ctattatata tccaaattta
541 agtaatatta ttactaatta taattttatt ttaaataaat atttaaatca tttaattatt
601 tcatatcaag aaggaatagt tatatatgtt tcttgtataa aaataataat aagagattta
661 tttaatagac aaataattta ttatttaaat aattataaaa aaataaatca aaatatatta
721 ttaatttata aacctattgt atgggtaggg gaaaaagtta atattggtca gattttagct
781 ataaattcta atttattaaa tagtgaatat agtttaggaa ataatttatt agtaggttat
841 ggttcttatt taggatatga atatgaagat gctattataa ttagtagaaa aattttatat
901 aataatttat atacttcatt acatttgaat atttatgaaa tatctttaaa tataattaat
961 aatataccag aaatatgtag tataaattta tctaaaatgt attataaaaa tattaaacat
1021 ttagataaat atggtataat aaaagaaggt acatatatat tagctaataa tatattaatt
1081 tcaaaattaa tgtttatgcc ttttatattt aataataaaa gtttaattaa tattattaat
1141 tttttatttg gtagtaaatt aagaatattt aaaaataaac ctattatttc tactattcat
1201 gatataggta gggttattaa aatagaaata ttaccaaatc atttatataa taaaacagaa
1261 aaaaataata tatatttaaa atttagaata tatattggta tacaaaaata tttacaatta
1321 ggagataaaa tatgtaatag acatggacat aaaggtatta tatcttatat tagtgaaata
1381 aatgatatac catatttaaa taataaaatt caacctgata tatttataag tgctataagt
1441 ataccttcta gaataaatat aggtcaaata tttgaaggaa tatatgggtt aaatagttta
1501 tatttaaata ctagatatat aatatcaaat aatttaaata aaaattatta taacaattat
1561 aatcatattt ttaattatta taaatataat tataataata attttaatat aaatagtaaa
1621 atgtcttata attataataa atattattta aaaaatccat ttactggtaa tatgattaat
1681 aatagtattt gtttaaataa tatttattat tataaattaa ttcatatgat aaaagataaa
1741 tttagatata gatttatagg tttatattct gaattaactc aacaaccaat aaaaggtaat
1801 acaaaacaag ggggtcaaag atttggagaa atggaagtat gggctttaga agcttttgga
1861 gcttcttatt tatttaaaga attttttact tataaatctg atgatattaa aagtagaaaa
1921 atattaaaaa attatttatt taataattat aaaataaaaa atacttttat atcagaaact
1981 tttaaattaa ttttaaaaga gttacaaagt ttagctatta atatagaagc tttttgtata
2041 tttaatgata caaataattt attagaaaat ttacctatta atataattta ttaataatga
2101 taatacataa taatataaat tttataggat taaaattaaa tatattaaat cctaaacaaa
2161 taataaaatg gtcttcaata ttttataaaa ataaaattat aatcggagag gtattaatac
2221 ctaatacaat aaattttaat acaggattac caattttaaa tggtttattt tgtgaaaaaa
2281 tatttgatta tatgtataaa tggaattgta attgtaataa aaaaatgtat aatataaata
2341 atttttcatt ttttttatat tgtaaatttt gtaaaaataa attaataata aatataaata
2401 gaaaatataa attaggtttt atatttttaa atattccaat tttacattta tggtatttaa
2461 ctggtccttt aaaagtagct tcattattat taaataaaaa tgttttttat ttaaaatttt
2521 taatttatta taaatatttt tttagtaata ttaaatataa gcagtatttt tattataata
2581 aattattttc aaaaataaat ttatataaaa aaaaatataa aaatattatt caatatttat
2641 tttctcataa tattttatat aaaaagttac aaaatataaa tttattaact gaattattaa
2701 ataataaaga attattatta attaataata aatattataa taaaaaatat ttatataaaa
2761 aaattaattt atttaattta tttatattaa ataatataaa accaaattgg atatttttag
2821 atttattacc aatattacct gcaggattaa gaccttattt ttatataaat aatagtacat
2881 atattatatc tactataaat gaaaattata gattaataat tttaaaaaat aataaattaa
2941 aatattggtt atatttacgt aataatattt tttttatatt tgaaataata gaaaaaagat
3001 tattacaaca attaattgat tatttattga taaataaatt aattttaaaa aataataata
3061 ctttttttaa ttttagtaaa acttttcaag gtaaatatag tacaattaaa tataaattat
3121 taggtaaaag agttgatttt tccggtagat ctgttataac tgtaaatcca agtattatat
3181 ataataatat tggattacct tattatatta gtataaattt atttaagcct tttttaataa
3241 atatattaaa atataatagt aaattaaata taatatttaa aagtttatta attaataaaa
3301 atttatttat tatacaaaaa tttttaaata gattattaca aaatcaattt attattataa
3361 atagagctcc tacattacat agaatgaatt tacaatcttt taaaccttta ttaactgaag
3421 gttattcatt aaaattttat ccattaggat gtacaagttt taatgcagat tttgatgggg
3481 atc
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