GenBank-Updates@genbank.bio.net (05/27/91)
LOCUS CLONTTD 3952 bp ds-DNA BCT 27-MAY-1991 DEFINITION Clostridium botulinum gene for neurotoxin type D ACCESSION X54254 KEYWORDS neurotoxin; neurotoxin type D. SOURCE Clostridium botulinum DNA. ORGANISM Clostridium botulinum Prokaryota; Bacteria; Firmicutes; Endospore-forming rods and cocci; Bacillaceae. REFERENCE 1 (bases 1 to 3952) AUTHORS Niemann,H. JOURNAL Unpublished (1990) STANDARD full automatic REFERENCE 2 (sites) AUTHORS Binz,T., Kurazono,H., Popoff,M.R., Eklund,M.W., Sakaguchi,G., Kozaki,S., Krieglstein,K., Henschen,A., Gill,D.M. and Niemann,H. TITLE Nucleotide sequence of the gene encoding Clostridium botulinum neurotoxin type D JOURNAL Nucleic Acids Res. 18, 5556-5556 (1990) STANDARD full staff_review COMMENT *source: strain=BVD/-3; From EMBL entry CBNTTD; dated 04-OCT-1990. FEATURES Location/Qualifiers RBS 31..35 /note="ribosome binding site" CDS 47..3874 /note="neurotoxin type D" /codon_start=47 BASE COUNT 1597 a 398 c 610 g 1347 t ORIGIN 1 aaggtgcaca cttgtggata ttagaaagtt aggagatgtt agtattatga catggccagt 61 aaaagatttt aattatagtg atcctgttaa tgacaatgat atattatatt taagaatacc 121 acaaaataag ttaattacta cacctgtaaa agcttttatg attactcaaa atatttgggt 181 aataccagaa agattttcat cagatactaa tccaagttta agtaaaccgc ccagacctac 241 ttcaaagtat caaagttatt atgatcctag ttatttatct actgatgaac aaaaagatac 301 atttttaaaa gggattataa aattatttaa aagaattaat gaaagagata taggaaaaaa 361 attaataaat tatttagtag ttggttcacc ttttatggga gattcaagta cgcctgaaga 421 tacatttgat tttacacgtc atactactaa tattgcagtt gaaaagtttg aaaatggtag 481 ttggaaagta acaaatatta taacaccaag tgtattgata tttggaccac ttcctaatat 541 attagactat acagcatccc ttacattgca aggacaacaa tcaaatccat catttgaagg 601 gtttggaaca ttatctatac taaaagtagc acctgaattt ttgttaacat ttagtgatgt 661 aacatctaat caaagttcag ctgtattagg caaatctata ttttgtatgg atccagtaat 721 agctttaatg catgagttaa cacattcttt gcatcaatta tatggaataa atataccatc 781 tgataaaagg attcgtccac aagttagcga gggatttttc tctcaagatg gacccaacgt 841 acaatttgag gaattatata catttggagg attagatgtt gaaataatac ctcaaattga 901 aagatcacaa ttaagagaaa aagcattagg tcactataaa gatatagcga aaagacttaa 961 taatattaat aaaactattc cttctagttg gattagtaat atagataaat ataaaaaaat 1021 attttctgaa aagtataatt ttgataaaga taatacagga aattttgttg taaatattga 1081 taaattcaat agcttatatt cagacttgac taatgttatg tcagaagttg tttattcttc 1141 gcaatataat gttaaaaaca ggactcatta tttttcaagg cattatctac ctgtatttgc 1201 aaatatatta gatgataata tttatactat aagagatggt tttaatttaa caaataaagg 1261 ttttaatata gaaaattcgg gtcagaatat agaaaggaat cctgcactac aaaagcttag 1321 ttcagaaagt gtagtagatt tatttacaaa agtatgttta agattaacaa aaaatagtag 1381 agatgattca acatgtatta aagttaaaaa taatagatta ccttatgtag ctgataaaga 1441 tagcatttca caagaaatat ttgaaaataa aattattaca gatgagacta atgtacaaaa 1501 ttattcagat aaattttcat tagatgaatc tattttagat gggcaagttc ctattaatcc 1561 tgaaatagta gatccactat tacccaatgt taatatggaa cctttaaatc ttccaggtga 1621 agaaatagta ttttatgatg atattactaa atatgttgat tatttaaatt cttattatta 1681 tttggaatct caaaaattaa gtaataatgt tgaaaatatt actcttacaa cttcagttga 1741 agaagcatta ggttatagca ataagatata cacattttta cctagcttag ctgaaaaagt 1801 gaataaaggt gttcaagcag gtttattctt aaattgggcg aatgaagtag ttgaggattt 1861 tactacaaat attatgaaga aagatacatt ggataaaata tcagatgtat cagtaataat 1921 tccatatata ggacctgcct taaatatagg aaattcagca ttaaggggaa attttaatca 1981 agcatttgca acagctggtg tagctttttt attagaggga tttccagagt ttactatacc 2041 tgcactcggt gtatttacct tttatagttc tattcaagaa agagagaaaa ttattaaaac 2101 tatagaaaat tgtttggaac aaagagttaa gagatggaaa gattcatatc aatggatggt 2161 atcaaattgg ttgtcaagaa ttactactca atttaatcat ataaattatc aaatgtatga 2221 ttctttaagt tatcaggcag atgcaatcaa agctaaaata gatttagaat ataaaaaata 2281 ctcaggaagt gataaagaaa atataaaaag tcaagttgaa aatttaaaaa atagtttaga 2341 tgtaaaaatt tcggaagcaa tgaataatat aaataaattt atacgagaat gttctgtaac 2401 atacttattt aaaaatatgc tccctaaagt aattgacgaa ttaaataagt ttgatttaag 2461 aactaaaaca gaattaatta atcttataga tagtcataat attattctag ttggtgaagt 2521 agatagatta aaagcaaaag taaatgagag ttttgaaaat acaatgcctt ttaatatttt 2581 ttcatatact aataattctt tattaaaaga tataattaat gaatatttca atagtattaa 2641 tgattcaaaa attttgagct tacaaaacaa aaaaaatgct ttagtggata catcaggata 2701 taatgcagaa gtgagggtag gagataatgt tcaacttaat acgatatata caaatgactt 2761 taaattaagt agttcaggag ataaaattat agtaaattta aataataata ttttatatag 2821 cgctatttat gagaactcta gtgttagttt ttggattaag atatctaaag atttaactaa 2881 ttctcataat gaatatacaa taattaacag tatagaacaa aattctgggt ggaaattatg 2941 tattaggaat ggcaatatag aatggatttt acaagatgtt aatagaaagt ataaaagttt 3001 aatttttgat tatagtgaat cattaagtca tacaggatat acaaataaat ggttttttgt 3061 tactataact aataatataa tggggtatat gaaactttat ataaatggag aattaaagca 3121 gagtcaaaaa attgaagatt tagatgaggt taagttagat aaaaccatag tatttggaat 3181 agatgagaat atagatgaga atcagatgct ttggattaga gattttaata ttttttctaa 3241 agaattaagt aatgaagata ttaatattgt atatgaggga caaatattaa gaaatgttat 3301 taaagattat tggggaaatc ctttgaagtt tgatacagaa tattatatta ttaatgataa 3361 ttatatagat aggtatatag cacctgaaag taatgtactt gtacttgttc agtatccaga 3421 tagatctaaa ttatatactg gaaatcctat tactattaaa tcagtatctg ataagaatcc 3481 ttatagtaga attttaaatg gagataatat aattcttcat atgttatata atagtaggaa 3541 atatatgata ataagagata ctgatacaat atatgcaaca caaggaggag agtgttcaca 3601 aaattgtgta tatgcattaa aattacagag taatttaggt aattatggta taggtatatt 3661 tagtataaaa aatattgtat ctaaaaataa atattgtagt caaattttct ctagttttag 3721 ggaaaataca atgcttctag cagatatata taaaccttgg agattttctt ttaaaaatgc 3781 atacacgcca gttgcagtaa ctaattatga aacaaaacta ttatcaactt catctttttg 3841 gaaatttatt tctagggatc caggatgggt agagtaatac aataaaaatt taatataaac 3901 tattaaatta tattacaagt tttagaaatt tatcgtataa aatgttgaat tc //