GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/18/91)
LOCUS PAR168G 8511 bp ds-DNA INV 18-MAY-1991 DEFINITION Paramecium 168G gene for 168G surface protein ACCESSION X52133 X52026 KEYWORDS 168G gene; antigen; surface antigen; surface protein. SOURCE Paramecium primaurelia DNA. ORGANISM Paramecium primaurelia Eukaryota; Animalia; Protozoa; Ciliophora; Oligohymenophora; Hymenostomata; Hymenostomatida; Tetrahymenina; Glaucomidae. REFERENCE 1 (bases 1 to 8511) AUTHORS Prat,A. JOURNAL Unpublished (1990) STANDARD full automatic REFERENCE 2 (bases 1 to 8511) AUTHORS Prat,A. TITLE Conserved sequences flank variable tandem repeats in two alleles of the G surface protein of Paramecium primaurelia JOURNAL J. Mol. Biol. 211, 521-535 (1990) STANDARD full automatic COMMENT SWISS-PROT; P17053; G168$PARPR. *source: strain=168; TAA and TAG code for Gln (Q) in Paramecia. Data kindly reviewed (23-MAY-1990) by Prat A. From EMBL 26 entry PP168G; dated 08-JUN-1990. FEATURES Location/Qualifiers CDS 286..8397 /note="168G protein (AA 1-2704)" /codon_start=286 misc_feature 3466..4557 /note="5 tandem repeats" BASE COUNT 2764 a 1450 c 1677 g 2620 t ORIGIN 1 aattccgcat tagtttatag ttgtgaatat aatataagta atttaatcta ataccaaggt 61 tcttatggtt ccaatctgag ttttctaaat tttgaagtta tctccatctt cccttataac 121 ataaaataca tataataaat taattaatga cgacgattaa tatcatattt aaattctgat 181 ttacaaacaa gaaaatatta ttagatcatt aattaaatta aaatatttaa tttgaaaacg 241 aatttaaaag cgatatccag ttttatttga attttaatac ttttaatgaa taataaattc 301 atcatattct cattgttgct tgctttagta gcaagtcaaa catacagttt aacatcatgc 361 acatgtgcat aattgttatc agaaggagat tgcatcaaaa atgtttcact tggatgttca 421 tgggatacaa caaagaaaac ttgtggagtt tcaacaactc ctgtcactcc aacagtgact 481 tatgcagcat attgtgatac atttgctgaa acagattgtc caaaagctaa accatgtact 541 gattgtggta actacgccgc ttgtgcttgg gttgaaagca aatgtacatt ctttacagga 601 tgtacacctt ttgctaaaac acttgattct gaatgttaag caatcagtaa tagatgtatc 661 accgatggaa ctcattgtgt tgaagttgat gcttgtagta cttacaaaaa gtaacttcca 721 tgtgtcaaaa atgctgccgg aagcttatgc tattgggata caacaaataa cacttgtgat 781 aaattaccag caacattcgc aacagacaaa gattgcagag atgtaatttc aacttgtaca 841 acaaaaaccg gaggtggatg tgttgatagt ggaaataact gcagcgatta aacattagaa 901 attcaatgtg tttggaataa attaaaaaca acttcttgct attgggatgg agctgcatgc 961 aaagatagaa tttgtgataa tgccccaaca agtttgacaa ctgatgatgc ttgtaagaca 1021 tttagaactg atggaacatg cacaacaaaa gcaaatggag gttgtgtaac tagaactaca 1081 tgtgctgctg caacaattta agcatcatgt atcaaaaata gttcaggtgg tgattgttat 1141 tggacaggaa ctgcctgtgt cgataagaca tgtgcaaatg ctccaactac catgacaact 1201 aattcagcat gtgcaggatt tgttacagga tgtatcacta aatctggtgg tggttgtgtt 1261 gctaatggag cttgttctgt tgctaatgtt caagcagctt gcgttaaaaa ttcaagcaat 1321 tttgattgca tttgggatac aacttgtaaa gaaaaaacat gtgccaatgc ccctacaact 1381 aataacactc atgatttatg tacttcttat ttatctactt gtaccgttaa gtcaggtggt 1441 ggatgttaaa atagatcatg tgccaatgct ccaacaacaa tgactactaa tgatgcatgt 1501 gaagcttatc tcactggaaa taattgtata acaaaatcag gaggtggatg tgttacaaat 1561 acaacatgtg ctgcaataac tttagaagct gcttgtgtta agaattcttc tggatcaact 1621 tgtttctggg atactgcaag ttcaagctgt aaagataaaa catgtgtgaa tgctccagca 1681 actaacacta ctcatgatct ctgctaagcc ttcttaaata cctgtacagt aaattcaaca 1741 agcgcaggat gtgttgaaaa aacatgtgaa aattcattgg ttttggctat ttgtgataaa 1801 gatacaagta gtagagcatg catttggaaa ggaaaatgct ataagaaata atgtgtgtta 1861 gcttcatctg ccacaactac tcacgctgac tgttaaactt atcactctac atgtaccttg 1921 agcaattcag gaactggatg tgttccactc ccccttaaat gtgaagctat cactattgaa 1981 gctgcttgca atttgaaagc taatggttaa ccatgtggat ggaatggatc ttaatgtatt 2041 gataaagctt gctcaactgc ctctaagaca ttcactacaa cttcataatg cacagggcac 2101 atatcaactt gtgttgcaaa taatcctgta actgttaatg gttctttgac aatttaagga 2161 tgttaagatt taccaacatc atgcgcagct agaaaatcat cagaaaattg cgaaatcgca 2221 agagttggat tcccaacatg tttatgggtc tcatcttcta cttcatgtgt tgaaaaatca 2281 tgcgctactg ctagtacagt gggaacaaca ggtgcactct ctgcaggagg atttactttt 2341 tctggttgtt aaacttattt aaatacttgt atttcaaata atactgctga tgggtgcata 2401 gctaaaccat ctagttgttc atcattagtt tcatccaatt gtagagatgg atctaaggca 2461 agtggagatt gttattggaa tggaagtagt tgtgttgata agacttgtgc aaatattacc 2521 ttaacttctc atgccagttg ttatagtata ttcaattaat gcacagtgaa taatggagga 2581 acagcatgtt aaacattggc aactgcctgc acatcttatt caacataaga aaattgtaaa 2641 ttcacatcaa caaataagaa ttgtgtttgg accggattag cttgtagaaa tgccacttgt 2701 gctgatgctc cagatactac tgcttatgat agcgatacag aatgcttagc ttacccaaca 2761 ccaagcgaaa cttgtacagt tgtctacaaa gttggagctt aaggatgtgt atcaaaatca 2821 gcaaattgtt cagattatat gacatcagct taatgccata aaactctcac aaatctaaca 2881 gcaaatgacg attgtaagtg gattgttgat agatgttatg cattgtcctc ttttgctaca 2941 ggagcttgca caacattcaa aggtaataaa acaatgtgtg aaggatatag agcaggatgt 3001 acaaatactg taggtgcagc atcttcagct tcttgtacct tagattgtac tttaaaaaca 3061 ggatcaggtt tgacatttgc agattgctaa gcattggatt ctacatgttc agtcaaaaaa 3121 gatggcactg gttgtattgt tatataatct acttgtgctg gatacggatc gacagcaact 3181 aattgtttca gatcaagtgc aagtggaact gcaggatact gtgcaatgaa cacaaattgc 3241 caatcagtga cttcggctgc agaatgtgca ttcgtgactg gtttaacagg tttggatcat 3301 tcgaagtgtt aattatatca ttcttcttgt acatccttaa aagacggaac tggatgttaa 3361 gagtataaga ctgcttgctc aagttatgca actggaaaca cttgtgctaa ctctgtttaa 3421 ggtaaatgtt ttgatgatgc tactgattgc ttgcgttttg ctaattgtgc ttcaattact 3481 ggaactggat taaccaatac tatttgtgta acttatgacc caggttgtgt agcaaatgtt 3541 aatggaacag cttgctaaga aaaattagca acatgtgctg cttatttaac acaaaattct 3601 tgttctacct caactgccgg tacttgtgca tggagcggat cagcttgtct tacagttgtt 3661 gatgccaatg ttgctacaga atgtgcctat attactggaa ctggccttac aaatgctata 3721 tgtgcaggat ataatgcaaa atgtacagta aatagagctg gaacagcatg tcaaaaaaaa 3781 gaggcccttt gtgctacata tgctgcagta taggcaactt gttcataatc agatgcaggt 3841 ctttgtgcat ggagcggatc agcttgtctt acagttgttg atgccaatgt tgctacagaa 3901 tgtccctata ttactggaac tggccttaca aatgctatat gtgcaggata taatgcaaaa 3961 tgtacagtaa atagagctgg aacagcatgt caaaaaaaag aggccctttg tgctacgtat 4021 gctgcagtat aggcaacttg ttcataatca gatgcaggtc tttgtgcatg gagcggatca 4081 gcttgtctta cagttgttga tgccaatgtt gctacagaat gtccctatat tactggaact 4141 ggccttacag atgctatatg tgcaggatat aatgcaaaat gtacagtaaa tagagctgga 4201 acagcatgtc aaaaaaaaga ggccctttgt gctacgtatg ctgcagtata ggcaacttgt 4261 tcataatcag atgcaggtct ttgtgcatgg agcggatcag cttgtcttac agttgttgat 4321 gccaatgttg ctacagaatg tccctatatt actggaactg gccttacaaa tgctatatgt 4381 gcaggatata atgcaaaatg tacagtaaat agagctggaa cagcatgtca aaaaaaagag 4441 gccctttgtg ctacatatgc tgcagtatag gcaacttgtt cataatcaga tgcaggtctt 4501 tgtgcatgga gcggatcagc ttgtcttaca gttgttgatg ccaatgttgc tacagaatgt 4561 gcctatatta ctggaactgg ccttacagat gctatatgcg caggatataa tgcaaagtgt 4621 accaatctaa aagacggtac tggttgttaa gatgaaaaag ccacttgtaa gttatacaca 4681 acataaaata aatgcacttc ataaacaaca ggccctcttt catgtctttg gtttgataac 4741 tcttgctctc ccatcactga tgtaacttgt agtgcaattg tacaatcagg ccttgatcat 4801 gctcaatgtt aagcatacag cacaggttgt acatctgttt ctgatggaag caaatgttaa 4861 gactttaaaa caacttgcga ataatatgca ggcacagctt taagctgcac aaaaactgct 4921 acctcaaaat gttatttata aggttctaat tgtattacta tttcaaatgt tgcaaccgat 4981 tgcgctaaaa taactggatc tgctggaact ataacatatg aaatttgcta atcgtataat 5041 acaggttgta gcgtaaatag agcaagaagt gcttgtgtct aataataagc ataatgttca 5101 ggatatacta gtgcaatgac aagttgttat aaatcaggag ctggtttatg tattgcaagt 5161 acaaatacag atactgcttg tgtagctgca acagctgcaa caacttgtga tgctgtttat 5221 ttaggaacag gaaattacag cagtgcaaat tgtaatgaaa tgaaggctgg atgcacaaat 5281 aatggagcaa ctgcatgtgt agcaaaaact tgtgcaaatg ctgtggttat atttaatcat 5341 acaaattgca atggttatct caatacctgt actgtaaatt ctggaaacag tgcatgccaa 5401 actatggcat ctaaatgtgc agattaaact caagcatctt gcctttactc agttgaagga 5461 gaatgtgtag tagtaggtac atcatgcgta agaaagactt gtgatactgc agcaactgat 5521 gctactcgag atgatgacac tgaatgttca gcttattagc aatcttgtac tgttgctaga 5581 ttaggagctt gccaagccag agctgcttgt gcttcttaca aatcttcact ctaatgtaaa 5641 tttaatacta gtggtggaag atgtttctgg aacccaacta ataagacatg tgttgatttg 5701 aattgcggca acatagaagc ctcaacttta tacgatactc ataatgaatg tgttgttgtc 5761 gatgcaacac tcgcttgcac agttagagca acaaatggag ctgccgttta agggtgtatg 5821 gctagaggag catgcagttc atatacaatt gaagaacaat gtaaaactaa cgcaagtaat 5881 ggtgtttgtg tttggaatac aaatgctaat ttaccagcac ctgcttgcta agataagtct 5941 tgtaccagtg ctccaacatc cactacaact cataatgatt gctatgctta ctacaatact 6001 gcaacagtaa aatgtactgt tgttgccact ccaagcaata gtggtggtaa tccaacttta 6061 ggaggatgtt aacagactgc tgcttgttca agttatattg ataaagaata atgttaaatc 6121 aacgccaatg gtgaaccatg tggatggaat ggaacataat gtgctgacaa atcttgtgct 6181 actgctcctg caactgcaga ttatgatgat gatactaaat gtagagctta cattactaat 6241 aaatgtacag tctcagattc tggataagga tgtgtagaaa ttcctgctac ttgtgaaact 6301 atgacataga aataatgtta ttataataag gctggagatc cttgctattg gacaggaaca 6361 gcttgtatta caaaatcatg tgacaatgct cctgatgcaa ctgctactgc tgatgaatgt 6421 aatacctatt tagctggatg tactttagat aatgttaaat gtaaaactaa agtttgtgaa 6481 gattttgcct ttgctactga tgctttatgc aaacaagcaa tctctacatg tacaacaaat 6541 ggaacaaatt gtgttacaag aggaacatgc ttctaagcct taagtcaagc tggatgtgtc 6601 acatcctcga caaattaata atgtgaatgg ataccagctg ttttaaatgc ttcaaatgta 6661 atcacctcac ctgcttattg tacaatcaaa aattgtagca ctgctccaat taccttaaca 6721 agtgaagctg cttgcgctgg atattttaca aattgtacaa caaagaatgg tggaggatgc 6781 gttactaaat caacttgctc agctgtcact attgatgtag cttgcacaac tgctttgaat 6841 ggtactgtat gtgcttggga tagtgcataa aataaatgca gagataaaga ttgctaagat 6901 tttagtggaa ctactcatgc tgcatgttag gcttaaagag ctggatgtac agctggagct 6961 agtggaaaat gtgctagagt ataaaattgt gaacaaactt cagtaagagc agcttgcata 7021 gaaggaacaa atggaccatg cttgtggatt gataaatatc aaaatactga tggaactaaa 7081 ggagcttgtt tcagatatac atcatgcaag agtttaaatt ggaataatga tagttcatgc 7141 aaatggataa gtaataaatg cacaactaat ggttcaaatt gtgttggtat tactttatgt 7201 tcagaaacta acactgatgg aggttgtgtc actggatatg atggagcttg tattcaatca 7261 gtaccagcct tgaattcttc agatccaaaa gtatgtaaac cttacacctc atgtgctgat 7321 gctttctaca caactcattc agattgttaa attgctagta gcaaatgcac aacaaatgga 7381 acaactggct gcatagcttt aggatcatgc tcatcatata ctgcttaggc tggatgttac 7441 ttcaacgata agggaactct atatacatct ggagttatta catccactgg tatttgtaca 7501 tgggatacta catcaagtag ttgcagagat taatcttgtg ctgatttgac aggcacaact 7561 catgcaacat gttcttcata attatctacc tgcacatcag atggaactac ttgtttactt 7621 aaaggagcct gtacatctta cacaacttaa actgcttgca caacagcagt tggatctgat 7681 ggagcatgct actgggaatt agcatctgct acaaataata atactgcaaa atgtagatta 7741 cttacttgtg ctgatattca aaatggaaca gcaactaacg tttgttctgt agccttgtca 7801 acttgtgttt caaatggaac tgcatgcatt ccaaaagcca attgctcaac atatacatct 7861 aagatagcat gtaattctgg aggtttggat ggaatttgtg tattcactta atcaacagca 7921 actggagctg ctgctggaac tggaacttgt gcattaatga ctgcatgtac cgttgctaat 7981 aatgattaaa cagcctgcta agctgccaga gatagatgtt cttggactgc tgcttcagga 8041 actggagcaa ccgcagttgc tagtaaatgt gctactcata cttgtgctac aaattaagct 8101 accaacggag cttgtacaag attcttaaat tgggataaaa agacttaata ggtttgtact 8161 ctagtaagcg gagcctgcac agcaacagat ccatcaacat tgtcttcaaa cgattgcttc 8221 ttagtttctg gatatacata tacttggaat gcatcaacaa gcaaatgcgg agtttgcaca 8281 gcagttgtag tttaaccaaa taccacagac aataatacca acactacaga taataacaca 8341 acaacagact caggatacat tcttggattg tctattgttt taggatatct tatgttctga 8401 tgagaatgat ttttaaatat atatagggaa aattttataa aatacacaaa aaaatcatct 8461 ttctattcat tattttttgt ctacaattat taaactttct tgcatgttta g //