GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/22/91)
LOCUS TRBREP3 2244 bp ds-DNA ORG 22-MAY-1991
DEFINITION Trypanosoma brucei kinetoplast DNA maxicircle fragment encoding two
very small ribosomal RNAs, a 12S rRNA homologous to E.coli 23S rRNA
and a 9S rRNA homologous to 16S rRNA.
ACCESSION V01390
KEYWORDS 12S ribosomal RNA; 9S ribosomal RNA; ribosomal RNA.
SOURCE Mitochondrion Trypanosoma brucei DNA.
ORGANISM Mitochondrion Trypanosoma brucei
Eukaryota; Animalia; Protozoa; Sarcomastigophora; Mastigophora;
Kinetoplastida; Trypanosomatina; Trypanosomatidae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 2244)
AUTHORS Eperon,I.C., Janssen,J.W., Hoeijmakers,J.H. and Borst,P.
TITLE The major transcripts of the kinetoplast DNA of Trypanosoma brucei
are very small ribosomal RNAs
JOURNAL Nucleic Acids Res. 11, 105-125 (1983)
STANDARD full automatic
COMMENT The kinetoplast is thought to be a remnant of a mitochondrion.
From EMBL 26 entry TBREP3; dated 18-MAR-1991.
FEATURES Location/Qualifiers
rRNA 21..1266
/note="12S ribosomal RNA"
rRNA 1274..1942
/note="9S ribosomal RNA"
BASE COUNT 853 a 173 c 328 g 890 t
ORIGIN
1 agcttttaaa aatttaaaat ttgtaatcca aattttacca attaagaaga atattataat
61 aatgggtgtc ttatatttta aataaatatt taaattccgt gtagtaaatt tattatttgt
121 attatttata taataggtgt attatattta aattttaaat ttgttgtttt atatttagat
181 acatatttat agattaatat atttaaataa tattttaaaa tttattgaac tgtaattatt
241 agtttaatat ttttagtttg atgttgaaat atttaattaa agatgttaca gttgttctat
301 atgtaccaaa taaatatagt aagattattt tagttgaatt aataaataaa tatttatttt
361 tctttgtaaa tattatgaac aatttaaaaa ttaatctgtt taactaaaat gttatatata
421 ataatctaag ttaatttgaa tattaaaagt acaagtataa tttgtaattc taaagtattt
481 taatggtata tttttagtag gtaaatgaaa agtataaatg gatataactt aatatttaat
541 atttgtttaa tgaaaagtat tttattatta tattgtatag tattattata gtgtatagtt
601 ttttaaaaat ataaaaatat tgttaataaa attatcgtat tttaagtgcg tttattaaat
661 gcgtttgtct aagataatta tttaagatta ttcttgtaaa tatatttaaa tattaataat
721 tcttaaaata aaaaaatatc ctcaattgca atattattgt agcatagtaa tttgttaact
781 aaatattaaa gtgttccata gaaaattttt aaattacaac aaataaaata aagtatgaat
841 taatatcaaa attttaataa aaattaaaaa attaaaatag ggcaagtcct actctccttt
901 acaaagagaa cattatgata tgtaattgta tgtttgattg gggcaatact atatttattt
961 atatagcata agaactatat tctttgaaat tataaaaggt tcgagcaggt taacaagcat
1021 taaaaataaa tgtgtttcat cgtctactta ttaccatgat tgattgttca tcaaaatagt
1081 aattcgttag ttgggttaaa atcgttgtaa agcagatttg tttatatatt taatttttat
1141 aattaataat aattaatata agtacgcaag gattgattat tgaaaaaaga aagaagaata
1201 taatttatat aaattatggt caattgttag tattcatatt aattttttta aatgttttat
1261 cattttataa aggtttattt ttgaaagatt ttttgtataa aattttagga atagttaata
1321 ataatttata attttgatta gattgttttg ttaatgctat tagatgggtg tggaaaaata
1381 aaaaaaataa ttaatatata tcaataataa attaaattaa tctattagtc agaaatggat
1441 gccagccgtt gcggtaattt ctatgctttt aaatattata caattatcat attaaattgt
1501 taagtgctga tttaaccaat aaaaatataa ataattttta tttgttttta aacaccatta
1561 ggtatatgca aatataaaat tatagtaatt ataaattata ttatattata tttattcata
1621 taattaatag gataatattt gtagtttttg ataccatgat aaggattata aattgaaagt
1681 gttaatatca taatcaaaat ttattattta tattaaatat gtatgtgtag ataaaataag
1741 aaattaaaaa ggtattgttg cccaccaatt tttataataa aaataacgtg cagtaattaa
1801 tatatttata aaaatatatt ttagctaaat tagaatcaat ttaataattt taagttttgg
1861 ttgattaaaa gaggagtttt tggaaggtgg ggattttcat tttgatttcc cagagaacca
1921 gagaggcggg aaccagcgtt ttatttttgg gggagagcgg agcgcgagga aagcccattt
1981 tgagcaggag tttttcgggg gggagggggc atttctggcg gagaacagag attcttgttt
2041 cggaagggga gcaggcccga cagatttttg ccaacgcatt caggagggga gccttatttg
2101 aagtgcgctt tctttcaaga gggggagaga aggggagaag gggaagtgag aaatttagaa
2161 ttacacggtg aaattaaatt ttgactaaat taaggttgcc ctcttgtcgt ctctatctcc
2221 tcccaacccc tctccccttg gatc
//