GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/25/91)
LOCUS DRODMTRN 8351 bp ds-DNA ORG 25-MAY-1991
DEFINITION Drosophila mitochondrial DNA fragment containing 11 tRNA genes, ND
genes 1,3 to 6, cytb gene and the 3'-end of 16 S ribosomal RNA
ACCESSION Y00610
KEYWORDS 16S ribosomal RNA; COIII gene; ND1 gene; ND3 gene; ND4 gene;
ND4L gene; ND5 gene; ND6 gene; cytb gene; cytochrome b;
mitochondrial DNA; ribosomal RNA; transfer RNA; transfer RNA-Ala;
transfer RNA-Arg; transfer RNA-Asn; transfer RNA-Glu;
transfer RNA-Gly; transfer RNA-His; transfer RNA-Leu;
transfer RNA-Phe; transfer RNA-Pro; transfer RNA-Ser;
transfer RNA-Thr.
SOURCE Mitochondrion Drosophila melanogaster DNA.
ORGANISM Mitochondrion Drosophila melanogaster
Eukaryota; Animalia; Metazoa; Arthropoda; Uniramia; Insecta;
Pterygota; Neoptera; Holometabola; Diptera; Brachycera;
Cyclorrhapha; Schizophora; Drosophiloidea; Drosophilidae.
REFERENCE 1 (bases 1 to 8351)
AUTHORS Garesse,R.
JOURNAL Unpublished (1988)
STANDARD full automatic
REFERENCE 2 (bases 1 to 8351)
AUTHORS Garesse,R.
TITLE Drosophila melanogaster mitochondrial DNA: Gene organization and
evolutionary considerations
JOURNAL Genetics 118, 649-663 (1988)
STANDARD full automatic
COMMENT Drosophila mtDNA uses a unique genetic code; i.e., UGA specifies
tryptophan instead of termination. AGA appears to specify serine
instead of arginine (universal) or termination (vertebrate mtDNA).
From EMBL entry MIDMTRN; dated 06-SEP-1990.
FEATURES Location/Qualifiers
CDS <1..254
/note="COIII gene product (85 AA) (1 is 2nd base in
codon)"
/codon_start=1
tRNA 276..340
/note="tRNA-Gly"
CDS 341..691
/note="ND3 gene product (AA 1-117)"
/codon_start=341
tRNA 714..778
/note="tRNA-Ala"
tRNA 788..851
/note="tRNA-Arg"
tRNA 852..916
/note="tRNA-Asn"
tRNA 917..984
/note="tRNA-Ser (agy gene)"
tRNA 985..1052
/note="tRNA-Glu"
tRNA complement(1070..1134)
/note="tRNA-Phe"
CDS complement(1136..2857)
/note="ND5 gene product (AA 1-574)"
/codon_start=2857
tRNA complement(2873..2938)
/note="tRNA-His"
CDS complement(2940..4277)
/note="ND4 gene product (AA 1-446)"
/codon_start=4277
CDS complement(4280..4567)
/note="ND4l gene product (AA 1-96)"
/codon_start=4567
tRNA 4570..4635
/note="tRNA-Thr"
tRNA complement(4636..4696)
/note="tRNA-Pro"
CDS 4703..5224
/note="ND6 gene product (AA 1-174)"
/codon_start=4703
CDS 5231..6364
/note="cytochrome b (AA 1-378)"
/codon_start=5231
tRNA 6370..6435
/note="tRNA-Ser (ucn gene)"
CDS complement(6456..7391)
/note="ND1 gene product (AA 1-312)"
/codon_start=7391
tRNA 7402..7465
/note="tRNA-Leu (cun gene)"
rRNA complement(7466..>8351)
/note="16 S ribosomal RNA"
BASE COUNT 3554 a 1041 c 714 g 3042 t
ORIGIN
1 aagcttatga atatattgaa gctccattta ctattgcaga ctcaatttat ggatcaacat
61 tttttatagc aacaggattc cacggaattc atgtattaat cggaacaact tttttattag
121 tatgtttatt acgacattta aataatcact tctcaaaaaa tcatcatttt ggttttgaag
181 cagctgcatg atattgacat tttgtcgatg tagtttgatt atttttatat atcacaattt
241 actgatgagg aggataatta tattattaat taaatatcta tatagtataa aagtatattt
301 gacttccaat cataaggtct attaattaat agtatagata attttttcta ttatttttat
361 tgctttatta attttactaa ttacaactat tgttatattt ttagcttcaa ttttatcaaa
421 aaaagcttta atcgaccgag aaaaaagatc cccatttgaa tgtggatttg atccaaaatc
481 ttcatctcga ttaccatttt ctttacgttt ttttttaatt actattattt ttttaatttt
541 tgatgtagag attgcattaa ttctacctat aattattatt ataaaatatt ctaatattat
601 aatttgaaca attacttcaa ttatttttat tttaatttta ttaattggat tataccatga
661 atgaaatcaa ggaatattaa attgatcaaa ctaatatata tttatatata tatagggttg
721 tagttaaata taacatttga tttgcattca aaaagtattg aatattcaat ctaccttatt
781 aataactgaa tatgaagcga ttgattgcaa ttagtttcga cctaatctta ggtaattata
841 cccttattct ttaattgaag ccaaaaagag gcatatcact gttaatgata taattgaatt
901 ttaaattcca attaaggaaa tatgatgatc aagtaaaagc tgctaacttt tttcttttaa
961 tggttaaatt ccatttatat ttctatttat atagtttaaa taaaacctta cattttcatt
1021 gtaataataa aatattacat ttttataaat tactaaaatt aattcactat atccaaagat
1081 ttaataatct ccataacatc ttcaatgtca aactctagta taagctattt ggatataaaa
1141 ataataaaat taataaaatt aaaattcaaa atacaaataa taataaataa attttcaaag
1201 aattattatg tattaaaaat aaagttttag aatatataga taatttttga tataaatgtt
1261 gacctccaaa atattctgat caaccttgat caaaactttt tacaactaat tgaccataat
1321 ttaaaggata aaaaattata ccataagttc taatataagg tataaatcat atagacccta
1381 aaaaagttct taaattatat ataaataaag atttatttaa aaaaaataaa tttcttaaag
1441 aaattaaata tccaaataaa ccccctacaa tacatacaaa taatgttaac aattttatat
1501 aaataggtaa acaaattata taaggaaaag gaaaaatcaa tcaatttaat attctacctc
1561 caataattct tataattaat aatcctatta taccacggag tataattcaa ctttcatcat
1621 ttaatatatt caatctaccg caatttaaat caccggttat tgaataataa actaatcgaa
1681 atgaataact aacagttaaa cccgtagaaa aataatataa aaaaaatgaa aacatattaa
1741 catttctaat tctaacaatt tctaaaatta tatccttaga atagaatcca gctaaaaaag
1801 gtattccaca taaagctaaa ttagatacgt taaaacaagc tgaagttaaa ggtatatgaa
1861 ttccaattct taacccccct attaaacgaa tatcttgaga attatttata ttgtgaataa
1921 tagccccagc acatataaac aataatgctt taaataaagc atgagttaat aaatgaaata
1981 tagctaattt taaaaatcct atagacaaaa ttcttattat taaacctaat tgacttaaag
2041 tagataaagc aataattttt tttaaatcaa attcaaaatt agctcctaat ccagctataa
2101 atattgttaa tccagataat aataatatta attgtcctaa ccaagaagtt cttaagataa
2161 tattaaatcg aattaataaa tatacaccag ctgtaactaa tgtagaagaa tgaactaaag
2221 cagaaacagg tgtaggagca gctatagctg caggtaacca agaagaaaaa ggaatctgag
2281 ctcttttagt tatagcagct aatattacta atcttccaat tattaacatt tcaaattcat
2341 tttgtataat ttctaaataa aaaatataat ttcatcttcc ataatttaat attcaagcaa
2401 tagaaagaag taaagctaca tccccaattc gattagataa cgcagttaat ataccagcat
2461 tataagattt aatattttga aaataaatta ctaaacaata agaaacaagt cctaaaccat
2521 ctcaccctaa taaaattcta attaaatttg gtctaataat taacaatatt attgataaaa
2581 caaatattaa tactaatata atgaatcgat taatatgatt gtcatttatt atgtattctt
2641 ttctataaaa aatcactaaa gaagaaatta taagaacaaa agatataaat aataaactta
2701 ttcaatcaaa aagaaaagtt ataacaattc ttatagaatt taaagaaact aattctcact
2761 caataaaata aatcatatca tttaacaaaa aatataaact taataaaaaa catgataaac
2821 ttatagaaat taaattaaca aatctaattc tacaaataga taaatatttc atgatttaaa
2881 atgaatattt tcatatcact aacaccacaa attagtattt tttttaaact atttaaatat
2941 aatcataata taaatgattc tctttttaaa attaataaat ttaaaggcaa tcaatgtaac
3001 aatattaata aatattctcg aattttacct cttctaaatg aatatactcc agaaaataat
3061 ttaccatgct gactaaaaga atataaatat aaagtataag cagctctaaa aaaagataaa
3121 aaagataata aaattataga aattcaagat caagaaacaa ttctatttaa taaagaaatt
3181 tctcctaata aatttaatgt tggaggagct gctatattag ctgatcttaa taaaaatcat
3241 cataaagtta tcgaaggtat aaaatttaat aaacctttat taattaatat tcttcgactt
3301 ccaagacgtt cataagatac attagctaaa caaaataacc cagaagaaca taaaccatga
3361 gcaattatta atgtataaga accacataaa cctcaataag ttatagttaa aagtcctgat
3421 agaacaattc ctatatgagc aacagatgaa taagcaatta aagcctttaa atcagtttga
3481 cgtaaacaaa ctaatctaac taatacacct cctactaatc taattctaat tcaaacaaat
3541 ctatacttca aatttattaa ctgtaaaaaa ctaataactc gtaatattcc ataacctcct
3601 aattttagta taatacctgc taaaattata gacccagaaa ctggagcttc aacatgagct
3661 ttaggtaatc ataaatgaac taaaaatatt ggtattttta ctaaaaaggc acacaataaa
3721 caaaaatata ataaatcata attaaacata aaattattta ttaaataaaa atttattgaa
3781 ccaattttat ttattacata aaaaatacca attaatatag gtaaagaaac taataaagta
3841 taaaataata aatataaacc agcttgtaaa cgttctggct gataacctca acctaaaatt
3901 aaaaataatg taggaattaa tcttctttca aaaaataaat aaaatataaa taatcttatt
3961 cttgaaaaag ttaaaatcaa caataataat aaaataataa tatttaataa aaataaattt
4021 ttataattat tatgtttatt aattatttct ctagctaata atattaatga acaaattcat
4081 aaacttaata aaattaatcc ataagataat atatcacaac ctaaaaaata agaaatttct
4141 gatcaataat ttataaaatt atttattaat aaaaaaataa atctaataaa aaatattata
4201 atttgtacca ttcaatatat attattaata aaacaaaaag gaattaaaaa taataaaaaa
4261 aaaataattt ttaacattat ataattctaa aagattgaaa ataatcatta ccatgagtac
4321 gaattataga aactaaaatt gataaaccta aggccccttc acatactcta aatgtcaaaa
4381 atattattct aaaataactt tcataattta atatatttaa ataaataaat aatataaaaa
4441 ataatattaa aacaataaat tctaaactta aaagtattga aagtaaatgt ttccgattag
4501 aaacaaaaca aaatagccct aaaataaata aaattatagg taaacttcaa tataaaatta
4561 taatcattag ttttaatagt ttaataaaaa cattggtctt gtaaatcaaa aataagatta
4621 tttcttttaa aacttcaaga gaaaagaaat ttctttttca ttaatcccca aaattaatat
4681 tttaaataaa ctacctcttg aaattattca attaatatta tactcattaa ttattactac
4741 ttccattatt tttctaaata taattcatcc attagcttta ggattaactt tattaattca
4801 aacaattttt gtatgtttac taactggatt aataactaaa agtttttgat attcatatat
4861 tttattttta atttttttag gaggaatact tgtattattt atttacgtaa catctttagc
4921 ctctaatgaa atatttaatt tatcaataaa attaactcta ttttcttcat taattttaat
4981 ttttatatta attttatcat ttattataga taaaacttct tcttctttat ttttaataaa
5041 taatgatata caatctatta ttaatataaa ttcttatttt atagaaaatt ctttatcttt
5101 aaataaatta tataattttc ccacaaattt tattacaatt ttattaataa attatttatt
5161 aattacttta attgttattg taaaaattac aaaattattt aaaggaccta ttcgaataat
5221 atcttaatta atgaataaac ctttacgaaa ttcccatcct ctatttaaaa ttgccaataa
5281 tgctttagta gatttaccag ctccaattaa tatttcaaga tgatgaaatt ttggatcatt
5341 acttggatta tgtttaatta ttcaaatttt aaccggatta tttttagcta tacattacac
5401 agctgatatt aatctagctt tctatagtgt taatcatatt tgtcgagacg ttaattatgg
5461 ttgattatta cgaactttac atgctaacgg tgcatcattt ttttttattt gtatttactt
5521 acatgtagga cgaggaattt attacggttc atataaattt actccaactt gattaattgg
5581 agtaattatt ttatttttag taataggaac agcttttata ggatacgtat taccttgagg
5641 acaaatatca ttttgagtag ctactgttat tactaattta ttatacgcta tcccttactt
5701 aggtatagat ttagttcaat gattatgagg tggatttgct gttgataatg ccactttaac
5761 tcgatttttt acattccatt ttattttacc ttttattgtt cttgctataa ctataattca
5821 tttattattc cttcatcaaa caggatctaa taatcctatc ggattaaatt ctaatattga
5881 taaaattcct tttcatcctt attttacatt taaagatatt gtaggattta ttgtaataat
5941 ttttatttta atttcattag tattaattag accaaattta ttgggagacc ctgataactt
6001 ttattcagca aactccttta gtaacactgc ccatattcaa ccagaatgat attttttatt
6061 tgcttatgct attttacgat ctattccaaa taaattagga ggagttattg cattagtttt
6121 atcaattgca attttaataa tccttccttt ttataattta agaaaattcc gagggattca
6181 attttatcct attaatcaag taatattctg atctatatta gtaacagtaa ttttattaac
6241 ttgaattgga gctcgaccag ttgaagaacc ttatgtatta attggacaaa ttttaactgt
6301 tgtatatttc ttatattatt tagtaaaccc attaattaca aaatgatgag ataatttatt
6361 aaattaaata gttaatgagc ttgaataagc atatgttttg aaaacataag atagaattta
6421 attttctatt aacttttact aaaaaaaatt cactataata aagaaaataa taaaatttta
6481 aacccaataa aaaataataa ataatttaaa gaaaaagata aaaaacattt tcaagctaaa
6541 tatattaatt tatcataacg aaatcgaggt aaagttcctc gaactcaaat aaaaacaaaa
6601 gaaataaaag ttaattttat ataaattaat aaattaaaca catcacaagg taaaaaaata
6661 acgcaaaata atattcttat aaataaaatt ctcgcatatt cagctataaa aattaaagca
6721 aaaccccctc ttctatattc tacattaaat cctgaaacta attctgattc tccttcagca
6781 aaatcaaaag gattccgatt agtttcagct aatgaaatag atactcaaac taaagctata
6841 ggaaataaaa taattaaaaa tcatatataa acttgataaa aaaaaaaata aattatatta
6901 taacttccaa ttaaaaaaat aaaagataat aaaattaaag ctaaactaac ttcataagaa
6961 atagtctgag ccacagctcg caaacctcct aataaagcat aattagaatt agacgaccaa
7021 ccagctacta taacagtata aacccccaat ctagtacaac ataaaaaaaa taaaccaccc
7081 aaattaaaag aatataattt tacaaaaaaa ggcatacata ttcaaacaaa taatgataaa
7141 aataaagaaa aaattggaga aatataatat cttaaataat tagataataa aggataagtt
7201 tgttcttttg taaataattt aatcgcatca caaaaaggtt gaggaattcc tattaaacca
7261 actttattag gacctttacg aatttgaata tatcctaaaa cttttcgttc taataaagtt
7321 aaaaaagcta cacttactaa tacacaaata attaataata aactaccaat taatgacaaa
7381 ataaattcta tataaaacaa gtactatttg taataaaaat cacatatata aattctaaat
7441 ttattgcact aatctgccaa aatagtttta tattaataat attcttataa aaaatataat
7501 tattttgata tttggtcctt tcgtactaaa atatcataat tttttaaaga tagaaaccaa
7561 cctggcttac accggtttga actcagatca tgtaagaatt taaaagtcga acagacttaa
7621 aatttgaacg gctacaccca aaattatatc ttaatccaac atcgaggtcg caatcttttt
7681 tatcgatatg aactctccaa aaaaattacg ctgttatccc taaagtaact taatttttta
7741 atcattatta atggatcaaa tattcataaa tttatgtttt taaaaaatta aaagtttttt
7801 aaattttaat atcaccccaa taaaatattt ttatttatta aaatttaatt aatctatata
7861 attaaaataa aaaaaaatat aaagatttat agggtcttct cgtcttttaa ataaatttta
7921 gctttttgac taaaaaataa aattctataa aaattttaaa tgaaacagtt aatatttcgt
7981 ccaaccattc attccagcct tcaattaaaa gactaatgat ttagctaacc tttgcacagt
8041 caaaatactg cggcatttaa aattttcagt gggcaggtta gactttatat ataattcaaa
8101 aagacatgtt tttgttaaac aggcgaatat tatttttgcc gaattcttta tttaaacttt
8161 tcatataaat taattttaac attattatat actaatttta tcattattac ttaattttaa
8221 taattaaaac taacatttta ataaataatt aaaatttaat aaataattta atttataaaa
8281 taaattataa cacatttttt aataattgct aattctaagc atatatttat taaatctatt
8341 taatattttt a
//