GenBank-Updates@genbank.bio.net (04/27/91)
LOCUS CYACYRP 6470 bp ds-DNA ORG 27-APR-1991
DEFINITION Cyanophora paradoxa ribosomal proteins 122, (3' end) s3, 116, s17,
114, 15, s8, 16, 118, s5, secY, and 136 genes, complete cds.
ACCESSION M30487
KEYWORDS ribosomal protein.
SOURCE Cyanophora paradoxa plastid (strain UTEX5550) DNA, clone BgIII-5.
ORGANISM Cyanelle Cyanophora paradoxa
Eukaryota; Plantae; Thallobionta; Chromophycota; Cryptophyceae;
Cryptomonadales; Kathablepharidaceae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 6470)
AUTHORS Michalowski,C.B., Pfanzagl,B., Loeffelhardt,W. and Bohnert,H.J.
TITLE The cyanelle s10/Spc-operons from Cyanophora paradoxa
JOURNAL Unpublished (1990)
STANDARD simple staff_entry
COMMENT Draft entry and printed sequence for [Unpublished (1990)] kindly
submitted by
H.J.Bohnert 07-DEC-1989.
FEATURES Location/Qualifiers
CDS 1..179
/product="ribosomal protein l22"
/gene="rpl22"
/codon_start=3
/partial
RBS 211..214
/gene="rps3"
RBS 931..935
/gene="rps3"
CDS 944..1354
/product="ribosomal protein l16"
/gene="rpl16"
/codon_start=944
RBS 1338..1391
/gene="rpl16"
CDS 1402..1668
/product="ribosomal protein l7"
/gene="rpl7"
/codon_start=1402
RBS 1661..1664
/gene="rpl7"
CDS 1674..2042
/product="ribosomal protein l14"
/gene="rpl14"
/codon_start=1674
RBS 2135..2139
/gene="rpl14"
CDS 2150..2695
/product="ribosomal protein l5"
/gene="rpl5"
/codon_start=2150
RBS 2711..2715
/gene="rpl5"
CDS 2719..3117
/product="ribosomal protein s8"
/gene="rps8"
/codon_start=2719
RBS 3088..3092
/gene="rps8"
CDS 3134..3673
/product="ribosomal protein l6"
/gene="rpl6"
/codon_start=3134
RBS 3656..3659
/gene="rpl6"
RBS 4087..4092
/gene="rpl18"
CDS 4099..4608
/product="ribosomal protein s5"
/gene="rps5"
/codon_start=4099
RBS 4714..4719
/gene="rps5"
CDS 4728..6206
/product="ribosomal protein secY"
/gene="secY"
/codon_start=4728
RBS 6275..6278
/gene="secY"
CDS 6330..6443
/product="ribosomal protein l36"
/gene="l36"
/codon_start=6330
BASE COUNT 2297 a 899 c 1119 g 2155 t
ORIGIN
1 ctgcagcaaa tgctcaagtt acaaaaggat tcaataaaaa taaattaatt attagtaaaa
61 cttttgttga caaaggtcca actttaaaac gttttcgtcc tcgtgcacaa ggacgaggtt
121 ataaaatttt aaaaccgacc tgtcatatta cagtgcaagt acaagatcaa agtttataat
181 tttccattta tatttcatta attaaattaa aggatatcaa ttcgatgggg acaaaaaatt
241 catccaattg gatttcgtct tggtataaca cagaaacatc gttcatgttg gtttgctaat
301 ccaaaacaat atccgactct tttacaagaa gatcatctaa ttcgtcaata tattgaaaaa
361 aatttaagta atgctggaat tgctcagatt tatattcaac gaaaagcaga tcgtatcgaa
421 ttagaattac gaactgctcg tccaggtgtt gttgttggtc gaggcggacg tggaattgaa
481 gttttacgaa aaggattaaa agatttatta ggcgaacaaa aacaaattcg cattaatgtt
541 atcgaagtta aacaaattga tgctgaagca gcattaattg gtgaatttat tacacaacaa
601 ttagaacgac gtgtagcatt ccgtcgaatt gttcgaaaag caattacaag agctcaacga
661 cgaggaattg aaggtattaa aattcaaatt tctggtcgtt taaatggcgc ggaaattgca
721 cgtagtgaat ggtcccgtga aggtcgagta ccattacaaa ctttacgcgc agaaattgat
781 tattcctata aacgcgcaca aacaatttat ggtgttttag gtgttaaagt atggattttt
841 aaaggagaag ttattcctgg taatccaaca gagatttctg agtaatagaa tttattaatt
901 tatatttaaa aaattattca aaaagaaatt agagaagtta aacatgttaa gcccaagaag
961 aacaaaattt agaaaacaac aacgaggacg aatgaaagga attagtactc gtggtaataa
1021 tttggtcttt ggtgattttg gattacaagc tttagaacct gcttggataa cctcccgtca
1081 aatcgaagca agccgtcgtg caattaatcg ttatgttcgt cgtggtggta aaatttggat
1141 tcgaattttc cctgataaac cggttacaat gcgtcctgct gaaactcgta tgggatctgg
1201 taaaggtgca cctgaatact gggtagcaat tgtaaaacca ggccgtgtta ttttcgaaat
1261 aaatggtgta tctcaagaaa tggcgaaagc agcttttcga atagctactt ttaaattacc
1321 aattaaaaca aaatttattt cttctcgagt ttaaagtatt tactattcag atgcaaaaat
1381 ttaataaaag gggcgatttt tatggcgtct aaggaaagag tcggtgtagt tattcgaaat
1441 ccacaagaga aaacagtaat tgttgctgtt aataatcgag taagacacaa taaatattct
1501 aaaattatta ttcgaacaaa aaaatatcaa gttcatgatc attctcatat ttgtaaactt
1561 ggtgatgaag taaaaatttc tgaagttaaa cctataagta aaaccaaacg ttggattatt
1621 tcggaagttt tatcttctac agttaatcct gaaaaatttg gagattaaaa gtaatgattc
1681 aaccacaaag ttatttaact gcggccgata atagtggagc tcgtaaatta atgtgtattc
1741 gagttcttgg gggaggaaat cgtcgttatg ctcgaattgg tgatgtaatt gtcgctgtag
1801 taaaagatgg gattcctaat atcccaatta aaaaatccga tacggttaaa gctgttattg
1861 ttagaactcg aaaagagtta aaacgtgata atggtatgaa tatctgtttt gatgataatg
1921 cagcggtaat tattaatgcg gatggaaatc ctcgtggaac acgtgtgttt ggacctgtag
1981 ctcgtgaatt acgagataaa aattttacaa aaattatttc tttagctccg gaagtattat
2041 agaaatatgt ttaatcttaa atttaataaa aattattttt gaaaatttaa gggaactatg
2101 tacctctcta aattcaaatt aatttaaaaa tgtaaaggat ttacgaatta tggttcaacg
2161 gttaaaaact gtatatgaac aagaagtcat taaacaatta atgacccgct tccaatataa
2221 aaatatccat gaagtaccaa aattaaaaaa aataactgta aatcgtggat taggagaagc
2281 tgctcaaaat gcaaagattt tagaagcttc tgttaaagaa attactgaaa ttaccggtca
2341 aaaagctatt gttactagag ccaaaaaagc tattgctggt tttaaattaa gacaagatat
2401 gcctattggt gttatggtta ctttacgcgg tgattatatg tatgctttct tggatcgttt
2461 aattaattta tctttaccaa gaattcgaga ttttcgcggt attactgcaa aaagttttga
2521 tggtcgtgga aattataatc ttggtttaaa agaacaattg atttttccag aagttgatta
2581 tgatggtatt gaacaaattc gcggtatgga tatttcaatt gtaaccactg caaaaacaga
2641 tcaagaaggt cttgctttat taaaatcttt aggcatgcca tttgctgaaa gttaacttca
2701 ttattataag gaggaaaagt ggttaacgat acaattgctg atatgcttac aggtattcga
2761 aatgcaaatt tagcaaaaca taaagttgca cgtgttaaag caacaaaaat aactcgttgt
2821 ttagctaatg ttttaaaaga agaaggctta attcaaaatt ttgaagaaat agaaaataat
2881 cttcaaaatg aattattaat atctcttaaa tataaaggta aaaaacgtca gccgataatt
2941 actgctttaa aaagaattag taaaccaggt ttacgtggtt atgcgaatca taaagaacta
3001 cctcgtgtat taggaggttt aggtattgct attctttcaa cttcttcagg aattatgact
3061 gatcagaccg ctcgtcataa aggttgtggt ggagaagttt tatgttatat ttggtagatt
3121 tattaggtga attatgtctc ggataggtaa acgattaatt aatattccta gccaagttac
3181 ggttagcatc aaggatcaag tattttctgt taaaggacca aaaggagagt tatctaaaca
3241 aattccttat ggaattcaag tagttcaaca aaatgatcat ttagttgttg aaagagtagc
3301 tgaatcatta ttagctcgta aacttcatgg actttgtcga actttggttt ctaatttagt
3361 tcaaggcgtt tttcaaggtt tcgaacgtcg tcttgaaatt caaggagttg gatatcgagc
3421 acaaatggat ggaaaaaaat tagttttaaa tattggtttt agccatccag ttgtaattga
3481 acctcctaca gaaatccaat tacaagtaga aaacaataca aatattatta taaaaggtat
3541 tgataaagaa cttgttggta aattagcagc agaaattcgt gctgtacgtc caccagaacc
3601 ttataaaggt aaggggattc gatatttagg agaaaatgta aaacgtaaag ttggaaaagc
3661 aggtaagaaa taaaccatga aattaactcg taaacaagca acacagcgtc gccatcgacg
3721 agtacgtcgt aaagtttttg gtacttctga acgcccaaga ttagcggtat ttcgttcaca
3781 tcaacatatt tatgctcaaa ttatcgatga tacccaacat tcgtacatta gctgcaagtt
3841 ctacattaga accatcagta aaaaattcag agctatcttc aacttctact tgtgctgctt
3901 ctgcaattgt aggtcaatta attgcaaaaa aagcacttga aaaaggaatt actcaagtag
3961 tatttgatcg tggtggaaaa atttatcatg gtcgtgttcg aactttagct gaagcagcac
4021 gagaagcagg gttacaattt taaataattt ataaaattca atttttgaat cttccctatt
4081 aaaataaaaa ggaaaaaaat ggcaaatcgt caaaaaatga gtaaaactcg tgataaaaaa
4141 ccagattggc aagaacgagt agttcaaatt cgtcgtgtat ctaaagtagt aaaaggtggt
4201 aaaaaactaa gctttagagc aattgttgtt attggaaatg aacgtggtca agttggtgta
4261 ggtattggaa aagctagtga tgtaatcaat gctgtaaaaa aagctgctgc cgatggaaaa
4321 aaacatgttg ttgaagttcc attaactcgt tctaattcta ttccacaccc aattgatgga
4381 attggcgggg cagcacgtgt aattatgcga ccatcagctg aaggtactgg agtaattgca
4441 ggtggagctg tacgtacagt tttagaatta gctggagttc gaaatatttt agctaaacaa
4501 cttggttcta ataatccgtt gaataatgct agagcagcga tgaatgctct ttctcgttta
4561 aaaacttttt cccaatttgc aaaagatcgc ggtgtaattg ctgaataatt tctaataaaa
4621 aatataatat ttttatttta ataatttgca tttttaaaat aaaaatatta tattttttat
4681 tagaaattag tatcgaaaaa gaaaaaaagt taacaaggag ttagttaatg ctttcaagat
4741 taattatttc aatttttata atttttgaaa caatttattt gcaaattttt aaacctgtaa
4801 ataaaacttt taaacaagga gaagcaaaat taaaacgaac attgcaaacg ttacaatctc
4861 gtgaacttag tgaaattaga aaacgcgcaa tttccacttt atgtttaatt tttctaatac
4921 ggataggtac atttttacca ataccaggca ccgcactcaa ttttgattta gaaagttttc
4981 agcaaaataa ttcgagaaat gaattagcta atattttaaa tttattatca ggaggtgcat
5041 ttttagaaat aggatttttc acattaggta ttttacctta tatgaatgct tcatttttct
5101 tacaagtttt aacaaaaata ttaccttctt tagagcgttt tcaaaaagaa caggaagata
5161 ccgcacaacg tgaatttaaa aaatggacaa gatatttaac agttatttgg gcttttattc
5221 aaagtattgt tatttcttgg atttggattc gtccatatgc attaaattgg gatttttttt
5281 taggattaaa ggttgttgtt gcattaactt taggagcagt aattgttatg attattgcgg
5341 aacaaattac tgaaattggt ttaaccaacg gctcttcact attaattttt ataaatatta
5401 ttgcgcgtat tcctaattca attgaacaat tatttaattc taatatcaat tggacatttc
5461 caatgatttc aagtttaata ttaagcttaa gtttatcctt tataacaatg tttgttatta
5521 ttggattaca agaatctggg cgacctgttc cagttttaat tgcaagacaa gaagctgaac
5581 gtcaaaagtt taatgaacca attacagaag cagaacgccg taaaacacaa gcttatatct
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5701 tagctcttcc agcttttact aatttcttat tacaacaagg aaattggggt taccaattaa
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5821 tatttagttc aaattatgca ttaacaatta tgattaatcc taaaacttta gctgaaaatc
5881 ttaattcaat gaacgcatta attccaggag ttcgtccggg ttcagaaaca aaagtttatt
5941 cagaacaatt aattcatcga ttaaatttta ttggttcttt tgtacttgct ttagtttgta
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6121 taggatcgtc ttctcctttt aaaagagatt cttcaaaaag agaaccttta aaacgagatt
6181 tttcaaaacg acgttccgca aactaataat aaatttaaaa aaaagataaa ctaattttat
6241 tctttttatt taaacattat tttaatgtta ataaaaaaga aatagtttat ctttcttatt
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6421 ccaatattat ctgctgcttc tgaacattta tttagcgcaa gtggaaaaag
//GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/22/91)
LOCUS CYACYRP 6468 bp ds-DNA ORG 22-MAY-1991
DEFINITION Cyanophora paradoxa ribosomal proteins 122, (3' end) s3, 116, s17,
114, 15, s8, 16, 118, s5, and secY genes, complete cds.
ACCESSION M30487
KEYWORDS ribosomal protein.
SOURCE Cyanophora paradoxa plastid (strain UTEX5550) DNA, clone BgIII-5.
ORGANISM Cyanelle Cyanophora paradoxa
Eukaryota; Plantae; Thallobionta; Chromophycota; Cryptophyceae;
Cryptomonadales; Kathablepharidaceae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 6468)
AUTHORS Michalowski,C.B., Pfanzagl,B., Loeffelhardt,W. and Bohnert,H.J.
TITLE The cyanelle S10 spc ribosomal protein gene operon from Cyanophora
paradoxa
JOURNAL Mol. Gen. Genet. 224, 222-231 (1990)
STANDARD simple staff_entry
COMMENT Draft entry and printed sequence for [Unpublished (1990)] kindly
submitted by
H.J.Bohnert 07-DEC-1989.
FEATURES Location/Qualifiers
CDS 1..179
/product="ribosomal protein l22"
/gene="rpl22"
/codon_start=3
/partial
RBS 211..214
/gene="rps3"
CDS 225..885
/product="ribosomal protein s3"
/gene="rps3"
/codon_start=225
RBS 931..935
/gene="rps3"
CDS 944..1354
/product="ribosomal protein l16"
/gene="rpl16"
/codon_start=944
RBS 1338..1391
/gene="rpl16"
CDS 1402..1668
/product="ribosomal protein l7"
/gene="rpl7"
/codon_start=1402
RBS 1661..1664
/gene="rpl7"
CDS 1674..2042
/product="ribosomal protein l14"
/gene="rpl14"
/codon_start=1674
RBS 2135..2139
/gene="rpl14"
CDS 2150..2695
/product="ribosomal protein l5"
/gene="rpl5"
/codon_start=2150
RBS 2711..2715
/gene="rpl5"
CDS 2719..3117
/product="ribosomal protein s8"
/gene="rps8"
/codon_start=2719
RBS 3088..3092
/gene="rps8"
CDS 3134..3673
/product="ribosomal protein l6"
/gene="rpl6"
/codon_start=3134
RBS 3656..3659
/gene="rpl6"
CDS 3677..4042
/product="ribosomal protein l18"
/gene="rpl18"
/codon_start=3677
RBS 4086..4091
/gene="rpl18"
CDS 4098..4607
/product="ribosomal protein s5"
/gene="rps5"
/codon_start=4098
RBS 4713..4718
/gene="rps5"
CDS 4727..6205
/product="ribosomal protein secY"
/gene="secY"
/codon_start=4727
RBS 6274..6277
/gene="secY"
CDS 6329..6442
/note="ORF"
/codon_start=6329
BASE COUNT 2297 a 898 c 1119 g 2154 t
ORIGIN
1 ctgcagcaaa tgctcaagtt acaaaaggat tcaataaaaa taaattaatt attagtaaaa
61 cttttgttga caaaggtcca actttaaaac gttttcgtcc tcgtgcacaa ggacgaggtt
121 ataaaatttt aaaaccgacc tgtcatatta cagtgcaagt acaagatcaa agtttataat
181 tttccattta tatttcatta attaaattaa aggatatcaa ttcgagtggg acaaaaaatt
241 catccaattg gatttcgtct tggtataaca cagaaacatc gttcatgttg gtttgctaat
301 ccaaaacaat atccgactct tttacaagaa gatcatctaa ttcgtcaata tattgaaaaa
361 aatttaagta atgctggaat tgctcagatt tatattcaac gaaaagcaga tcgtatcgaa
421 ttagaattac gaactgctcg tccaggtgtt gttgttggtc gaggcggacg tggaattgaa
481 gttttacgaa aaggattaaa agatttatta ggcgaacaaa aacaaattcg cattaatgtt
541 atcgaagtta aacaaattga tgctgaagca gcattaattg gtgaatttat tacacaacaa
601 ttagaacgac gtgtagcatt ccgtcgaatt gttcgaaaag caattacaag agctcaacga
661 cgaggaattg aaggtattaa aattcaaatt tctggtcgtt taaatggcgc ggaaattgca
721 cgtagtgaat ggtcccgtga aggtcgagta ccattacaaa ctttacgcgc agaaattgat
781 tattcctata aacgcgcaca aacaatttat ggtgttttag gtgttaaagt atggattttt
841 aaaggagaag ttattcctgg taatccaaca gagatttctg agtaatagaa tttattaatt
901 tatatttaaa aaattattca aaaagaaatt agagaagtta aacatgttaa gcccaagaag
961 aacaaaattt agaaaacaac aacgaggacg aatgaaagga attagtactc gtggtaataa
1021 tttggtcttt ggtgattttg gattacaagc tttagaacct gcttggataa cctcccgtca
1081 aatcgaagca agccgtcgtg caattaatcg ttatgttcgt cgtggtggta aaatttggat
1141 tcgaattttc cctgataaac cggttacaat gcgtcctgct gaaactcgta tgggatctgg
1201 taaaggtgca cctgaatact gggtagcaat tgtaaaacca ggccgtgtta ttttcgaaat
1261 aaatggtgta tctcaagaaa tggcgaaagc agcttttcga atagctactt ttaaattacc
1321 aattaaaaca aaatttattt cttctcgagt ttaaagtatt tactattcag atgcaaaaat
1381 ttaataaaag gggcgatttt tatggcgtct aaggaaagag tcggtgtagt tattcgaaat
1441 ccacaagaga aaacagtaat tgttgctgtt aataatcgag taagacacaa taaatattct
1501 aaaattatta ttcgaacaaa aaaatatcaa gttcatgatc attctcatat ttgtaaactt
1561 ggtgatgaag taaaaatttc tgaagttaaa cctataagta aaaccaaacg ttggattatt
1621 tcggaagttt tatcttctac agttaatcct gaaaaatttg gagattaaaa gtaatgattc
1681 aaccacaaag ttatttaact gcggccgata atagtggagc tcgtaaatta atgtgtattc
1741 gagttcttgg gggaggaaat cgtcgttatg ctcgaattgg tgatgtaatt gtcgctgtag
1801 taaaagatgg gattcctaat atcccaatta aaaaatccga tacggttaaa gctgttattg
1861 ttagaactcg aaaagagtta aaacgtgata atggtatgaa tatctgtttt gatgataatg
1921 cagcggtaat tattaatgcg gatggaaatc ctcgtggaac acgtgtgttt ggacctgtag
1981 ctcgtgaatt acgagataaa aattttacaa aaattatttc tttagctccg gaagtattat
2041 agaaatatgt ttaatcttaa atttaataaa aattattttt gaaaatttaa gggaactatg
2101 tacctctcta aattcaaatt aatttaaaaa tgtaaaggat ttacgaatta tggttcaacg
2161 gttaaaaact gtatatgaac aagaagtcat taaacaatta atgacccgct tccaatataa
2221 aaatatccat gaagtaccaa aattaaaaaa aataactgta aatcgtggat taggagaagc
2281 tgctcaaaat gcaaagattt tagaagcttc tgttaaagaa attactgaaa ttaccggtca
2341 aaaagctatt gttactagag ccaaaaaagc tattgctggt tttaaattaa gacaagatat
2401 gcctattggt gttatggtta ctttacgcgg tgattatatg tatgctttct tggatcgttt
2461 aattaattta tctttaccaa gaattcgaga ttttcgcggt attactgcaa aaagttttga
2521 tggtcgtgga aattataatc ttggtttaaa agaacaattg atttttccag aagttgatta
2581 tgatggtatt gaacaaattc gcggtatgga tatttcaatt gtaaccactg caaaaacaga
2641 tcaagaaggt cttgctttat taaaatcttt aggcatgcca tttgctgaaa gttaacttca
2701 ttattataag gaggaaaagt ggttaacgat acaattgctg atatgcttac aggtattcga
2761 aatgcaaatt tagcaaaaca taaagttgca cgtgttaaag caacaaaaat aactcgttgt
2821 ttagctaatg ttttaaaaga agaaggctta attcaaaatt ttgaagaaat agaaaataat
2881 cttcaaaatg aattattaat atctcttaaa tataaaggta aaaaacgtca gccgataatt
2941 actgctttaa aaagaattag taaaccaggt ttacgtggtt atgcgaatca taaagaacta
3001 cctcgtgtat taggaggttt aggtattgct attctttcaa cttcttcagg aattatgact
3061 gatcagaccg ctcgtcataa aggttgtggt ggagaagttt tatgttatat ttggtagatt
3121 tattaggtga attatgtctc ggataggtaa acgattaatt aatattccta gccaagttac
3181 ggttagcatc aaggatcaag tattttctgt taaaggacca aaaggagagt tatctaaaca
3241 aattccttat ggaattcaag tagttcaaca aaatgatcat ttagttgttg aaagagtagc
3301 tgaatcatta ttagctcgta aacttcatgg actttgtcga actttggttt ctaatttagt
3361 tcaaggcgtt tttcaaggtt tcgaacgtcg tcttgaaatt caaggagttg gatatcgagc
3421 acaaatggat ggaaaaaaat tagttttaaa tattggtttt agccatccag ttgtaattga
3481 acctcctaca gaaatccaat tacaagtaga aaacaataca aatattatta taaaaggtat
3541 tgataaagaa cttgttggta aattagcagc agaaattcgt gctgtacgtc caccagaacc
3601 ttataaaggt aaggggattc gatatttagg agaaaatgta aaacgtaaag ttggaaaagc
3661 aggtaagaaa taaaccatga aattaactcg taaacaagca acacagcgtc gccatcgacg
3721 agtacgtcgt aaagtttttg gtacttctga acgcccaaga ttagcggtat ttcgttcaca
3781 tcaacatatt tatgctcaaa ttatcgatga tacccaacat cgtacattag ctgcaagttc
3841 tacattagaa ccatcagtaa aaaattcaga gctatcttca acttctactt gtgctgcttc
3901 tgcaattgta ggtcaattaa ttgcaaaaaa agcacttgaa aaaggaatta ctcaagtagt
3961 atttgatcgt ggtggaaaaa tttatcatgg tcgtgttcga actttagctg aagcagcacg
4021 agaagcaggg ttacaatttt aaataattta taaaattcaa tttttgaatc ttccctatta
4081 aaataaaaag gaaaaaaatg gcaaatcgtc aaaaaatgag taaaactcgt gataaaaaac
4141 cagattggca agaacgagta gttcaaattc gtcgtgtatc taaagtagta aaaggtggta
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