GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/25/91)
LOCUS DRODMTRN 8351 bp ds-DNA ORG 25-MAY-1991 DEFINITION Drosophila mitochondrial DNA fragment containing 11 tRNA genes, ND genes 1,3 to 6, cytb gene and the 3'-end of 16 S ribosomal RNA ACCESSION Y00610 KEYWORDS 16S ribosomal RNA; COIII gene; ND1 gene; ND3 gene; ND4 gene; ND4L gene; ND5 gene; ND6 gene; cytb gene; cytochrome b; mitochondrial DNA; ribosomal RNA; transfer RNA; transfer RNA-Ala; transfer RNA-Arg; transfer RNA-Asn; transfer RNA-Glu; transfer RNA-Gly; transfer RNA-His; transfer RNA-Leu; transfer RNA-Phe; transfer RNA-Pro; transfer RNA-Ser; transfer RNA-Thr. SOURCE Mitochondrion Drosophila melanogaster DNA. ORGANISM Mitochondrion Drosophila melanogaster Eukaryota; Animalia; Metazoa; Arthropoda; Uniramia; Insecta; Pterygota; Neoptera; Holometabola; Diptera; Brachycera; Cyclorrhapha; Schizophora; Drosophiloidea; Drosophilidae. REFERENCE 1 (bases 1 to 8351) AUTHORS Garesse,R. JOURNAL Unpublished (1988) STANDARD full automatic REFERENCE 2 (bases 1 to 8351) AUTHORS Garesse,R. TITLE Drosophila melanogaster mitochondrial DNA: Gene organization and evolutionary considerations JOURNAL Genetics 118, 649-663 (1988) STANDARD full automatic COMMENT Drosophila mtDNA uses a unique genetic code; i.e., UGA specifies tryptophan instead of termination. AGA appears to specify serine instead of arginine (universal) or termination (vertebrate mtDNA). From EMBL entry MIDMTRN; dated 06-SEP-1990. FEATURES Location/Qualifiers CDS <1..254 /note="COIII gene product (85 AA) (1 is 2nd base in codon)" /codon_start=1 tRNA 276..340 /note="tRNA-Gly" CDS 341..691 /note="ND3 gene product (AA 1-117)" /codon_start=341 tRNA 714..778 /note="tRNA-Ala" tRNA 788..851 /note="tRNA-Arg" tRNA 852..916 /note="tRNA-Asn" tRNA 917..984 /note="tRNA-Ser (agy gene)" tRNA 985..1052 /note="tRNA-Glu" tRNA complement(1070..1134) /note="tRNA-Phe" CDS complement(1136..2857) /note="ND5 gene product (AA 1-574)" /codon_start=2857 tRNA complement(2873..2938) /note="tRNA-His" CDS complement(2940..4277) /note="ND4 gene product (AA 1-446)" /codon_start=4277 CDS complement(4280..4567) /note="ND4l gene product (AA 1-96)" /codon_start=4567 tRNA 4570..4635 /note="tRNA-Thr" tRNA complement(4636..4696) /note="tRNA-Pro" CDS 4703..5224 /note="ND6 gene product (AA 1-174)" /codon_start=4703 CDS 5231..6364 /note="cytochrome b (AA 1-378)" /codon_start=5231 tRNA 6370..6435 /note="tRNA-Ser (ucn gene)" CDS complement(6456..7391) /note="ND1 gene product (AA 1-312)" /codon_start=7391 tRNA 7402..7465 /note="tRNA-Leu (cun gene)" rRNA complement(7466..>8351) /note="16 S ribosomal RNA" BASE COUNT 3554 a 1041 c 714 g 3042 t ORIGIN 1 aagcttatga atatattgaa gctccattta ctattgcaga ctcaatttat ggatcaacat 61 tttttatagc aacaggattc cacggaattc atgtattaat cggaacaact tttttattag 121 tatgtttatt acgacattta aataatcact tctcaaaaaa tcatcatttt ggttttgaag 181 cagctgcatg atattgacat tttgtcgatg tagtttgatt atttttatat atcacaattt 241 actgatgagg aggataatta tattattaat taaatatcta tatagtataa aagtatattt 301 gacttccaat cataaggtct attaattaat agtatagata attttttcta ttatttttat 361 tgctttatta attttactaa ttacaactat tgttatattt ttagcttcaa ttttatcaaa 421 aaaagcttta atcgaccgag aaaaaagatc cccatttgaa tgtggatttg atccaaaatc 481 ttcatctcga ttaccatttt ctttacgttt ttttttaatt actattattt ttttaatttt 541 tgatgtagag attgcattaa ttctacctat aattattatt ataaaatatt ctaatattat 601 aatttgaaca attacttcaa ttatttttat tttaatttta ttaattggat tataccatga 661 atgaaatcaa ggaatattaa attgatcaaa ctaatatata tttatatata tatagggttg 721 tagttaaata taacatttga tttgcattca aaaagtattg aatattcaat ctaccttatt 781 aataactgaa tatgaagcga ttgattgcaa ttagtttcga cctaatctta ggtaattata 841 cccttattct ttaattgaag ccaaaaagag gcatatcact gttaatgata taattgaatt 901 ttaaattcca attaaggaaa tatgatgatc aagtaaaagc tgctaacttt tttcttttaa 961 tggttaaatt ccatttatat ttctatttat atagtttaaa taaaacctta cattttcatt 1021 gtaataataa aatattacat ttttataaat tactaaaatt aattcactat atccaaagat 1081 ttaataatct ccataacatc ttcaatgtca aactctagta taagctattt ggatataaaa 1141 ataataaaat taataaaatt aaaattcaaa atacaaataa taataaataa attttcaaag 1201 aattattatg tattaaaaat aaagttttag aatatataga taatttttga tataaatgtt 1261 gacctccaaa atattctgat caaccttgat caaaactttt tacaactaat tgaccataat 1321 ttaaaggata aaaaattata ccataagttc taatataagg tataaatcat atagacccta 1381 aaaaagttct taaattatat ataaataaag atttatttaa aaaaaataaa tttcttaaag 1441 aaattaaata tccaaataaa ccccctacaa tacatacaaa taatgttaac aattttatat 1501 aaataggtaa acaaattata taaggaaaag gaaaaatcaa tcaatttaat attctacctc 1561 caataattct tataattaat aatcctatta taccacggag tataattcaa ctttcatcat 1621 ttaatatatt caatctaccg caatttaaat caccggttat tgaataataa actaatcgaa 1681 atgaataact aacagttaaa cccgtagaaa aataatataa aaaaaatgaa aacatattaa 1741 catttctaat tctaacaatt tctaaaatta tatccttaga atagaatcca gctaaaaaag 1801 gtattccaca taaagctaaa ttagatacgt taaaacaagc tgaagttaaa ggtatatgaa 1861 ttccaattct taacccccct attaaacgaa tatcttgaga attatttata ttgtgaataa 1921 tagccccagc acatataaac aataatgctt taaataaagc atgagttaat aaatgaaata 1981 tagctaattt taaaaatcct atagacaaaa ttcttattat taaacctaat tgacttaaag 2041 tagataaagc aataattttt tttaaatcaa attcaaaatt agctcctaat ccagctataa 2101 atattgttaa tccagataat aataatatta attgtcctaa ccaagaagtt cttaagataa 2161 tattaaatcg aattaataaa tatacaccag ctgtaactaa tgtagaagaa tgaactaaag 2221 cagaaacagg tgtaggagca gctatagctg caggtaacca agaagaaaaa ggaatctgag 2281 ctcttttagt tatagcagct aatattacta atcttccaat tattaacatt tcaaattcat 2341 tttgtataat ttctaaataa aaaatataat ttcatcttcc ataatttaat attcaagcaa 2401 tagaaagaag taaagctaca tccccaattc gattagataa cgcagttaat ataccagcat 2461 tataagattt aatattttga aaataaatta ctaaacaata agaaacaagt cctaaaccat 2521 ctcaccctaa taaaattcta attaaatttg gtctaataat taacaatatt attgataaaa 2581 caaatattaa tactaatata atgaatcgat taatatgatt gtcatttatt atgtattctt 2641 ttctataaaa aatcactaaa gaagaaatta taagaacaaa agatataaat aataaactta 2701 ttcaatcaaa aagaaaagtt ataacaattc ttatagaatt taaagaaact aattctcact 2761 caataaaata aatcatatca tttaacaaaa aatataaact taataaaaaa catgataaac 2821 ttatagaaat taaattaaca aatctaattc tacaaataga taaatatttc atgatttaaa 2881 atgaatattt tcatatcact aacaccacaa attagtattt tttttaaact atttaaatat 2941 aatcataata taaatgattc tctttttaaa attaataaat ttaaaggcaa tcaatgtaac 3001 aatattaata aatattctcg aattttacct cttctaaatg aatatactcc agaaaataat 3061 ttaccatgct gactaaaaga atataaatat aaagtataag cagctctaaa aaaagataaa 3121 aaagataata aaattataga aattcaagat caagaaacaa ttctatttaa taaagaaatt 3181 tctcctaata aatttaatgt tggaggagct gctatattag ctgatcttaa taaaaatcat 3241 cataaagtta tcgaaggtat aaaatttaat aaacctttat taattaatat tcttcgactt 3301 ccaagacgtt cataagatac attagctaaa caaaataacc cagaagaaca taaaccatga 3361 gcaattatta atgtataaga accacataaa cctcaataag ttatagttaa aagtcctgat 3421 agaacaattc ctatatgagc aacagatgaa taagcaatta aagcctttaa atcagtttga 3481 cgtaaacaaa ctaatctaac taatacacct cctactaatc taattctaat tcaaacaaat 3541 ctatacttca aatttattaa ctgtaaaaaa ctaataactc gtaatattcc ataacctcct 3601 aattttagta taatacctgc taaaattata gacccagaaa ctggagcttc aacatgagct 3661 ttaggtaatc ataaatgaac taaaaatatt ggtattttta ctaaaaaggc acacaataaa 3721 caaaaatata ataaatcata attaaacata aaattattta ttaaataaaa atttattgaa 3781 ccaattttat ttattacata aaaaatacca attaatatag gtaaagaaac taataaagta 3841 taaaataata aatataaacc agcttgtaaa cgttctggct gataacctca acctaaaatt 3901 aaaaataatg taggaattaa tcttctttca aaaaataaat aaaatataaa taatcttatt 3961 cttgaaaaag ttaaaatcaa caataataat aaaataataa tatttaataa aaataaattt 4021 ttataattat tatgtttatt aattatttct ctagctaata atattaatga acaaattcat 4081 aaacttaata aaattaatcc ataagataat atatcacaac ctaaaaaata agaaatttct 4141 gatcaataat ttataaaatt atttattaat aaaaaaataa atctaataaa aaatattata 4201 atttgtacca ttcaatatat attattaata aaacaaaaag gaattaaaaa taataaaaaa 4261 aaaataattt ttaacattat ataattctaa aagattgaaa ataatcatta ccatgagtac 4321 gaattataga aactaaaatt gataaaccta aggccccttc acatactcta aatgtcaaaa 4381 atattattct aaaataactt tcataattta atatatttaa ataaataaat aatataaaaa 4441 ataatattaa aacaataaat tctaaactta aaagtattga aagtaaatgt ttccgattag 4501 aaacaaaaca aaatagccct aaaataaata aaattatagg taaacttcaa tataaaatta 4561 taatcattag ttttaatagt ttaataaaaa cattggtctt gtaaatcaaa aataagatta 4621 tttcttttaa aacttcaaga gaaaagaaat ttctttttca ttaatcccca aaattaatat 4681 tttaaataaa ctacctcttg aaattattca attaatatta tactcattaa ttattactac 4741 ttccattatt tttctaaata taattcatcc attagcttta ggattaactt tattaattca 4801 aacaattttt gtatgtttac taactggatt aataactaaa agtttttgat attcatatat 4861 tttattttta atttttttag gaggaatact tgtattattt atttacgtaa catctttagc 4921 ctctaatgaa atatttaatt tatcaataaa attaactcta ttttcttcat taattttaat 4981 ttttatatta attttatcat ttattataga taaaacttct tcttctttat ttttaataaa 5041 taatgatata caatctatta ttaatataaa ttcttatttt atagaaaatt ctttatcttt 5101 aaataaatta tataattttc ccacaaattt tattacaatt ttattaataa attatttatt 5161 aattacttta attgttattg taaaaattac aaaattattt aaaggaccta ttcgaataat 5221 atcttaatta atgaataaac ctttacgaaa ttcccatcct ctatttaaaa ttgccaataa 5281 tgctttagta gatttaccag ctccaattaa tatttcaaga tgatgaaatt ttggatcatt 5341 acttggatta tgtttaatta ttcaaatttt aaccggatta tttttagcta tacattacac 5401 agctgatatt aatctagctt tctatagtgt taatcatatt tgtcgagacg ttaattatgg 5461 ttgattatta cgaactttac atgctaacgg tgcatcattt ttttttattt gtatttactt 5521 acatgtagga cgaggaattt attacggttc atataaattt actccaactt gattaattgg 5581 agtaattatt ttatttttag taataggaac agcttttata ggatacgtat taccttgagg 5641 acaaatatca ttttgagtag ctactgttat tactaattta ttatacgcta tcccttactt 5701 aggtatagat ttagttcaat gattatgagg tggatttgct gttgataatg ccactttaac 5761 tcgatttttt acattccatt ttattttacc ttttattgtt cttgctataa ctataattca 5821 tttattattc cttcatcaaa caggatctaa taatcctatc ggattaaatt ctaatattga 5881 taaaattcct tttcatcctt attttacatt taaagatatt gtaggattta ttgtaataat 5941 ttttatttta atttcattag tattaattag accaaattta ttgggagacc ctgataactt 6001 ttattcagca aactccttta gtaacactgc ccatattcaa ccagaatgat attttttatt 6061 tgcttatgct attttacgat ctattccaaa taaattagga ggagttattg cattagtttt 6121 atcaattgca attttaataa tccttccttt ttataattta agaaaattcc gagggattca 6181 attttatcct attaatcaag taatattctg atctatatta gtaacagtaa ttttattaac 6241 ttgaattgga gctcgaccag ttgaagaacc ttatgtatta attggacaaa ttttaactgt 6301 tgtatatttc ttatattatt tagtaaaccc attaattaca aaatgatgag ataatttatt 6361 aaattaaata gttaatgagc ttgaataagc atatgttttg aaaacataag atagaattta 6421 attttctatt aacttttact aaaaaaaatt cactataata aagaaaataa taaaatttta 6481 aacccaataa aaaataataa ataatttaaa gaaaaagata aaaaacattt tcaagctaaa 6541 tatattaatt tatcataacg aaatcgaggt aaagttcctc gaactcaaat aaaaacaaaa 6601 gaaataaaag ttaattttat ataaattaat aaattaaaca catcacaagg taaaaaaata 6661 acgcaaaata atattcttat aaataaaatt ctcgcatatt cagctataaa aattaaagca 6721 aaaccccctc ttctatattc tacattaaat cctgaaacta attctgattc tccttcagca 6781 aaatcaaaag gattccgatt agtttcagct aatgaaatag atactcaaac taaagctata 6841 ggaaataaaa taattaaaaa tcatatataa acttgataaa aaaaaaaata aattatatta 6901 taacttccaa ttaaaaaaat aaaagataat aaaattaaag ctaaactaac ttcataagaa 6961 atagtctgag ccacagctcg caaacctcct aataaagcat aattagaatt agacgaccaa 7021 ccagctacta taacagtata aacccccaat ctagtacaac ataaaaaaaa taaaccaccc 7081 aaattaaaag aatataattt tacaaaaaaa ggcatacata ttcaaacaaa taatgataaa 7141 aataaagaaa aaattggaga aatataatat cttaaataat tagataataa aggataagtt 7201 tgttcttttg taaataattt aatcgcatca caaaaaggtt gaggaattcc tattaaacca 7261 actttattag gacctttacg aatttgaata tatcctaaaa cttttcgttc taataaagtt 7321 aaaaaagcta cacttactaa tacacaaata attaataata aactaccaat taatgacaaa 7381 ataaattcta tataaaacaa gtactatttg taataaaaat cacatatata aattctaaat 7441 ttattgcact aatctgccaa aatagtttta tattaataat attcttataa aaaatataat 7501 tattttgata tttggtcctt tcgtactaaa atatcataat tttttaaaga tagaaaccaa 7561 cctggcttac accggtttga actcagatca tgtaagaatt taaaagtcga acagacttaa 7621 aatttgaacg gctacaccca aaattatatc ttaatccaac atcgaggtcg caatcttttt 7681 tatcgatatg aactctccaa aaaaattacg ctgttatccc taaagtaact taatttttta 7741 atcattatta atggatcaaa tattcataaa tttatgtttt taaaaaatta aaagtttttt 7801 aaattttaat atcaccccaa taaaatattt ttatttatta aaatttaatt aatctatata 7861 attaaaataa aaaaaaatat aaagatttat agggtcttct cgtcttttaa ataaatttta 7921 gctttttgac taaaaaataa aattctataa aaattttaaa tgaaacagtt aatatttcgt 7981 ccaaccattc attccagcct tcaattaaaa gactaatgat ttagctaacc tttgcacagt 8041 caaaatactg cggcatttaa aattttcagt gggcaggtta gactttatat ataattcaaa 8101 aagacatgtt tttgttaaac aggcgaatat tatttttgcc gaattcttta tttaaacttt 8161 tcatataaat taattttaac attattatat actaatttta tcattattac ttaattttaa 8221 taattaaaac taacatttta ataaataatt aaaatttaat aaataattta atttataaaa 8281 taaattataa cacatttttt aataattgct aattctaagc atatatttat taaatctatt 8341 taatattttt a //