[bionet.molbio.genbank.updates] Paramecium 168G gene for 168G surface protein

GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/18/91)

LOCUS       PAR168G      8511 bp ds-DNA             INV       18-MAY-1991
DEFINITION  Paramecium 168G gene for 168G surface protein
ACCESSION   X52133 X52026
KEYWORDS    168G gene; antigen; surface antigen; surface protein.
SOURCE      Paramecium primaurelia DNA.
  ORGANISM  Paramecium primaurelia
            Eukaryota; Animalia; Protozoa; Ciliophora; Oligohymenophora;
            Hymenostomata; Hymenostomatida; Tetrahymenina; Glaucomidae.
REFERENCE   1  (bases 1 to 8511)
  AUTHORS   Prat,A.
  JOURNAL   Unpublished (1990)
  STANDARD  full automatic
REFERENCE   2  (bases 1 to 8511)
  AUTHORS   Prat,A.
  TITLE     Conserved sequences flank variable tandem repeats in two alleles of
            the G surface protein of Paramecium primaurelia
  JOURNAL   J. Mol. Biol. 211, 521-535 (1990)
  STANDARD  full automatic
COMMENT     SWISS-PROT; P17053; G168$PARPR.
            
            *source: strain=168; TAA and TAG code for Gln (Q) in Paramecia.
            
            Data kindly reviewed (23-MAY-1990) by Prat A.
            
            From EMBL 26   entry PP168G;  dated 08-JUN-1990.
FEATURES             Location/Qualifiers
     CDS             286..8397
                     /note="168G protein (AA 1-2704)"
                     /codon_start=286
     misc_feature    3466..4557
                     /note="5 tandem repeats"
BASE COUNT     2764 a   1450 c   1677 g   2620 t
ORIGIN
        1 aattccgcat tagtttatag ttgtgaatat aatataagta atttaatcta ataccaaggt
       61 tcttatggtt ccaatctgag ttttctaaat tttgaagtta tctccatctt cccttataac
      121 ataaaataca tataataaat taattaatga cgacgattaa tatcatattt aaattctgat
      181 ttacaaacaa gaaaatatta ttagatcatt aattaaatta aaatatttaa tttgaaaacg
      241 aatttaaaag cgatatccag ttttatttga attttaatac ttttaatgaa taataaattc
      301 atcatattct cattgttgct tgctttagta gcaagtcaaa catacagttt aacatcatgc
      361 acatgtgcat aattgttatc agaaggagat tgcatcaaaa atgtttcact tggatgttca
      421 tgggatacaa caaagaaaac ttgtggagtt tcaacaactc ctgtcactcc aacagtgact
      481 tatgcagcat attgtgatac atttgctgaa acagattgtc caaaagctaa accatgtact
      541 gattgtggta actacgccgc ttgtgcttgg gttgaaagca aatgtacatt ctttacagga
      601 tgtacacctt ttgctaaaac acttgattct gaatgttaag caatcagtaa tagatgtatc
      661 accgatggaa ctcattgtgt tgaagttgat gcttgtagta cttacaaaaa gtaacttcca
      721 tgtgtcaaaa atgctgccgg aagcttatgc tattgggata caacaaataa cacttgtgat
      781 aaattaccag caacattcgc aacagacaaa gattgcagag atgtaatttc aacttgtaca
      841 acaaaaaccg gaggtggatg tgttgatagt ggaaataact gcagcgatta aacattagaa
      901 attcaatgtg tttggaataa attaaaaaca acttcttgct attgggatgg agctgcatgc
      961 aaagatagaa tttgtgataa tgccccaaca agtttgacaa ctgatgatgc ttgtaagaca
     1021 tttagaactg atggaacatg cacaacaaaa gcaaatggag gttgtgtaac tagaactaca
     1081 tgtgctgctg caacaattta agcatcatgt atcaaaaata gttcaggtgg tgattgttat
     1141 tggacaggaa ctgcctgtgt cgataagaca tgtgcaaatg ctccaactac catgacaact
     1201 aattcagcat gtgcaggatt tgttacagga tgtatcacta aatctggtgg tggttgtgtt
     1261 gctaatggag cttgttctgt tgctaatgtt caagcagctt gcgttaaaaa ttcaagcaat
     1321 tttgattgca tttgggatac aacttgtaaa gaaaaaacat gtgccaatgc ccctacaact
     1381 aataacactc atgatttatg tacttcttat ttatctactt gtaccgttaa gtcaggtggt
     1441 ggatgttaaa atagatcatg tgccaatgct ccaacaacaa tgactactaa tgatgcatgt
     1501 gaagcttatc tcactggaaa taattgtata acaaaatcag gaggtggatg tgttacaaat
     1561 acaacatgtg ctgcaataac tttagaagct gcttgtgtta agaattcttc tggatcaact
     1621 tgtttctggg atactgcaag ttcaagctgt aaagataaaa catgtgtgaa tgctccagca
     1681 actaacacta ctcatgatct ctgctaagcc ttcttaaata cctgtacagt aaattcaaca
     1741 agcgcaggat gtgttgaaaa aacatgtgaa aattcattgg ttttggctat ttgtgataaa
     1801 gatacaagta gtagagcatg catttggaaa ggaaaatgct ataagaaata atgtgtgtta
     1861 gcttcatctg ccacaactac tcacgctgac tgttaaactt atcactctac atgtaccttg
     1921 agcaattcag gaactggatg tgttccactc ccccttaaat gtgaagctat cactattgaa
     1981 gctgcttgca atttgaaagc taatggttaa ccatgtggat ggaatggatc ttaatgtatt
     2041 gataaagctt gctcaactgc ctctaagaca ttcactacaa cttcataatg cacagggcac
     2101 atatcaactt gtgttgcaaa taatcctgta actgttaatg gttctttgac aatttaagga
     2161 tgttaagatt taccaacatc atgcgcagct agaaaatcat cagaaaattg cgaaatcgca
     2221 agagttggat tcccaacatg tttatgggtc tcatcttcta cttcatgtgt tgaaaaatca
     2281 tgcgctactg ctagtacagt gggaacaaca ggtgcactct ctgcaggagg atttactttt
     2341 tctggttgtt aaacttattt aaatacttgt atttcaaata atactgctga tgggtgcata
     2401 gctaaaccat ctagttgttc atcattagtt tcatccaatt gtagagatgg atctaaggca
     2461 agtggagatt gttattggaa tggaagtagt tgtgttgata agacttgtgc aaatattacc
     2521 ttaacttctc atgccagttg ttatagtata ttcaattaat gcacagtgaa taatggagga
     2581 acagcatgtt aaacattggc aactgcctgc acatcttatt caacataaga aaattgtaaa
     2641 ttcacatcaa caaataagaa ttgtgtttgg accggattag cttgtagaaa tgccacttgt
     2701 gctgatgctc cagatactac tgcttatgat agcgatacag aatgcttagc ttacccaaca
     2761 ccaagcgaaa cttgtacagt tgtctacaaa gttggagctt aaggatgtgt atcaaaatca
     2821 gcaaattgtt cagattatat gacatcagct taatgccata aaactctcac aaatctaaca
     2881 gcaaatgacg attgtaagtg gattgttgat agatgttatg cattgtcctc ttttgctaca
     2941 ggagcttgca caacattcaa aggtaataaa acaatgtgtg aaggatatag agcaggatgt
     3001 acaaatactg taggtgcagc atcttcagct tcttgtacct tagattgtac tttaaaaaca
     3061 ggatcaggtt tgacatttgc agattgctaa gcattggatt ctacatgttc agtcaaaaaa
     3121 gatggcactg gttgtattgt tatataatct acttgtgctg gatacggatc gacagcaact
     3181 aattgtttca gatcaagtgc aagtggaact gcaggatact gtgcaatgaa cacaaattgc
     3241 caatcagtga cttcggctgc agaatgtgca ttcgtgactg gtttaacagg tttggatcat
     3301 tcgaagtgtt aattatatca ttcttcttgt acatccttaa aagacggaac tggatgttaa
     3361 gagtataaga ctgcttgctc aagttatgca actggaaaca cttgtgctaa ctctgtttaa
     3421 ggtaaatgtt ttgatgatgc tactgattgc ttgcgttttg ctaattgtgc ttcaattact
     3481 ggaactggat taaccaatac tatttgtgta acttatgacc caggttgtgt agcaaatgtt
     3541 aatggaacag cttgctaaga aaaattagca acatgtgctg cttatttaac acaaaattct
     3601 tgttctacct caactgccgg tacttgtgca tggagcggat cagcttgtct tacagttgtt
     3661 gatgccaatg ttgctacaga atgtgcctat attactggaa ctggccttac aaatgctata
     3721 tgtgcaggat ataatgcaaa atgtacagta aatagagctg gaacagcatg tcaaaaaaaa
     3781 gaggcccttt gtgctacata tgctgcagta taggcaactt gttcataatc agatgcaggt
     3841 ctttgtgcat ggagcggatc agcttgtctt acagttgttg atgccaatgt tgctacagaa
     3901 tgtccctata ttactggaac tggccttaca aatgctatat gtgcaggata taatgcaaaa
     3961 tgtacagtaa atagagctgg aacagcatgt caaaaaaaag aggccctttg tgctacgtat
     4021 gctgcagtat aggcaacttg ttcataatca gatgcaggtc tttgtgcatg gagcggatca
     4081 gcttgtctta cagttgttga tgccaatgtt gctacagaat gtccctatat tactggaact
     4141 ggccttacag atgctatatg tgcaggatat aatgcaaaat gtacagtaaa tagagctgga
     4201 acagcatgtc aaaaaaaaga ggccctttgt gctacgtatg ctgcagtata ggcaacttgt
     4261 tcataatcag atgcaggtct ttgtgcatgg agcggatcag cttgtcttac agttgttgat
     4321 gccaatgttg ctacagaatg tccctatatt actggaactg gccttacaaa tgctatatgt
     4381 gcaggatata atgcaaaatg tacagtaaat agagctggaa cagcatgtca aaaaaaagag
     4441 gccctttgtg ctacatatgc tgcagtatag gcaacttgtt cataatcaga tgcaggtctt
     4501 tgtgcatgga gcggatcagc ttgtcttaca gttgttgatg ccaatgttgc tacagaatgt
     4561 gcctatatta ctggaactgg ccttacagat gctatatgcg caggatataa tgcaaagtgt
     4621 accaatctaa aagacggtac tggttgttaa gatgaaaaag ccacttgtaa gttatacaca
     4681 acataaaata aatgcacttc ataaacaaca ggccctcttt catgtctttg gtttgataac
     4741 tcttgctctc ccatcactga tgtaacttgt agtgcaattg tacaatcagg ccttgatcat
     4801 gctcaatgtt aagcatacag cacaggttgt acatctgttt ctgatggaag caaatgttaa
     4861 gactttaaaa caacttgcga ataatatgca ggcacagctt taagctgcac aaaaactgct
     4921 acctcaaaat gttatttata aggttctaat tgtattacta tttcaaatgt tgcaaccgat
     4981 tgcgctaaaa taactggatc tgctggaact ataacatatg aaatttgcta atcgtataat
     5041 acaggttgta gcgtaaatag agcaagaagt gcttgtgtct aataataagc ataatgttca
     5101 ggatatacta gtgcaatgac aagttgttat aaatcaggag ctggtttatg tattgcaagt
     5161 acaaatacag atactgcttg tgtagctgca acagctgcaa caacttgtga tgctgtttat
     5221 ttaggaacag gaaattacag cagtgcaaat tgtaatgaaa tgaaggctgg atgcacaaat
     5281 aatggagcaa ctgcatgtgt agcaaaaact tgtgcaaatg ctgtggttat atttaatcat
     5341 acaaattgca atggttatct caatacctgt actgtaaatt ctggaaacag tgcatgccaa
     5401 actatggcat ctaaatgtgc agattaaact caagcatctt gcctttactc agttgaagga
     5461 gaatgtgtag tagtaggtac atcatgcgta agaaagactt gtgatactgc agcaactgat
     5521 gctactcgag atgatgacac tgaatgttca gcttattagc aatcttgtac tgttgctaga
     5581 ttaggagctt gccaagccag agctgcttgt gcttcttaca aatcttcact ctaatgtaaa
     5641 tttaatacta gtggtggaag atgtttctgg aacccaacta ataagacatg tgttgatttg
     5701 aattgcggca acatagaagc ctcaacttta tacgatactc ataatgaatg tgttgttgtc
     5761 gatgcaacac tcgcttgcac agttagagca acaaatggag ctgccgttta agggtgtatg
     5821 gctagaggag catgcagttc atatacaatt gaagaacaat gtaaaactaa cgcaagtaat
     5881 ggtgtttgtg tttggaatac aaatgctaat ttaccagcac ctgcttgcta agataagtct
     5941 tgtaccagtg ctccaacatc cactacaact cataatgatt gctatgctta ctacaatact
     6001 gcaacagtaa aatgtactgt tgttgccact ccaagcaata gtggtggtaa tccaacttta
     6061 ggaggatgtt aacagactgc tgcttgttca agttatattg ataaagaata atgttaaatc
     6121 aacgccaatg gtgaaccatg tggatggaat ggaacataat gtgctgacaa atcttgtgct
     6181 actgctcctg caactgcaga ttatgatgat gatactaaat gtagagctta cattactaat
     6241 aaatgtacag tctcagattc tggataagga tgtgtagaaa ttcctgctac ttgtgaaact
     6301 atgacataga aataatgtta ttataataag gctggagatc cttgctattg gacaggaaca
     6361 gcttgtatta caaaatcatg tgacaatgct cctgatgcaa ctgctactgc tgatgaatgt
     6421 aatacctatt tagctggatg tactttagat aatgttaaat gtaaaactaa agtttgtgaa
     6481 gattttgcct ttgctactga tgctttatgc aaacaagcaa tctctacatg tacaacaaat
     6541 ggaacaaatt gtgttacaag aggaacatgc ttctaagcct taagtcaagc tggatgtgtc
     6601 acatcctcga caaattaata atgtgaatgg ataccagctg ttttaaatgc ttcaaatgta
     6661 atcacctcac ctgcttattg tacaatcaaa aattgtagca ctgctccaat taccttaaca
     6721 agtgaagctg cttgcgctgg atattttaca aattgtacaa caaagaatgg tggaggatgc
     6781 gttactaaat caacttgctc agctgtcact attgatgtag cttgcacaac tgctttgaat
     6841 ggtactgtat gtgcttggga tagtgcataa aataaatgca gagataaaga ttgctaagat
     6901 tttagtggaa ctactcatgc tgcatgttag gcttaaagag ctggatgtac agctggagct
     6961 agtggaaaat gtgctagagt ataaaattgt gaacaaactt cagtaagagc agcttgcata
     7021 gaaggaacaa atggaccatg cttgtggatt gataaatatc aaaatactga tggaactaaa
     7081 ggagcttgtt tcagatatac atcatgcaag agtttaaatt ggaataatga tagttcatgc
     7141 aaatggataa gtaataaatg cacaactaat ggttcaaatt gtgttggtat tactttatgt
     7201 tcagaaacta acactgatgg aggttgtgtc actggatatg atggagcttg tattcaatca
     7261 gtaccagcct tgaattcttc agatccaaaa gtatgtaaac cttacacctc atgtgctgat
     7321 gctttctaca caactcattc agattgttaa attgctagta gcaaatgcac aacaaatgga
     7381 acaactggct gcatagcttt aggatcatgc tcatcatata ctgcttaggc tggatgttac
     7441 ttcaacgata agggaactct atatacatct ggagttatta catccactgg tatttgtaca
     7501 tgggatacta catcaagtag ttgcagagat taatcttgtg ctgatttgac aggcacaact
     7561 catgcaacat gttcttcata attatctacc tgcacatcag atggaactac ttgtttactt
     7621 aaaggagcct gtacatctta cacaacttaa actgcttgca caacagcagt tggatctgat
     7681 ggagcatgct actgggaatt agcatctgct acaaataata atactgcaaa atgtagatta
     7741 cttacttgtg ctgatattca aaatggaaca gcaactaacg tttgttctgt agccttgtca
     7801 acttgtgttt caaatggaac tgcatgcatt ccaaaagcca attgctcaac atatacatct
     7861 aagatagcat gtaattctgg aggtttggat ggaatttgtg tattcactta atcaacagca
     7921 actggagctg ctgctggaac tggaacttgt gcattaatga ctgcatgtac cgttgctaat
     7981 aatgattaaa cagcctgcta agctgccaga gatagatgtt cttggactgc tgcttcagga
     8041 actggagcaa ccgcagttgc tagtaaatgt gctactcata cttgtgctac aaattaagct
     8101 accaacggag cttgtacaag attcttaaat tgggataaaa agacttaata ggtttgtact
     8161 ctagtaagcg gagcctgcac agcaacagat ccatcaacat tgtcttcaaa cgattgcttc
     8221 ttagtttctg gatatacata tacttggaat gcatcaacaa gcaaatgcgg agtttgcaca
     8281 gcagttgtag tttaaccaaa taccacagac aataatacca acactacaga taataacaca
     8341 acaacagact caggatacat tcttggattg tctattgttt taggatatct tatgttctga
     8401 tgagaatgat ttttaaatat atatagggaa aattttataa aatacacaaa aaaatcatct
     8461 ttctattcat tattttttgt ctacaattat taaactttct tgcatgttta g
//