[bionet.molbio.genbank.updates] oxi3 locus in yeast mitochondrion

GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/25/91)

LOCUS       YSCSC13     10168 bp ds-DNA             ORG       25-MAY-1991
DEFINITION  oxi3 locus in yeast mitochondrion (strain D273-10B) (codes for
            cytochrome oxidase subunit 1).
ACCESSION   V00694
KEYWORDS    cytochrome oxidase.
SOURCE      Mitochondrion Saccharomyces cerevisiae DNA.
  ORGANISM  Mitochondrion Saccharomyces cerevisiae
            Eukaryota; Plantae; Thallobionta; Eumycota; Hemiascomycetes;
            Endomycetales; Saccharomycetaceae.
REFERENCE   1  (bases 1 to 10168)
  AUTHORS   Bonitz,S.G., Coruzzi,G., Thalenfeld,B.E., Tzagoloff,A. and
            Macino,G.
  TITLE     Assembly of the mitochondrial membrane system. Structure and
            nucleotide sequence of the gene coding for subunit 1 of yeast
            cytochrome oxidase
  JOURNAL   J. Biol. Chem. 255, 11927-11941 (1980)
  STANDARD  full automatic
COMMENT     From EMBL    entry MISC13;  dated 03-JAN-1991.
FEATURES             Location/Qualifiers
     CDS             join(127..294,2746..2781,5294..5332,6847..7323,8334..8744,
                     9632..9934,9956..9985,10031..10102)
                     /product="cytochrome oxidase"
                     /codon_start=127
     intron          295..2745
                     /note="intron 1"
     CDS             295..2628
                     /note="inside intron 1"
                     /codon_start=295
     CDS             2731..2745
                     /note="inside intron 1"
                     /codon_start=2731
     intron          2782..5293
                     /note="intron 2"
     CDS             2782..5136
                     /note="reading frame (inside intron 2)"
                     /codon_start=2782
     CDS             5201..5293
                     /note="reading frame (inside intron 2)"
                     /codon_start=5201
     intron          5333..6846
                     /note="intron 3"
     CDS             5333..6334
                     /note="reading frame (inside intron 3)"
                     /codon_start=5333
     CDS             6823..6846
                     /note="reading frame (inside intron 3)"
                     /codon_start=6823
     intron          7324..8333
                     /note="intron 4"
     CDS             7324..8271
                     /note="reading frame (inside intron 4)"
                     /codon_start=7324
     CDS             8295..8333
                     /note="reading frame (inside intron 4)"
                     /codon_start=8295
     intron          8745..9632
                     /note="intron 5"
     CDS             8745..8765
                     /note="reading frame (inside intron 5)"
                     /codon_start=8745
     CDS             9548..9631
                     /note="reading frame (inside intron 5)"
                     /codon_start=9548
     intron          9935..9955
                     /note="intron 6"
     CDS             9935..9955
                     /note="reading frame (inside intron 6)"
                     /codon_start=9935
     intron          9986..10030
                     /note="intron 7"
     CDS             9986..10030
                     /note="reading frame (inside intron 7)"
                     /codon_start=9986
BASE COUNT     4028 a   1082 c   1448 g   3610 t
ORIGIN
        1 ttattatcct ttaagatata acaataatta tttaaattaa attaaattaa atttaattaa
       61 tttttttttt taatgaatat aataataata atattattaa aattaatata taaaaaaaaa
      121 gtaaaaatgg tacaaagatg attatattca acaaatgcaa aagatattgc agtattatat
      181 tttatgttag ctatttttag tggtatggca ggaacagcaa tgtctttaat cattagatta
      241 gaattagctg cacctggttc acaatattta catggtaatt cacaattatt taatggtgcg
      301 cctctcagtg cgtatatttc gttgatgcgt ctagcattag tattatgaat catcaataga
      361 tacttaaaac atatgactaa ctcagtaggg gctaacttta cggggacaat agcatgtcat
      421 aaaacaccta tgattagtgt aggtggagtt aagtgttaca tggttaggtt aacgaacaac
      481 ttacaagtct ttatcaggat tacaatttcc tcttatcatt tggatatagt aaaacaagtt
      541 tgattatttt acgttgaggt aatcagatta tgattcattg ttttagatag cacaggcagt
      601 gtgaaaaaga tgaaggacct aaataacaca aaaggaaata cgaaaagtga gggatcaact
      661 gaaagaggaa actctggagt tgacagaggt atagtagtac cgaatactca aataaaaatg
      721 agatttttaa atcaagttag atactattca gtaaataata atttaaaaat agggaaggat
      781 accaatattg agttatcaaa agatacaagt acttcggact tgttagaatt tgagaaatta
      841 gtaatagata atataaatga ggaaaatata aataataatt tattaagtat tataaaaaac
      901 gtagatatat taatattagc atataataga attaagagta aacctggtaa tataactcca
      961 ggtacaacat tagaaacatt agatggtata aatataatat atttaaataa attatcaaat
     1021 gaattaggaa caggtaaatt caaatttaaa cccatgagaa tagttaatat tcctaaacct
     1081 aaaggtggta taagaccttt aagtgtaggt aatccaagag ataaaattgt acaagaagtt
     1141 ataagaataa ttttagatac aatttttgat aaaaagatat caacacattc acatggtttt
     1201 agaaagaata taagttgtca aacagcaatt tgagaagtta gaaatatatt tggtggaagt
     1261 aattgattta ttgaagtaga cttaaaaaaa tgttttgata caatttctca tgatttaatt
     1321 attaaagaat taaaaagata tatttcagat aaaggtttta ttgatttagt atataaatta
     1381 ttaagagctg gttatattga tgagaaagga acttatcata aacctatatt aggtttacct
     1441 caaggatcat taattagtcc tatcttatgt aatattgtaa taacattggt agataattga
     1501 ttagaagatt atattaattt atataataaa ggtaaagtta aaaaacaaca tcctacatat
     1561 aaaaaattat caagaataat tgcaaaagct aaaatatttt cgacaagatt aaaattacat
     1621 aaagaaagag ctaaaggccc actatttatt tataatgatc ctaatttcaa gagaataaaa
     1681 tacgttagat atgcagatga tattttaatt ggggtattag gttcaaaaaa tgattgtaaa
     1741 ataatcaaaa gagatttaaa caatttttta aattcattag gtttaactat aaatgaagaa
     1801 aaaactttaa ttacttgtgc aactgaacta ccagcaagat ttttaggtta taatatttca
     1861 attacacctt taaaaagaat acctacagtt actaaactaa ttagaggtaa acttattaga
     1921 agtagaaata caactagacc tattattaat gcaccaatta gagatattat caataaatta
     1981 gctactaatg gatattgtaa gcataataaa aatggtagaa taggagtgcc tacaagagta
     2041 ggtagatgac tatatgaaga acctagaaca attattaata attataaagc gttaggtaga
     2101 ggtatcttaa attattataa attagctact aattataaaa gattaagaga aagaatctat
     2161 tacgtattat attattcatg tgtattaact ttagctagta aatatagatt aaaaacaata
     2221 agtaaaacta ttaaaaaatt tggttataat ttaaatatta ttgaaaatga taaattaatt
     2281 gccaattttc caagaaatac ttttgataat atcaaaaaaa ttgaaaatca tggtatattt
     2341 atatatatat cagaagctaa agtaactgat ccttttgaat atatcgattc aattaaatat
     2401 atattaccta cagctaaagc taattttaat aaaccttgta gtatttgtaa ttcaactatt
     2461 gatgtagaaa tacatcatgt taaacaatta catagaggta tattaaaagc acttaaagat
     2521 tatattctag gtagaataat taccataaac agaaaacaaa ttccattatg taaacaatgt
     2581 catattaaaa cacataaaaa taaatttaaa aatataggac ctggtatata aaatctatta
     2641 ttaatgatac tcaatatgga aagccgtatg atgggaaact atcacgtacg gtttgggaaa
     2701 ggctctttaa cacgtggcaa cataggttaa tttgctattt catttttagt agttggtcat
     2761 gctgtattaa tgattttctg tgcgccgttt cgcttaattt atcactgtat tgaagtgtta
     2821 attgataaac atatctctgt ttattcaatt aatgaaaact ttaccgtatc attttggttc
     2881 tgattattag tagtaacata catagtattt agatacgtaa accatatggc ttacccagtt
     2941 ggggccaact caacggggac aatagcatgc cataaaagcg ctggagtaaa acagccagcg
     3001 caaggtaaga actgtccgat ggctaggtta acgaattcct gtaaagaatg tttagggttc
     3061 tcattaactc cttcccactt ggggattgtg attcatgctt atgtattgga agaagaggta
     3121 cacgagttaa ccaaaaatga atcattagct ttaagtaaaa gttgacattt ggagggctgt
     3181 acgagttcaa atggaaaatt aagaaatacg ggattgtccg aaaggggaaa ccctggggat
     3241 aacggagtct tcatagtacc caaatttaat ttaaataaag cgagatactt tagtacttta
     3301 tctaaattaa atgcaaggaa ggaagacagt ttagcgtatt taacaaagat taatactacg
     3361 gatttttccg agttaaataa attaatagaa aataatcata ataaacttga aaccattaat
     3421 actagaattt taaaattaat gtcagatatt agaatgttat taattgctta taataaaatt
     3481 aaaagtaaga aaggtaatat atctaaaggt tctaataata ttaccttaga tgggattaat
     3541 atttcatatt taaataaatt atctaaagat attaacacta atatgtttaa attttctccg
     3601 gttagaagag ttgaaattcc taaaacatct ggaggattta gacctttaag tgttggaaat
     3661 cctagagaaa aaattgtaca agaaagtatg agaataatat tagaaattat ctataataat
     3721 agtttctctt attattctca tggatttaga cctaacttat cttgtttaac agctattatt
     3781 caatgtaaaa attatatgca atactgtaat tgatttatta aagtagattt aaataaatgc
     3841 tttgatacaa ttccacataa tatgttaatt aatgtattaa atgagagaat caaagataaa
     3901 ggtttcatag acttattata taaattatta agagctggat atgttgataa aaataataat
     3961 tatcataata caactttagg aattcctcaa ggtagtgttg tcagtcctat tttatgtaat
     4021 atttttttag ataaattaga taaatattta gaaaataaat ttgagaatga attcaatact
     4081 ggaaatatgt ctaatagagg tagaaatcca atttataata gtttatcatc taaaatttat
     4141 agatgtaaat tattatctga aaaattaaaa ttgattagat taagagacca ttaccaaaga
     4201 aatatgggat ccgataaaag ttttaaaaga gcttattttg ttagatatgc tgatgatatt
     4261 atcattggtg taatgggttc tcataatgat tgtaaaaata ttttaaacga tattaataac
     4321 ttcttaaaag aaaatttagg tatgtcaatt aatatagata aatccgttat taaacattct
     4381 aaagaaggag ttagtttttt agggtatgat gtaaaagtta caccttgaga aaaaagacct
     4441 tatagaatga ttaaaaaagg tgataatttt attagggtta gacatcatac tagtttagtt
     4501 gttaatgccc ctattagaag tattgtaata aaattaaata aacatggcta ttgttctcat
     4561 ggtattttag gaaaacccag aggggttgga agattaattc atgaagaaat gaaaaccatt
     4621 ttaatgcatt acttagctgt tggtagaggt attataaact attatagatt agctaccaat
     4681 tttaccacat taagaggtag aattacatac attttatttt attcatgttg tttaacatta
     4741 gcaagtaaat ttaaattaaa tactgttaag aaagttattt taaaattcgg taaagtatta
     4801 gttgatcctc attcaaaagt tagttttagt attgatgatt ttaaaattag acataaaata
     4861 aatataactg attctaatta tacacctgat gaaattttag atagatataa atatatgtta
     4921 cctagatctt tatcattatt tagtggtatt tgtcaaattt gtggttctaa acatgattta
     4981 gaagtacatc acgtaagaac attaaataat gctgccaata aaattaaaga tgattattta
     5041 ttaggtagaa tgattaagat aaatagaaaa caaattacta tctgtaaaac atgtcatttt
     5101 aaagttcatc aaggtaaata taatggtcca ggtttataat aattattata ctccttcggg
     5161 gtcgccgcgg gggcgggccg gactattaaa tatgcgttaa atggagagcc gtatgatatg
     5221 aaagtatcac gtacggttcg gagagggctc ttttatatga atgttattac attcagatag
     5281 gtttgctact ctactcttag taatgcctgc tttaattgga ggttttggta accaaaaaag
     5341 atatgaaagt aataataata ataatcaagt aatagaaaat aaagaatata atttaaaatt
     5401 aaattatgat aagttgggac cttatttagc tggattaatt gaaggtgatg gatctattct
     5461 agttcaaaat tcatcttcaa taaaaaaatc taaatataga ccgttaattg ttgtagtatt
     5521 taaattagaa gatttagaat tagctaatta tttatgtaat ttaactaaat gtggaaaagt
     5581 gtataaaaaa attaatcgta attatgtatt atgacctatt catgatttaa aaggtgtata
     5641 tacattatta aatattatta atggatatat gagaacacct aaatatggag catttgttag
     5701 aggtgctgaa tttataaata attatattaa ttcaaccaac caactacata ataaattaaa
     5761 aaatatagat aatattaaaa ttaaaccatt agatacatca gatattggtt caaacgcttg
     5821 attagctatc ttgacagatg cagatggtaa tttttctatt aatttaataa atggtaaaaa
     5881 tcgttctagt aggacaatgc cttattattg tttagaatta agacaaaatt atcaaaaaat
     5941 ttctaataat aataatatta atttttctta tttttatatt atgtctgcaa ttgcactata
     6001 ttttaatgtt aatttatata gtagagaacg taatttaaat ttattagtat ctcttaataa
     6061 tacgtataaa ctatattata gttataaagt aatagtggct aatctatata aaaatattaa
     6121 agtaatagaa tactttaata aatattcttt attatcatct aaacacttag attttttaga
     6181 ttgatctaaa ttagttattt taattaataa tgagggtcaa agtataaatc ttaatggtag
     6241 ttgagaatta ggtataaatt tacgtaaaga ttataataaa actagaacta cgtttacttg
     6301 atctcattta aaaaatacat atttagaaaa taaataaata aattattatt actttcttcc
     6361 cctccgaatc cgtaatatat ttacggatat ataatctcgt agtgtaaaag gtgtaacgag
     6421 attattaata agatgccgta atatattgta aaatatatta ttattacaac actatatgcg
     6481 ggaaaaccct aaagtcataa tataatatta tccccacgag ggccacacat gtgtggcctc
     6541 gcggggtttg gtaaatttaa ttaagttata aatgtactat agtattaaaa attattatga
     6601 ataatttccc cacccccatg cgaagcatgg gggggggtat aagtatggac aatccgcagg
     6661 aaaccaaata ataattaata tcctgaacaa agtaagtgaa ggagatatct taaaatatat
     6721 ataatatata ttttataaat tattatgtag gatcctcaga gactacacgt gttgcaccca
     6781 ttatattatg tataatgggt tgaagatata gtccaaatat aattgaaaga ttataataaa
     6841 atgaactatt tattaccatt aataattgga gctacagata cagcatttcc aagaattaat
     6901 aacattgctt tttgagtatt acctatgggg ttagtatgtt tagttacatc aactttagta
     6961 gaatcaggtg ctggtacagg gtgaactgtc tatccaccat tatcatctat tcaggcacat
     7021 tcaggaccta gtgtagattt agcaattttt gcattacatt taacatcaat ttcatcatta
     7081 ttaggtgcta ttaatttcat tgtaacaaca ttaaatatga gaacaaatgg tatgacaatg
     7141 cataaattac cattatttgt atgatcaatt ttcattacag cgttcttatt attattatca
     7201 ttacctgtat tatctgctgg tattacaatg ttattattag atagaaactt caatacttca
     7261 ttctttgaag tagcaggagg tggtgaccca atcttatacg agcatttatt ttgattcttt
     7321 ggtcaaacag tggcccttat tattatatta ataatatata atgatatgca tttttctaaa
     7381 tgctggaaat tattaaaaaa atgaattaca aatattataa gtctattatt taaagcctta
     7441 tttgtaaaaa tattcatatc ttataataat cagcaggata agataataaa taatcttata
     7501 ttaaaaaaag ataatattaa aagatcctca gagactacaa gaaaaatatt aaataattca
     7561 ataaataaaa aatttaatca atgattagct ggattaattg atggtgatgg atattttggt
     7621 attgtaagta agaaatatgt atcattagaa attctagtag cattagaaga tgaaatagct
     7681 ttaaaagaaa ttcaaaataa atttggtggt tctattaaat taagatcagg tgtaaaagct
     7741 attagatata gattacttaa taaaactggt ataattaaat taattaatgc agttaatggt
     7801 aatattagaa atactaaaag attagtacaa tttaataaag tttgtatttt attaggtatt
     7861 gattttattt atccaattaa attaactaaa gataatagtt gatttgttgg attttttgat
     7921 gctgatggta caattaatta ttcatttaaa aataatcatc ctcaattaac aaaaactgta
     7981 actaataaat atttacaaga tgtacaagaa tataaaaata ttttaggtgg taatatttat
     8041 tttgataaat cacaaaatgg ttattataaa tgatccattc aatcaaaaga tatagtatta
     8101 aattttatta atgattatat taaaataaat ccatcaagaa cactaaaaat aaataaatta
     8161 tatttaagta aagaatttta taatttaaaa gaattaaaag cttataataa atcttctgat
     8221 tcaatacaat ataaagcatg attaaatttt gaaaataaat gaaaaaataa ataaattatt
     8281 taataaagat atagtccaaa ttatatatat ataatatata tatatataac aagcaccctg
     8341 aagtatatat tttaattatt cctggatttg gtattatttc acatgtagta tcaacatatt
     8401 ctaaaaaacc tgtatttggt gaaatttcaa tggtatatgc tatggcttca attggattat
     8461 taggattctt agtatgatca catcatatgt atattgtagg attagatgca gatactagag
     8521 catatttcct atccgcactg atgattattg caattccaac aggaattaaa atcttttctt
     8581 gattagccct gatctacggt ggttcaatta gattagcact acctatgtta tatgcaattg
     8641 cattcttatt cttattcaca atgggtggtt taactggtgt tgccttagct aacgcctcat
     8701 tagatgtggc attccacgat acttactacg tggtgggaca ttttcgagcg gtctgaaagt
     8761 tatcataaat aatatttacc atataataat ggataaatta tatttttatc aatataagtc
     8821 taattacaag tgtattaaaa tggtaacata aatatgctaa gctgtaatga caaaagtatc
     8881 catattcttg acagttattt tatattataa aaaaaagatg aaggaacttt gactgatcta
     8941 atatgctcaa cgaaagtgaa tcaaatgtta taaaattact tacaccacta attgaaaacc
     9001 tgtctgatat tcaattatta tttattatta tataattata taataataaa taaaatggtt
     9061 gatgttatgt attggaaatg agcatacgat aaatcatata accattagta atataatttg
     9121 agagctaagt tagatattta cgtatttatg ataaaacaga ataaacccta taaattatta
     9181 ttattaataa taaaaaataa taataatacc aatatatata ttatttaatt tattattatt
     9241 atattaataa aatttaatat atattataaa taattattgg attaagaaat ataatatttt
     9301 atagaaattt tctttatatt tagagggtaa aagattgtat aaaaagctaa tgccatattg
     9361 taatgatatg gataagaatt attattctaa agatgaaaat ctgctaactt atactatagg
     9421 tgatatgcct atctttattt atatatatat tattattatt aataataaaa aaaaattaaa
     9481 aaagatagga ggtttatata taactgataa atatttatta tattattttt tttataataa
     9541 atattaaaag atattgcgtg agccgtatgc gatgaaagtc gcacgtacgg ttcttaccgg
     9601 gggaaaactt gtaaaggtct acctatcggg atactatgta ttatcaatgg gtgctatttt
     9661 ctctttattt gcaggatact actattgaag tcctcaaatt ttaggtttaa actataatga
     9721 aaaattagct caaattcaat tctgattaat tttcattggg gctaatgtta ttttcttccc
     9781 aatgcatttc ttaggtatta atggtatgcc tagaagaatt cctgattatc ctgatgcttt
     9841 cgcaggatga aattatgtcg cttctattgg ttcattcatt gcactattat cattattctt
     9901 atttatctat attttatatg atcaattagt taatggatta aataataaag ttaataataa
     9961 atcagttatt tatgctaaag cacccgattt tgtagaatct aatcttatct ttaatttaaa
    10021 tacagttaaa tcttcatcta tcgaattctt attaacttct ccaccagctg tacactcatt
    10081 taatacacca gctgtacaat cttaagtttt aaaatttaat tatttactta ataattaaaa
    10141 aaaaaaagta aatattatat ctaaaact
//